Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

«Биологическая форма» перенаправляется сюда. Чтобы узнать о неофициальном таксономическом термине в ботанике, см. Раса (биология) § Физиологическая раса .
«Форма жизни» перенаправляется сюда. Для философской концепции см. Форма жизни (философия) .
«Живые существа» перенаправляются сюда. Чтобы узнать о библейской концепции, см. Живые существа (Библия) .
Escherichia coli ( E. coli ), прокариот , представляет собой микроскопический одноклеточный организм.
Амебы - одноклеточные эукариоты.
Часть серии по
Биология
202002 Лабораторный прибор dna.svg
Изучение живых организмов
Ключевые компоненты
  • Археи
  • Животные ( зоология )
  • Бактерии ( бактериология )
  • Грибы ( микология )
  • Растения ( Ботаника )
  • Протисты ( Протистология )
Субдисциплины
  • Анатомия
  • Астробиология
  • Клеточная биология
  • Химическая биология
  • Экология
  • Эволюционная биология
  • Генетика
  • Геномика
  • Морская биология
  • Лекарство
  • Микробиология
  • Молекулярная биология
  • Органическая химия
  • Палеонтология
  • Психология
  • Физиология
  • Токсикология
  • Вирусология
Исследование
  • Отрасли биологии
  • Биолог ( Список)
  • Список журналов
Приложения
  • Сельскохозяйственная наука
  • Биотехнологии
  • Технологии здоровья
  • Нанобиотехнологии
  •  Биологический портал
  • v
  • т
  • е
Многопоровые грибы и покрытосеменные деревья - это крупные многоклеточные эукариоты.

В биологии , организм (от греческого : ὀργανισμός, Университет Организация ) является любым физическим лицом , которое воплощает в себе свойство жизни . [1] Это синоним слова « форма жизни ».

Организмы классифицируются по таксономии на такие группы, как многоклеточные животные , растения и грибы ; или одноклеточные микроорганизмы, такие как протисты , бактерии и археи . [2] Все типы организмов способны к размножению , росту и развитию , поддержанию и некоторой степени реакции на раздражители . Люди , кальмары , грибы и сосудистые растенияявляются примерами многоклеточных организмов, которые в процессе развития дифференцируют специализированные ткани и органы .

Организм может быть прокариотом или эукариотом . Прокариоты представлены двумя отдельными доменами  - бактериями и археями . Эукариотические организмы характеризуются наличием клеточного ядра, связанного с мембраной, и содержат дополнительные связанные с мембраной компартменты, называемые органеллами (такими как митохондрии у животных и растений и пластиды в растениях и водорослях , которые обычно считаются производными эндосимбиотических бактерий). [3] Грибы, животные и растения - примеры царств. организмов внутри эукариот.

Оценки количества современных видов на Земле колеблются от 2 миллионов до 1 триллиона [4], из которых более 1,7 миллиона задокументированы. [5] Более 99% всех видов, насчитывающих более пяти миллиардов видов [6], которые когда-либо жили, по оценкам, вымерли . [7] [8]

В 2016 году набор 355 генов из последнего универсального общего предка был идентифицирован (LUCA) всех организмов. [9] [10]

Этимология [ править ]

Термин «организм» (от греческого ὀργανισμός, Университет Организации , из ὄργανον, органон , то есть «инструмент, реализация, инструмент, орган чувств или задержания») [11] [12] впервые появился в английском языке в 1703 году и взял на его текущее определение 1834 г. ( Оксфордский словарь английского языка ). Это напрямую связано с термином «организация». Существует давняя традиция определения организмов как самоорганизующихся существ, восходящая, по крайней мере, к « Критике суждения» Иммануила Канта 1790 года . [13]

Определения [ править ]

