Матери против декапентаплегического гомолога 1

SMAD1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1KHU , 2LAW , 2LAX , 2LAY , 2LAZ , 2LB0 , 2LB1 , 3Q47 , 3Q4A

Идентификаторы

Псевдонимы

SMAD1 , BSP-1, BSP1, JV4-1, JV41, MADH1, MADR1, член семейства SMAD 1

Внешние идентификаторы

OMIM : 601595 MGI : 109452 HomoloGene : 21196 GeneCard : SMAD1

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 8 (мышь) ^[1]

Группа	8 \| 8 C1	Начинать	79 338 395 п.н. ^[1]
Группа	8 \| 8 C1	Конец	79 399 518 п.н. ^[1]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• связывания ДНК • связывания со-СМАД • гомодимеризация активность белка • связывание I-СМАД • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции • GO: 0001077, ГО: 0001212, ГО: 0001213, ГО: 0001211, ГО: 0001205 ДНК-связывающий активатор активность транскрипции, РНК - полимераза II , специфичный • ион металла связывания • GO: 0001948 связывание белка • связывание идентичных белковых • белок гетеродимеризация активности • протеинкиназы связывания • последовательности ДНК-специфическое связывания • Связывание с геликазой DEAD / H-box РНК • первичное связывание миРНК • GO: 0000980 Цис-регуляторная область РНК-полимеразы II Связывание ДНК, специфичное для последовательности • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201, активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент	• цитоплазма • интегральный компонент мембраны • белковый комплекс SMAD • цитозоль • комплекс регуляторов транскрипции • внутриклеточный • нуклеоплазма • внутренняя ядерная мембрана • ядро клетки • макромолекулярный комплекс
Биологический процесс	• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в клеточном ответе на химический стимул • Сборка белкового комплекса SMAD • развитие зачатка мочеточника • регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная • передача сигнала белка SMAD • спецификация эмбрионального паттерна • регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II промотор • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • развитие заднего мозга • клеточный ответ на стимул BMP • пролиферация клеток сердечной мышцы • сигнальный путь BMP • транскрипция, ДНК-шаблон • каскад MAPK • фосфорилирование белка • образование гамет • развитие хряща • положительная регуляция экспрессии гена • позитивная регуляция дифференцировки остеобластов • позитивная регуляция развития хряща • первичный процессинг miRNA • обязательство судьбы мезодермальных клеток • воспалительный ответ • развитие костей • трансформирующий сигнальный путь бета-рецептора фактора роста • развитие среднего мозга • передача сигнала • отрицательная регуляция пролиферации клеток • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • обязательство судьбы остеобластов • гомеостатический процесс • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • позитивная регуляция транскрипции pri-miRNA с промотора РНК-полимеразы II • деубиквитинирование белка • позитивная регуляция отростка ангиогенез
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


4086


17125

Ансамбль


ENSG00000170365


ENSMUSG00000031681

UniProt


Q15797


P70340

RefSeq (мРНК)


NM_001003688 NM_005900


NM_008539

RefSeq (белок)

NP_001003688 NP_005891 NP_001341740 NP_001341741 NP_001341742
NP_001341743 NP_001341745 NP_001341746


NP_032565

Расположение (UCSC)

н / д

Chr 8: 79.34 - 79.4 Мб

PubMed поиск

^[2]

^[3]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Матери против decapentaplegic гомолога 1 также известные как член семьи SMAD 1 или Smad1 является белком , который в организме человека кодируется Smad1 геном . ^[4]^[5]

Номенклатура [ править ]

SMAD1 принадлежит к SMAD , семейству белков, аналогичных генным продуктам гена Drosophila « мать против декапентаплегии » (Mad) и гена Sma C. elegans . ^{[ необходима цитата ]} Имя представляет собой комбинацию двух; и основан на традиции столь необычных имен в сообществе исследователей генов. ^[6]

Было обнаружено, что мутация в гене «дрозофилы», MAD , у матери репрессировала ген decapentaplegic в эмбрионе. Сумасшедшие мутации могут быть помещены в аллельные серии на основе относительной тяжести усиления материнского эффекта слабых аллелей dpp, что объясняет название «Матери против dpp». ^[7]

Функция [ править ]

Белки SMAD являются преобразователями сигналов и модуляторами транскрипции, которые опосредуют множественные пути передачи сигналов. Этот белок опосредует сигналы костных морфогенетических белков (BMP), которые участвуют в ряде биологических активностей, включая рост клеток, апоптоз , морфогенез , развитие и иммунные ответы. В ответ на лиганды BMP этот белок может фосфорилироваться и активироваться киназой рецептора BMP. Фосфорилированная форма этого белка образует комплекс с SMAD4 , который важен для его функции в регуляции транскрипции. Этот белок является мишенью для SMAD-специфичных E3-убиквитинлигаз , таких как SMURF1.и SMURF2 , и подвергается убиквитинированию и деградации, опосредованной протеасомами . Наблюдались альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие тот же белок. ^[8]

SMAD1 представляет собой регулируемый рецептором SMAD ( R-SMAD ) и активируется киназой рецептора костного морфогенетического белка типа 1.

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031681 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Hoodless PA, Haerry T, S Абдолла, Стэплтон M, O'Connor MB, Attisano L, Wrana JL (май 1996). «MADR1, белок, связанный с MAD, который функционирует в сигнальных путях BMP2». Cell . 85 (4): 489–500. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81250-7 . PMID 8653785 . S2CID 2275955 .
^ Риггинс ГДж, Thiagalingam S, Розенблюм Е, Веинстеин CL, Керн SE, Гамильтон SR, Виллсон Ю.К., Маркоуиц С.Д., Кинзлер кВт, Фогельштейна В (июль 1996 года). «Безумные гены у человека». Генетика природы . 13 (3): 347–9. DOI : 10.1038 / ng0796-347 . PMID 8673135 . S2CID 10124489 .
^ «Еж Соник, Dicer, и проблема с Именованием Генов» , 26 сентября 2014, Майкл Уайт. psmag.com
^ "Интерактивная муха, дрозофила" .
^ "Entrez Gene: SMAD1 член семьи SMAD 1" .

Внешние ссылки [ править ]

Матери дрозофилы против dpp - Интерактивная муха
Smad1 + Protein в Национальной медицинской библиотеке США по предметным заголовкам по медицинским предметам (MeSH)
SMAD1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .

Эта статья о гене в хромосоме 4 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCm38Ensembl-1] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031681 - Ensembl , май 2017 г.

[2] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8653785-4] Hoodless PA, Haerry T, S Абдолла, Стэплтон M, O'Connor MB, Attisano L, Wrana JL (май 1996). «MADR1, белок, связанный с MAD, который функционирует в сигнальных путях BMP2». Cell . 85 (4): 489–500. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81250-7 . PMID 8653785 . S2CID 2275955 .

[pmid8673135-5] Риггинс ГДж, Thiagalingam S, Розенблюм Е, Веинстеин CL, Керн SE, Гамильтон SR, Виллсон Ю.К., Маркоуиц С.Д., Кинзлер кВт, Фогельштейна В (июль 1996 года). «Безумные гены у человека». Генетика природы . 13 (3): 347–9. DOI : 10.1038 / ng0796-347 . PMID 8673135 . S2CID 10124489 .

[6] «Еж Соник, Dicer, и проблема с Именованием Генов» , 26 сентября 2014, Майкл Уайт. psmag.com

[7] "Интерактивная муха, дрозофила" .

[8] "Entrez Gene: SMAD1 член семьи SMAD 1" .

[1]