О'Коннор дебютировал в Лиге Ирландии за Атлон Таун 4 марта 1979 года. Во время своего пребывания в Сент-Мелс Парк он дважды становился лучшим бомбардиром Лиги Ирландии в 1981/82 и 1984/85 годах. Он также является лучшим бомбардиром Атлона за всю историю.
О'Коннор подписал контракт с «Шэмрок Роверс» в октябре 1985 года и дебютировал в победе над «Богемиан» со счетом 3: 0 27 октября. Свой первый гол за «Хупс» он забил 17 ноября 1985 года на «Хоум Фарм». Он сыграл в памятной товарищеской победе над «Арсеналом» в феврале 1986 года, когда его товарищ по Атлону и бывший товарищ по команде Ноэль Ларкин забил победный гол. В сезоне 1986/87 он не играл из-за перелома ноги. Он сделал один матч в Кубке европейских чемпионов в сентябре 1987 года.
Он уехал в октябре 1987 года, чтобы подписать контракт со своим братом Терло О'Коннором в Дандолке , где он пробыл один сезон, прежде чем вернуться в клуб своего родного города.
В конце сезона Лиги Ирландии 2012 года О'Коннор занимает двадцать седьмое место в списке бомбардиров Лиги Ирландии за все время с 117 голами в лиге [3] .
В мае 1992 года О'Коннор был назначен менеджером игроков в Атлон Таун. [4] В сезоне 1993–94 годов первого дивизиона Лиги Ирландии он привел их к продвижению по службе. [5]
Однако в 1996 году они были понижены из-за пенальти, когда Майкл ушел в отставку как игрок и ушел с поста менеджера.