Организм можно определить как совокупность молекул, функционирующих как более или менее стабильное целое, проявляющее свойства жизни . Словарные определения могут быть широкими, с использованием таких фраз, как «любая живая структура, такая как растение, животное, гриб или бактерия, способная к росту и размножению». [14] Многие определения исключают вирусы и возможные искусственные неорганические формы жизни , поскольку размножение вирусов зависит от биохимического механизма клетки-хозяина. [15] суперорганизм представляет собой организм , состоящий из многих людей , работающих вместе в качестве единой функциональной или социальной единицы . [16]

Были споры о том, как лучше всего определить организм [17] [18] [19] [20] [21] [22] [23] [24] [25] [26]] и действительно ли такой определение необходимо. [27] [28] Некоторые статьи [29] являются ответами на предположение, что категория «организм» может быть неадекватной в биологии. [30] [ необходима страница ]

Вирусы [ править ]

Основная статья: Неклеточная жизнь

Вирусы обычно не считаются организмами, потому что они неспособны к автономному воспроизводству , росту или метаболизму . Хотя некоторые организмы также неспособны к независимому выживанию и живут как обязательные внутриклеточные паразиты , они способны к независимому метаболизму и размножению. Хотя у вирусов есть несколько ферментов и молекул, характерных для живых организмов, у них нет собственного метаболизма; они не могут синтезировать и организовать органические соединения, из которых они образованы. Естественно, это исключает автономное воспроизводство: они могут только пассивно воспроизводиться механизмами клетки-хозяина . В этом смысле они похожи на неодушевленную материю.

Хотя вирусы не поддерживают независимый метаболизм и поэтому обычно не классифицируются как организмы, у них есть свои собственные гены , и они эволюционируют.механизмами, аналогичными эволюционным механизмам организмов. Таким образом, аргумент в пользу того, что вирусы следует классифицировать как живые организмы, заключается в их способности эволюционировать и воспроизводиться посредством самосборки. Однако некоторые ученые утверждают, что вирусы не развиваются и не воспроизводятся самостоятельно. Вместо этого вирусы развиваются их клетками-хозяевами, что означает совместную эволюцию вирусов и клеток-хозяев. Если бы клетки-хозяева не существовали, вирусная эволюция была бы невозможна. Это не относится к клеткам. Если бы вирусов не существовало, направление клеточной эволюции могло бы быть другим, но клетки, тем не менее, могли бы развиваться. Что касается воспроизводства, вирусы полностью полагаются на машины хозяев для репликации. [31]Открытие вирусов с генами, кодирующими энергетический обмен и синтез белка, вызвало споры о том, являются ли вирусы живыми организмами. Присутствие этих генов предполагало, что когда-то вирусы были способны метаболизировать. Однако позже выяснилось, что гены, кодирующие энергетический и белковый обмен, имеют клеточное происхождение. Скорее всего, эти гены были получены путем горизонтального переноса генов от вирусных хозяев. [31]

Химия [ править ]

Организмы представляют собой сложные химические системы, организованные таким образом, чтобы способствовать воспроизводству и некоторой степени устойчивости или выживания. Те же законы, которые управляют неживой химией, управляют химическими процессами жизни . Обычно феномены целых организмов определяют их приспособленность к окружающей среде и, следовательно, выживание их основанных на ДНК генов.

Организмы явно обязаны своим происхождением, метаболизмом и многими другими внутренними функциями химическим явлениям, особенно химии больших органических молекул. Организмы - это сложные системы химических соединений, которые, благодаря взаимодействию и окружающей среде, играют самые разные роли.

Организмы представляют собой полузакрытые химические системы. Хотя они являются отдельными единицами жизни (как того требует определение), они не закрыты для окружающей их среды. Для работы они постоянно поглощают и высвобождают энергию. Автотрофы производят полезную энергию (в форме органических соединений), используя солнечный свет или неорганические соединения, в то время как гетеротрофы принимают органические соединения из окружающей среды.

