Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Mouse Genome Informatics ( MGI ) - это бесплатная онлайн-база данных и биоинформатический ресурс, размещенный лабораторией Джексона при финансовой поддержке Национального института исследования генома человека (NHGRI), Национального института рака (NCI) и Национального института Юнис Кеннеди Шрайвер Здоровье детей и человеческое развитие (NICHD). [1] MGI предоставляет доступ к данным о генетике, геномике и биологии лабораторных мышей, чтобы облегчить изучение здоровья и болезней человека. [2] [3] База данных объединяет несколько проектов, два из которых наибольшие из них - База данных генома мышей и База данных экспрессии генов мышей (GXD).[4] По состоянию на 2018 годMGI содержит данные, собранные из более чем 230 000 публикаций. [5]

Ресурс MGI был впервые опубликован в Интернете в 1994 году [5] и представляет собой сборник данных, инструментов и анализов, созданных и адаптированных для использования на лабораторных мышах , широко используемом модельном организме . Это «авторитетный источник официальных названий генов, аллелей и линий мышей», которые соответствуют руководящим принципам, установленным Международным комитетом по стандартизированной генетической номенклатуре для мышей. [6]История и направленность научно-исследовательских и производственных объектов Лаборатории Джексона дает огромные знания и глубину, которые исследователи могут использовать для продвижения своих исследований. Специализированное сообщество исследователей мышей во всем мире также расширяет знания и способствует их развитию. Это незаменимый инструмент для любого исследователя, использующего мышь в качестве модельного организма для своих исследований, а также для исследователей, интересующихся генами, которые имеют гомологию с генами мыши. Различные ресурсы поддержки исследований мышей, включая коллекции животных и бесплатное программное обеспечение для управления колониями, также доступны на сайте MGI. [7]

База данных генома мыши [ править ]

База данных генома мышей
Database.png
Содержание
Описаниересурс по геномике и генетике млекопитающих.
Контакт
Исследовательский центрЛаборатория Джексона
Основное цитированиеДжудит Блейк и др. (2011) [8]
Доступ
Интернет сайтhttp://www.informatics.jax.org
Скачать URLftp://ftp.informatics.jax.org/

В Database Mouse Genome собирает и Викарий всеобъемлющего фенотипа и функциональные аннотации для мыши генов и аллелей . [8] Это проект, финансируемый NHGRI, который вносит вклад в базу данных информатики генома мышей.

База данных экспрессии генов мышей [ править ]

База данных экспрессии генов мыши
Database.png
Содержание
ОписаниеБаза данных экспрессии генов мыши
ОрганизмыMus musculus
Контакт
Исследовательский центрЛаборатория Джексона
Основное цитированиеПалец и др. (2011) [9]
Дата выхода1996 г.
Доступ
Интернет сайтhttp://www.informatics.jax.org/expression.shtml

База данных Gene Expression представляет собой сообщество ресурс информации экспрессии развития мыши. [9]

См. Также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Текущая финансовая поддержка MGI-MGI" . jax.org . Дата обращения 2 июня 2015 .
  2. Перейти ↑ Shaw D (май 2004 г.). «Поиск ресурсов информатики генома мышей (MGI) для информации о биологии мышей от генотипа к фенотипу» . Текущие протоколы в биоинформатике . Глава 1: Блок 1.7. DOI : 10.1002 / 0471250953.bi0107s05 . ISBN 0471250953. PMC  5147750 . PMID  18428715 .
  3. ↑ Qi D, Blake JA , Kadin JA, Richardson JE, Ringwald M, Eppig JT, Bult CJ (8–11 августа 2005 г.). Интеграция данных в базу данных информатики генома мышей (MGI) . Конференция по биоинформатике вычислительных систем, 2005. Семинары и тезисы докладов. IEEE. С. 37–8. DOI : 10,1109 / CSBW.2005.48 . ISBN 0-7695-2442-7.
  4. ^ "MGI-О ресурсе базы данных информатики генома мышей" . jax.org . Дата обращения 2 июня 2015 .
  5. ^ a b Закон, М; Шоу, Д.Р. (2018). Информатика генома мышей (MGI) - международный ресурс информации о лабораторных мышах . Методы молекулярной биологии. 1757 . С. 141–161. DOI : 10.1007 / 978-1-4939-7737-6_7 . ISBN 978-1-4939-7736-9. PMID  29761459 .
  6. ^ Маус Номенклатура Главная страница , извлекаться +28 Августу +2016
  7. ^ Ивица Летунич. "OpenHelix: информатика генома мыши (MGI)" . openhelix.com . Архивировано из оригинального 26 декабря 2017 года . Дата обращения 2 июня 2015 .
  8. ^ a b Блейк, Джудит А .; Bult, Кэрол Дж .; Кадин, Джеймс А .; Ричардсон, Джоэл Э .; Eppig, Janan T .; Группа базы данных генома мышей (январь 2011 г.). «База данных генома мышей (MGD): главный ресурс модельных организмов для геномики и генетики млекопитающих» . Nucleic Acids Res . Англия. 39 (проблема с базой данных): D842-8. DOI : 10.1093 / NAR / gkq1008 . PMC 3013640 . PMID 21051359 .  
  9. ^ a b Палец, Жаклин Н; Smith Constance M; Хаямизу Терри Ф; Маккрайт Ингеборг Дж; Эппиг Джанан Т; Кадин Джеймс А; Ричардсон Джоэл Э; Рингуолд Мартин (январь 2011 г.). «База данных экспрессии генов мыши (GXD): обновление 2011 г.» . Nucleic Acids Res . Англия. 39 (выпуск базы данных): D835-41. DOI : 10.1093 / NAR / gkq1132 . PMC 3013713 . PMID 21062809 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Bult, Кэрол Дж .; Блейк, Джудит А .; Smith, Cynthia L .; Кадин, Джеймс А .; Ричардсон, Джоэл Э .; Группа баз данных генома мышей (2019-01-08). «База данных генома мышей (MGD) 2019» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (D1): D801 – D806. DOI : 10.1093 / NAR / gky1056 . ISSN  1362-4962 . PMC  6323923 . PMID  30407599 .</ref>
  • Домашняя страница информатики генома мышей
  • Smith, Constance M .; Хаямизу, Терри Ф .; Finger, Jacqueline H .; Белло, Сьюзен М .; МакКрайт, Ингеборг Дж .; Сюй, Цзинся; Балдарелли, Ричард М .; Бил, Джонатан С .; Кэмпбелл, Джеффри; Corbani, Lori E .; Фрост, Пит Дж. (2019-01-08). «База данных экспрессии генов мыши (GXD): обновление 2019» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (D1): D774 – D779. DOI : 10.1093 / NAR / gky922 . ISSN  1362-4962 . PMC  6324054 . PMID  30335138 .
  • Публикации по информатике генома мышей
  • Учебник из мастерской Open Door [ постоянная мертвая ссылка ]
  • База данных экспрессии генов (GXD)