LTBP1 (ген)

LTBP1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1KSQ

Идентификаторы

Псевдонимы

LTBP1 , латентный трансформирующий бета-связывающий белок 1 фактора роста

Внешние идентификаторы

OMIM: 150390 MGI: 109151 HomoloGene: 522 GeneCard: LTBP1

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 2 (человека) ^[1]

Группа	2п22.3	Начинать	32 946 953 п.н. ^[1]
Группа	2п22.3	Конец	33 399 509 п.н. ^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 17 (мышь) ^[2]

Группа	17 \| 17 E2	Начинать	75 005 568 п.н. ^[2]
Группа	17 \| 17 E2	Конец	75 392 512 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание белка • иона кальция связывание • превращение беты-рецептор , активируемой активность фактор роста • связывания фактора роста • связывание микрофибриллы • трансформирующего фактора роста бета связывание • внеклеточный матрикс структурная составляющей
Сотовый компонент	• внеклеточный матрикс • микрофибрилла • внеклеточный • просвет эндоплазматического ретикулума • внеклеточная область • макромолекулярный комплекс • внеклеточный матрикс, содержащий коллаген
Биологический процесс	• развитие межжелудочковой перегородки • секвестрация TGFbeta во внеклеточном матриксе • развитие коронарной сосудистой сети • развитие аорты • сигнальный путь трансмембранного рецепторного белка серин / треонинкиназы • посттрансляционная модификация • процесс метаболизма клеточного белка • регуляция бета-активации трансформирующего фактора роста
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


4052


268977

Ансамбль


ENSG00000049323


ENSMUSG00000001870

UniProt


Q14766


Q8CG19

RefSeq (мРНК)


NM_000627 NM_001166264 NM_001166265 NM_001166266 NM_206943

NM_019919 NM_206958 NM_001331233 NM_001331234 NM_001331235
NM_001331236 NM_001331237

RefSeq (белок)


NP_000618 NP_001159736 NP_001159737 NP_001159738 NP_996826

NP_001318162 NP_001318163 NP_001318164 NP_001318165 NP_001318166
NP_064303 NP_996841

Расположение (UCSC)

Chr 2: 32,95 - 33,4 Мб

Chr 17: 75.01 - 75.39 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Латентный-трансформирующий фактор роста бета-связывающего белка 1 представляет собой белок , который у человека кодируется LTBP1 гена . ^[5]^[6]^[7]