Основным химическим элементом в этих соединениях является углерод . В химические свойства этого элемента , такие как его большое сродство к связи с другими маленькими атомами, в том числе других атомов углерода, и его небольшой размер делает его способным образовывать кратные связи, делают его идеальным в качестве основы органической жизни. Он способен образовывать небольшие трехатомные соединения (например, двуокись углерода ), а также большие цепочки из многих тысяч атомов, которые могут хранить данные ( нуклеиновые кислоты ), удерживать клетки вместе и передавать информацию (белок).

Макромолекулы [ править ]

Соединения, из которых состоят организмы, можно разделить на макромолекулы и другие, более мелкие молекулы. Четыре группы макромолекул - это нуклеиновые кислоты , белки , углеводы и липиды . Нуклеиновые кислоты (в частности, дезоксирибонуклеиновая кислота или ДНК) хранят генетические данные в виде последовательности нуклеотидов . Конкретная последовательность четырех различных типов нуклеотидов ( аденин , цитозин , гуанин и тимин ) определяет многие характеристики, составляющие организм. Последовательность разделена на кодоны, каждый из которых представляет собой конкретную последовательность из трех нуклеотидов и соответствует определенной аминокислоте . Таким образом, последовательность ДНК кодирует конкретный белок, который из-за химических свойств аминокислот, из которых он состоит, сворачивается определенным образом и, таким образом, выполняет определенную функцию.

Эти функции белка были признаны:

  1. Ферменты , катализирующие реакции обмена веществ
  2. Структурные белки, такие как тубулин или коллаген
  3. Регуляторные белки, такие как факторы транскрипции или циклины, которые регулируют клеточный цикл.
  4. Сигнальные молекулы или их рецепторы, такие как некоторые гормоны и их рецепторы
  5. Защитные белки, которые могут включать в себя все от антител в иммунной системе , в токсины (например, дендротоксин змея), к белкам , которые включают необычные аминокислоты , такие как канаванин

Двухслойный фосфолипид образует мембрану клетки, которая представляет собой барьер, содержащий все, что находится внутри клетки, и препятствует свободному проникновению соединений внутрь и из клетки. Из-за избирательной проницаемости фосфолипидной мембраны через нее могут проходить только определенные соединения.

Структура [ править ]

Все организмы состоят из структурных единиц, называемых клетками ; некоторые содержат одну клетку (одноклеточные), а другие - множество единиц (многоклеточные). Многоклеточные организмы способны специализировать клетки для выполнения определенных функций. Группа таких клеток представляет собой ткань , и у животных они встречаются четырех основных типов, а именно эпителий , нервная ткань , мышечная ткань и соединительная ткань . Несколько типов тканей работают вместе в форме органа для выполнения определенной функции (такой как перекачивание крови сердцем или как барьер для окружающей среды, например кожа). Эта модель продолжается и на более высоком уровне, когда несколько органов функционируют как система органов, такая как репродуктивная система и пищеварительная система . Многие многоклеточные организмы состоят из нескольких систем органов, которые координируются, чтобы обеспечить жизнь.

Ячейка [ править ]

Клеточной теории , впервые разработана в 1839 году Schleiden и Шванн , утверждает , что все организмы состоят из одной или нескольких ячеек; все ячейки происходят из уже существующих ячеек; и клетки содержат наследственную информацию, необходимую для регулирования функций клеток и для передачи информации следующему поколению клеток.

Есть два типа клеток: эукариотические и прокариотические. Прокариотические клетки обычно являются одиночными, в то время как эукариотические клетки обычно встречаются в многоклеточных организмах. У прокариотических клеток отсутствует ядерная мембрана, поэтому ДНК внутри клетки не связана; эукариотические клетки имеют ядерные мембраны.

Все клетки, будь то прокариотические или эукариотические, имеют мембрану , которая окружает клетку, отделяет ее внутреннюю часть от окружающей среды, регулирует то, что движется внутрь и наружу, и поддерживает электрический потенциал клетки . Внутри мембраны соленая цитоплазма занимает большую часть объема клетки. Все клетки обладают ДНК, наследственным материалом генов , и РНК , содержащей информацию, необходимую для построения различных белков, таких как ферменты , основной механизм клетки. В клетках есть и другие виды биомолекул .

