Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Трипептид (пример Val - Gly - Ala ) с
зеленым отмеченным амино-концом ( L-валин ) и
синим отмеченным карбоксильным концом ( L-аланин ).
Тетрапептид (пример Val - Gly - Ser - Ala ) с
зеленым отмеченным амино-концом ( L-валин ) и
синим отмеченным карбоксильным концом ( L-аланин ).

Олигопептиды , часто просто называют пептид ( олиго- , «несколько»), состоит из двух до двадцати аминокислот , и могут включать в себя дипептиды , трипептиды , тетрапептиды и пентапептиды. Некоторые из основных классов естественных олигопептидов включают aeruginosins , cyanopeptolins , микроцистина , microviridins , microginins , anabaenopeptins и cyclamides . Микроцистины лучше всего изучены из-за их потенциального токсического воздействия на питьевую воду. [1]Обзор некоторых олигопептидов показал, что самый большой класс - это цианопептолины (40,1%), за которыми следуют микроцистины (13,4%). [2]

Производство [ править ]

Классы олигопептидов продуцируются нерибосомными пептид- синтазами (NRPS), за исключением цикламидов и микровиридинов, которые синтезируются рибосомными путями. [3]

Примеры [ править ]

Примеры олигопептидов включают: [4]

  • Аманитины - циклические пептиды, полученные из карпофоров нескольких различных видов грибов. Они являются мощными ингибиторами РНК-полимераз у большинства видов эукариот, препятствуют выработке мРНК и синтезу белка. Эти пептиды важны при изучении транскрипции. Альфа-аманитин является основным токсином вида Amanita phalloides , ядовитым при попадании в организм человека или животных.
  • Антипаин - олигопептид, продуцируемый различными бактериями, который действует как ингибитор протеазы .
  • Церулетид - специфический декапептид, обнаруженный в коже Hyla caerulea , австралийской зеленой древесной лягушки . Церулетид имеет много общего по действию и составу с холецистокинином . Стимулирует секрецию желудка, желчных путей и поджелудочной железы; и определенные гладкие мышцы . Он используется для индукции панкреатита в экспериментальных моделях животных.
  • Глутатион - трипептид, выполняющий множество функций в клетках. Он соединяется с лекарствами, чтобы сделать их более растворимыми для выведения, является кофактором некоторых ферментов, участвует в перегруппировке дисульфидных связей белка и снижает количество пероксидов.
  • Лейпептины - группа ацилированных олигопептидов, продуцируемых актиномицетами, которые действуют как ингибиторы протеаз. Известно, что они в различной степени ингибируют трипсин , плазмин , калликреины , папаин и катепсины .
  • Нетропсин - основной олигопептид, выделенный из Streptomyces netropsis . Он цитотоксичен, и его сильное специфическое связывание с участками АТ ДНК полезно для генетических исследований.
  • Пепстатины - N- ацилированные олигопептиды, выделенные из фильтрата культур актиномицетов, которые специфически ингибируют кислотные протеазы, такие как пепсин и ренин.
  • Пептид T - N - ( N - ( N (2) - ( N - ( N - ( N - ( N - D- аланил L -серил) - L- треонил) - L- треонил) L- треонил) - L - аспарагинил) -L- тирозил) L- треонин. Гомология последовательности октапептида с белком оболочки gp120 ВИЧ. Он может быть полезен в качестве противовирусного средства при терапии СПИДа. Пентапептидная последовательность ядра TTNYT, состоящая из аминокислот 4-8 в пептиде Т, представляет собой последовательность оболочки ВИЧ, необходимую для прикрепления к рецептору CD4.
  • Фаллоидин - очень токсичный полипептид, выделенный в основном из Amanita phalloides (Agaricaceae) или смертельной шапочки; вызывает смертельное поражение печени, почек и ЦНС при отравлении грибами; используется при изучении поражения печени.
  • Тепротид - искусственный нонапептид (Pyr-Trp-Pro-Arg-Pro-Gln-Ile-Pro-Pro), который точно такой же, как пептид из яда змеи, Bothrops jararaca. Он ингибирует кининазу II и АНГИОТЕНСИН I и был предложен в качестве гипотензивного средства.
  • Туфцин - N (2) - ((1- ( N (2) - L- треонил) - L- лизил) - L -пролил) - L- аргинин. Тетрапептид, продуцируемый в селезенке ферментативным расщеплением лейкофильного гамма-глобулина. Стимулирует фагоцитарную активность полиморфно-ядерных лейкоцитов крови и, в частности, нейтрофилов. Пептид находится во фрагменте Fd молекулы гамма-глобулина.

См. Также [ править ]

  • Микропептид
  • Олигоэстер
  • Олигомер
  • Олигопептидаза
  • Синтез пептидов
  • Протеаза

Ссылки [ править ]

  1. ^ Мартин Велкер и Ханс фон Дёрен (2006). «Цианобактериальные пептиды - комбинаторный биосинтез природы» . FEMS Microbiology Reviews . 30 (4): 530–563. DOI : 10.1111 / j.1574-6976.2006.00022.x . PMID  16774586 .CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
  2. ^ Джордж Э. Члипала, Шуньян Мо и Джимми Орджала (2011). «Химическое разнообразие пресноводных и наземных цианобактерий - источник для открытия лекарств» . Curr Drug Targets . 12 (11): 1654–73. DOI : 10,2174 / 138945011798109455 . PMC 3244969 . PMID 21561419 .  CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
  3. ^ Рамси Ага, Самуэль Сирес, Ларс Вёрмер и Антонио Кесада (2013). «Ограниченная стабильность микроцистинов в олигопептидных композициях Microcystis aeruginosa (Cyanobacteria): значение для определения хемотипов» . Токсины . 5 (6): 1089–1104. DOI : 10,3390 / toxins5061089 . PMC 3717771 . PMID 23744054 .  CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
  4. ↑ Аргос, Патрик. "Исследование связывающих доменов олигопептидов в третичных структурах белков и возможных кандидатов для общего слияния генов" (PDF) . Европейская лаборатория молекулярной биологии. Архивировано из оригинального (PDF) 28 июля 2014 года . Проверено 28 июля 2014 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Структурная биохимия / Белки / Аминокислоты (Викиучебники)