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству латентных белков, связывающих TGF-бета (LTBP). Секреция и активация TGF-бета регулируется их ассоциацией с белками, ассоциированными с латентностью, и с латентными белками, связывающими TGF-бета. Продукт этого гена нацелен на латентные комплексы трансформирующего фактора роста бета во внеклеточный матрикс, где латентный цитокин впоследствии активируется несколькими различными механизмами. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы. ^[7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что LTBP1 (ген) взаимодействует с TGF beta 1 . ^[8]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000049323 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001870 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Канзаки Т, Олофссон А, Морены А, Вернштедт С, Хеллман U, Miyazono К, Клаэссон-валлийский л, Heldin СН (июль 1990 года). «Связывающий белок TGF-бета 1: компонент большого латентного комплекса TGF-бета 1 с множественными повторяющимися последовательностями». Cell . 61 (6): 1051–1061. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (90) 90069-Q . PMID 2350783 . S2CID 54376541 .
^ Oklu R, Hesketh R (январь 2001). «Семейство латентных трансформирующих бета-связывающих белков фактора роста (LTBP)» . Biochem J . 352 (3): 601–10. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3520601 . PMC 1221494 . PMID 11104663 .
^ а б «Ген Entrez: LTBP1 латентный трансформирующий фактор роста бета-связывающий белок 1» .
^ Saharinen, J; Кески-Оя Дж (август 2000 г.). «Мотив специфической последовательности 8-Cys повторов TGF-бета-связывающих белков, LTBP, создает поверхность гидрофобного взаимодействия для связывания небольшого латентного TGF-бета» . Мол. Биол. Cell . 11 (8): 2691–704. DOI : 10.1091 / mbc.11.8.2691 . ISSN 1059-1524 . PMC 14949 . PMID 10930463 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Сахаринен Дж., Хюйтияйнен М., Тайпале Дж., Кески-Оя Дж. (2000). «Скрытые трансформирующие белки, связывающие фактор роста-бета (LTBP) - структурные белки внеклеточного матрикса для нацеливания на действие TGF-бета». Цитокина фактора роста Rev . 10 (2): 99–117. DOI : 10.1016 / S1359-6101 (99) 00010-6 . PMID 10743502 .
Keski-Oja J, Koli K, von Melchner H (2005). «Активация TGF-бета тракцией?». Trends Cell Biol . 14 (12): 657–659. DOI : 10.1016 / j.tcb.2004.10.003 . PMID 15564041 .
Стенман Г., Сахлин П., Олофссон А. и др. (1994). «Отнесение гена, кодирующего латентный TGF-бета 1-связывающий белок (LTBP1) к хромосоме 2 человека, область p12 → q22». Cytogenet. Cell Genet . 66 (2): 117–119. DOI : 10.1159 / 000133680 . PMID 8287682 .
Олофссон А., Итиджо Х., Морен А. и др. (1996). «Эффективная ассоциация удлиненной на амино-конце формы человеческого латентного трансформирующего белка, связывающего бета-фактор роста, с внеклеточным матриксом» . J. Biol. Chem . 270 (52): 31294–31297. DOI : 10.1074 / jbc.270.52.31294 . PMID 8537398 .
Сахаринен Дж., Тайпале Дж., Кески-Оя Дж. (1996). «Ассоциация малого латентного трансформирующего фактора роста-бета с восьмью цистеиновым повторением его связывающего белка LTBP-1» . EMBO J . 15 (2): 245–53. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00355.x . PMC 449939 . PMID 8617200 .
Тайпале Дж., Сахаринен Дж., Хедман К., Кески-Оя Дж. (1996). «Скрытый трансформирующий фактор роста-бета 1 и его связывающий белок являются компонентами микрофибрилл внеклеточного матрикса» . J. Histochem. Cytochem . 44 (8): 875–89. DOI : 10.1177 / 44.8.8756760 . PMID 8756760 .
Нуньес I, Gleizes PE, Metz CN, Rifkin DB (1997). «Скрытые трансформирующие домены белка, связывающего фактор роста-бета, участвующие в активации и трансглютаминазозависимом перекрестном связывании латентного трансформирующего фактора роста-бета» . J. Cell Biol . 136 (5): 1151–1163. DOI : 10.1083 / jcb.136.5.1151 . PMC 2132473 . PMID 9060478 .
Каронен Т., Йесканен Л., Кески-Оя Дж. (1997). «Трансформирующий фактор роста бета-1 и его латентная форма связывают белок-1 с эластическими волокнами в дерме человека: накопление при актиническом повреждении и отсутствие при анетодермии». Br. J. Dermatol . 137 (1): 51–58. DOI : 10.1111 / j.1365-2133.1997.tb03700.x . PMID 9274625 .
Даллас С.Л., Кин Д.Р., Брудер С.П. и др. (2000). «Роль латентного трансформирующего фактора роста бета-связывающего белка 1 в фибриллин-содержащих микрофибриллах в костных клетках in vitro и in vivo» . J. Bone Miner. Res . 15 (1): 68–81. DOI : 10,1359 / jbmr.2000.15.1.68 . PMID 10646116 . S2CID 10766165 .
Сахаринен Дж., Кески-Оя Дж. (2000). «Мотив специфической последовательности 8-Cys повторов TGF-бета-связывающих белков, LTBP, создает поверхность гидрофобного взаимодействия для связывания небольшого латентного TGF-бета» . Мол. Биол. Cell . 11 (8): 2691–704. DOI : 10.1091 / mbc.11.8.2691 . PMC 14949 . PMID 10930463 .
Ладбрук С.Б., Барри С.Т., Делвес С.Дж., Хорган С.М. (2003). «Интегрин alphavbeta3 представляет собой рецептор пептидов, связанных с латентным периодом, трансформирующих факторов роста бета1 и бета3» . Biochem. Дж . 369 (Pt 2): 311–8. DOI : 10.1042 / BJ20020809 . PMC 1223078 . PMID 12358597 .
Исогай З., Оно Р.Н., Уширо С. и др. (2003). «Скрытый трансформирующий бета-связывающий белок 1 фактора роста взаимодействует с фибриллином и представляет собой белок, связанный с микрофибриллами» . J. Biol. Chem . 278 (4): 2750–2757. DOI : 10.1074 / jbc.M209256200 . PMID 12429738 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–16903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Гуй Y, Мерфи LJ (2004). «Взаимодействие белка-3, связывающего инсулиноподобный фактор роста с латентным трансформирующим белком-1, связывающим фактор роста-бета». Мол. Клетка. Biochem . 250 (1–2): 189–195. DOI : 10,1023 / А: 1024990409102 . PMID 12962157 . S2CID 6372795 .
Вейкколайнен К., Кески-Оя Дж, Коли К. (2004). «Экспрессия латентного TGF-бета-связывающего белка LTBP-1 гормонально регулируется в нормальных и трансформированных фибробластах легких человека». Факторы роста . 21 (2): 51–60. DOI : 10.1080 / 08977198310001598778 . PMID 14626352 . S2CID 42812652 .
Шариат С.Ф., Каттан М.В., Траксель Э. и др. (2004). «Связь пред- и послеоперационных уровней в плазме трансформирующего фактора роста бета (1) и интерлейкина 6 и его растворимого рецептора с прогрессированием рака простаты» . Clin. Cancer Res . 10 (6): 1992–1999. DOI : 10.1158 / 1078-0432.CCR-0768-03 . PMID 15041717 .

Эта статья о гене на хромосоме 2 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000049323 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001870 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2350783-5] Канзаки Т, Олофссон А, Морены А, Вернштедт С, Хеллман U, Miyazono К, Клаэссон-валлийский л, Heldin СН (июль 1990 года). «Связывающий белок TGF-бета 1: компонент большого латентного комплекса TGF-бета 1 с множественными повторяющимися последовательностями». Cell . 61 (6): 1051–1061. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (90) 90069-Q . PMID 2350783 . S2CID 54376541 .

[pmid11104663-6] Oklu R, Hesketh R (январь 2001). «Семейство латентных трансформирующих бета-связывающих белков фактора роста (LTBP)» . Biochem J . 352 (3): 601–10. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3520601 . PMC 1221494 . PMID 11104663 .

[entrez-7] а б «Ген Entrez: LTBP1 латентный трансформирующий фактор роста бета-связывающий белок 1» .

[pmid10930463-8] Saharinen, J; Кески-Оя Дж (август 2000 г.). «Мотив специфической последовательности 8-Cys повторов TGF-бета-связывающих белков, LTBP, создает поверхность гидрофобного взаимодействия для связывания небольшого латентного TGF-бета» . Мол. Биол. Cell . 11 (8): 2691–704. DOI : 10.1091 / mbc.11.8.2691 . ISSN 1059-1524 . PMC 14949 . PMID 10930463 .

[1]