Все клетки имеют несколько схожих характеристик: [32]

  • Размножение клеточным делением ( бинарное деление , митоз или мейоз ).
  • Использование ферментов и других белков, кодируемых генами ДНК и производимых через промежуточные звенья информационной РНК и рибосомы .
  • Метаболизм, включая прием сырья, построение компонентов клеток, преобразование энергии, молекул и высвобождение побочных продуктов . Функционирование клетки зависит от ее способности извлекать и использовать химическую энергию, хранящуюся в органических молекулах. Эта энергия поступает из метаболических путей .
  • Реакция на внешние и внутренние раздражители, такие как изменение температуры, pH или уровня питательных веществ.
  • Содержимое клетки находится внутри мембраны клеточной поверхности, которая содержит белки и липидный бислой .

Эволюция [ править ]

Смотрите также: Происхождение жизни , Самые ранние известные формы жизни и Общее происхождение

Последний универсальный общий предок [ править ]

Докембрийские строматолиты в формации Сиех, Национальный парк Глейшер . В 2002 году статья в научном журнале Nature предположила, что эти геологические образования возрастом 3,5 млрд лет содержат окаменелые микробы цианобактерий . Это говорит о том, что они являются свидетельством существования одной из самых ранних известных форм жизни на Земле.
Основная статья: Последний универсальный общий предок
Дополнительная информация: Хронология эволюционной истории жизни.

Последний универсальный общий предок (LUCA) является самым последним организмом , из которого все организмы теперь живут на Земле сходит . [33] Таким образом, это самый недавний общий предок всей современной жизни на Земле. LUCA, по оценкам, жил от 3,5 до 3,8 миллиарда лет назад (когда-то в палеоархейскую эпоху ). [34] [35] Самым ранним свидетельством существования жизни на Земле является биогенный графит, обнаруженный в метаосадочных породах возрастом 3,7 миллиарда лет, обнаруженных в Западной Гренландии [36], и в окаменелостях микробных матов найдено в 3,48 млрд годовалого песчаника обнаружены в Западной Австралии . [37] [38] Хотя более 99 процентов всех видов, которые когда-либо жили на планете, по оценкам, вымерли, [7] [8] вполне вероятно, что в настоящее время на Земле существует более миллиарда видов жизни, причем самые высокие оценки и прогнозы достигают одного триллиона видов. [4]

Информация о раннем развитии жизни включает данные из многих различных областей, включая геологию и планетологию . Эти науки предоставляют информацию об истории Земли и изменениях, вызванных жизнью. Тем не менее, большая часть информации о ранней Земле была уничтожена геологическими процессами с течением времени .

Все организмы произошли от общего предка или наследственного генофонда. Доказательства общего происхождения могут быть найдены в чертах, общих для всех живых организмов. Во времена Дарвина доказательство общих черт основывалось исключительно на видимых наблюдениях морфологических сходств, таких как тот факт, что у всех птиц есть крылья, даже если они не летают.

Генетика убедительно свидетельствует о том, что у всех организмов есть общий предок. Например, каждая живая клетка использует нуклеиновые кислоты в качестве генетического материала и использует те же двадцать аминокислот в качестве строительных блоков для белков . Все организмы используют один и тот же генетический код (с некоторыми чрезвычайно редкими и незначительными отклонениями) для преобразования последовательностей нуклеиновых кислот в белки. Универсальность этих черт убедительно указывает на общее происхождение, потому что выбор многих из этих черт кажется произвольным. Горизонтальный перенос генов затрудняет изучение последнего универсального предка. [39]Однако универсальное использование одного и того же генетического кода, тех же нуклеотидов и тех же аминокислот делает существование такого предка чрезвычайно вероятным. [40]

Филогения [ править ]

LUA
 

Хлоробактерии (общепринятое название = Chloroflexi)

