| метилмалонил-КоА эпимераза | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Ленточная диаграмма метилмалонил-КоА-эпимеразы из Propionibacterium shermanii . Из PDB : 1JC5 . | ||||||||
| Идентификаторы | ||||||||
| ЕС нет. | 5.1.99.1 | |||||||
| Базы данных | ||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | |||||||
| BRENDA | BRENDA запись | |||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | |||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | |||||||
| MetaCyc | метаболический путь | |||||||
| ПРИАМ | профиль | |||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
| Генная онтология | Amigo / QuickGO | |||||||
| ||||||||
| метилмалонил-КоА эпимераза | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | ||||||
| Символ | MCEE | |||||
| Ген NCBI | 84693 | |||||
| HGNC | 16732 | |||||
| OMIM | 608419 | |||||
| RefSeq | NM_028626 | |||||
| UniProt | Q96PE7 | |||||
| Прочие данные | ||||||
| Номер ЕС | 5.1.99.1 | |||||
| Locus | Chr. 2 п. 13,3 | |||||
| ||||||
Метилмалонил-КоА-эпимераза ( EC 5.1.99.1 , метилмалонил-КоА рацемаза , метилмалонил-кофермент А рацемаза , DL-метилмалонил-КоА рацемаза , 2-метил-3-оксопропаноил-КоА 2-эпимераза [неверно] ) - фермент, участвующий в катаболизме жирных кислот. который кодируется у человека геном «MCEE» , расположенным на хромосоме 2 . Его обычно неправильно называют «метилмалонил-КоА рацемаза». Это не рацемаза, потому что у части CoA есть 5 других стереоцентров .
Структура [ править ]
«MCEE» ген расположен в 2p13 области и содержит 4 экзонов и кодирует для белка , который составляет приблизительно 18 кДа в размере и расположенный в митохондриях . [1] Существует несколько природных вариантов аминокислотных последовательностей. Структура белка MCEE была определена с помощью рентгеновской кристаллографии [2] с разрешением 1,8 ангстрем.
Функция [ править ]
Ген MCEE кодирует фермент, который взаимно превращает D- и L-метилмалонил-КоА во время деградации аминокислот с разветвленной цепью , жирных кислот с нечетной длиной цепи и других метаболитов. С точки зрения биохимии, он катализирует реакцию, которая превращает ( S ) - метилмалонил-КоА в ( R ) форму. [3] [4] Этот фермент катализирует следующую химическую реакцию
- ( S ) -метилмалонил-CoA ( R ) -метилмалонил-CoA
Метилмалонил-КоА-эпимераза играет важную роль в катаболизме жирных кислот с углеродными цепями нечетной длины. В катаболизма даже цепи насыщенных жирных кислот , что β-окисления проводящих путей разрушает жирных молекул ацил-CoA в повторяющихся последовательностей четырех реакций с образованием одного ацетил - КоА в повторяющейся последовательности. Это означает, что для каждого цикла β-окисления жирный ацил-Co-A укорачивается на два атома углерода. Если бы жирная кислота начиналась с четного числа атомов углерода, этот процесс мог бы расщепить всю насыщенную жирную кислоту на единицы ацетил-КоА. Однако, если жирная кислота начиналась с нечетного числа атомов углерода, β-окисление разрушило бы жирный ацил-КоА до тех пор, пока трехуглеродный пропионил-КоА не разрушился.сформирован. Чтобы превратить его в метаболически полезный сукцинил-КоА , необходимы три реакции. Пропионил-КоА сначала карбоксилируется до ( S ) -метилмалонил-КоА ферментом пропионил-КоА-карбоксилазой . Метилмалонил-КоА-эпимераза затем катализирует перегруппировку ( S ) -метилмалонил-КоА в ( R ) форму в реакции, в которой используется кофактор витамина B12 и резонансно-стабилизированный карбанионный интермедиат . [ необходима ссылка ] ( R ) -метилмалонил-КоА затем превращается в сукцинил-КоА в реакции, катализируемой мутазой метилмалонил-КоА .
Действуя как общее основание , фермент отщепляет протон от β-углерода ( R ) -метилмалонил-КоА. Это приводит к образованию промежуточного карбаниона, в котором -углерод стабилизируется резонансом. Затем фермент действует как обычная кислота, протонируя β-углерод, что приводит к образованию ( S ) -метилмалонил-КоА.
Клиническое значение [ править ]
Мутации в гене MCEE вызывают дефицит метималонил-КоА эпимеразы (MCEED) [5], редкую аутосомно-рецессивную врожденную ошибку метаболизма аминокислот с участием аминокислот с разветвленной цепью - валина , лейцина и изолейцина . Пациенты с MCEED могут иметь опасный для жизни неонатальный метаболический ацидоз , гипераммонемию , трудности с кормлением и кому .
Ссылки [ править ]
- ^ «MCEE - Methylmalonyl-CoA epimerase, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (Human) - MCEE ген и белок» . www.uniprot.org .
- ^ Европа, банк данных по белкам в. "Резюме структуры PDB 3rmu‹ Банк данных по белкам в Европе (PDBe) ‹EMBL-EBI" . www.ebi.ac.uk .
- ^ Mazumder Р, Т Сасакава, Kaziro Y, Очоа S (октябрь 1962 г.). «Метаболизм пропионовой кислоты в тканях животных. IX. Метилмалонил-кофермент А рацемаза». Журнал биологической химии . 237 : 3065–8. PMID 13934211 .
- ^ Overath P, Келлерман GM, Линен F, Fritz HP, Keller HJ (1962). «[О механизме перегруппировки метилмалонил-Со А в сукцинил-Со А. II. Эксперименты по механизму действия изомеразы метилмалонил-Со А и рацемазы метилмалонил-Со А]». Biochemische Zeitschrift . 335 : 500–18. PMID 14482843 .
- ^ Bikker H, Баккер HD, Abeling NG, Poll-ВТ, Kleijer WJ, Розенблат DS, Waterham HR, Вандерс RJ, Duran M (июль 2006). «Гомозиготная нонсенс-мутация в гене метилмалонил-КоА-эпимеразы (MCEE) приводит к легкой метилмалоновой ацидурии». Мутация человека . 27 (7): 640–3. DOI : 10.1002 / humu.20373 . PMID 16752391 . S2CID 5821956 .
Внешние ссылки [ править ]
- метилмалонил-КоА + эпимераза в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