 
 
 

Hadobacteria (= группа Deinococcus-Thermus)

 
Гликобактерии
 

Цианобактерии

 
 
Gracilicutes
 

Спирохеты

 
 
Сфингобактерии
 

Фибробактерии

 
 
 

Хлороби

 
 

Bacteroidetes

 
 
 
 
Планктобактерии
 

Планктомицеты

 
 
 

Хламидии

 
 
 

Lentisphaerae

 
 

Веррукомикробия

 
 
 
 
Протеобактерии
Геобактерии
 

Deferribacteres

 
 

Ацидобактерии

 
 
Тиобактерии
 

Дельтапротеобактерии

 
 

Эпсилонпротеобактерии

 
 
Родобактерии
 

Alphaproteobacteria

 
Хроматибактерии
 

Бетапротеобактерии

 
 

Гаммапротеобактерии

 
 
 
 
 
 
 
Unibacteria
Эврибактерии
 

Термотоги

 
 

Фузобактерии

 
 

Negativicutes

 
 
 
 

Эндобактерии (= Firmicutes, Mollicutes)

 
 
 

Актинобактерии

 
Неомура
 

Археи

 
 

Эукария

 
 
 
 
 
 
 
 
 

Расположение корня [ править ]

LUCA использовала путь Вуда-Люнгдаля или восстановительный ацетил-КоА для фиксации углерода.
Для разветвления типов бактерий см. Типы бактерий .

Наиболее общепринятое расположение корня древа жизни - между монофилетическим доменом Бактерий и кладой, образованной археями и эукариотами, так называемого «традиционного дерева жизни» на основании нескольких молекулярных исследований. [41] [42] [43] [44] [45] [46] Очень небольшое количество исследований пришло к другому выводу, а именно, что корень находится в домене Bacteria, либо в типе Firmicutes [47], либо в том, что тип Chloroflexi базальна по отношению к кладе с архей и эукариотами и остальными бактериями, как было предложеноТомас Кавалье-Смит . [48]

В исследовании, опубликованном в 2016 году Уильямом Ф. Мартином , путем генетического анализа 6,1 миллиона генов, кодирующих белок из секвенированных прокариотических геномов различных филогенетических деревьев, было выявлено 355 кластеров белков из 286 514 кластеров белков, которые, вероятно, были общими для LUCA. Результаты "изображают LUCA как анаэробный , CO 2 -фиксирующий, H 2 -зависимый путь Вуда-Люнгдаля (восстановительный путь ацетил-кофермента А ), N 2 -фиксирующий и термофильный. Биохимия LUCA изобилует кластерами FeS и радикальной реакцией. механизмы. Его кофакторы обнаруживают зависимость от переходных металлов , флавинов ,S-аденозилметионин , кофермент А , ферредоксин , молибдоптерин , коррины и селен . Его генетический код требовал модификаций нуклеозидов и S-аденозилметионин-зависимого метилирования ». Результаты показывают, что метаногенная клострия является базальной кладой в 355 исследованных линиях, и предполагают, что LUCA населяла анаэробные гидротермальные источники в геохимически активной среде, богатой H 2. , CO 2 и железо. [9]Однако идентификация этих генов как присутствующих в LUCA подверглась критике, предполагая, что многие из белков, предположительно присутствующих в LUCA, представляют собой более поздние горизонтальные переносы генов между археями и бактериями. [49]

Воспроизведение [ править ]

Основная статья: Репродукция

Половое размножение широко распространено среди современных эукариот и, вероятно, имело место у последнего общего предка. [50] Об этом свидетельствует обнаружение основного набора генов мейоза у потомков линий, которые рано отклонились от эукариотического эволюционного древа. [51] и Малик и др. [52] Это также подтверждается данными о том, что эукариоты, ранее считавшиеся «древними асексуалами», такие как амеба , вероятно, были в прошлом половыми, и что большинство современных бесполых амебоидных линий, вероятно, возникли недавно и независимо. [53]

У прокариот естественная бактериальная трансформация включает перенос ДНК от одной бактерии к другой и интеграцию донорной ДНК в хромосому-реципиент путем рекомбинации. Естественная бактериальная трансформация считается примитивным половым процессом и происходит как у бактерий, так и у архей, хотя она была изучена в основном у бактерий. Очевидно, трансформация является бактериальной адаптацией, а не случайным явлением, поскольку она зависит от множества генных продуктов, которые специально взаимодействуют друг с другом, чтобы войти в состояние естественной компетентности для выполнения этого сложного процесса. [54] Трансформация - это распространенный способ передачи ДНК среди прокариот. [55]

Горизонтальный перенос генов [ править ]

Основная статья: Горизонтальный перенос генов

Родословная живых организмов традиционно реконструируется по морфологии, но все чаще дополняется филогенетикой - реконструкцией филогенеза путем сравнения генетической (ДНК) последовательности.

Сравнение последовательностей предполагает недавний горизонтальный перенос многих генов между различными видами, в том числе через границы филогенетических «доменов». Таким образом, определение филогенетической истории вида не может быть сделано окончательно, определяя эволюционные деревья для отдельных генов. [56]

Биолог Питер Гогартен предполагает, что «исходная метафора дерева больше не соответствует данным недавних исследований генома», поэтому «биологи (должны) использовать метафору мозаики для описания различных историй, объединенных в отдельных геномах, и использовать метафору сеть для визуализации богатого обмена и совместных эффектов ГПГ среди микробов ». [57]

Будущее жизни (клонирование и синтетические организмы) [ править ]

Современная биотехнология бросает вызов традиционным представлениям об организме и видах. Клонирование - это процесс создания нового многоклеточного организма, генетически идентичного другому, с потенциалом создания совершенно новых видов организмов. Клонирование - предмет многочисленных этических споров .

В 2008 году Дж Крэйг Вентер институт собран синтетический бактериальный геном , Mycoplasma гениталий , с помощью рекомбинации в дрожжах 25 перекрывающихся фрагментов ДНК в одну стадию. Использование дрожжевой рекомбинации значительно упрощает сборку больших молекул ДНК как из синтетических, так и из природных фрагментов. [58] Другие компании, такие как Synthetic Genomics , уже были созданы, чтобы воспользоваться преимуществами многих коммерческих применений специально разработанных геномов.

См. Также [ править ]

  • Самые ранние известные формы жизни

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Определение организма | Dictionary.com" . www.dictionary.com . Проверено 19 февраля 2021 года .
  2. ^ Хайн, RS. (2008). Словарь биологии (6-е изд.). Оксфорд: Издательство Оксфордского университета. п. 461. ISBN. 978-0-19-920462-5.
  3. Перейти ↑ Cavalier-Smith T. (1987). «Происхождение эукариотических и архебактериальных клеток». Летопись Нью-Йоркской академии наук . 503 (1): 17–54. Bibcode : 1987NYASA.503 ... 17С . DOI : 10.1111 / j.1749-6632.1987.tb40596.x . PMID 3113314 . S2CID 38405158 .  
  4. ^ a b Брендан Б. Ларсен; Элизабет С. Миллер; Мэтью К. Роудс; Джон Дж. Винс (сентябрь 2017 г.). «Чрезмерная любовь умножается и распространяется: количество видов на Земле и новый пирог жизни» (PDF) . Ежеквартальный обзор биологии . 92 (3): 230 . Дата обращения 11 ноября 2019 .
  5. ^ Андерсон, Алисса М. (2018). «Описание неизведанного» . Chironomus: Журнал исследований Chironomidae (31): 2–3. DOI : 10,5324 / cjcr.v0i31.2887 .
  6. ^ Кунин, МЫ; Гастон, Кевин, ред. (1996). Биология редкости: причины и последствия редких - общих различий . ISBN 978-0-412-63380-5. Дата обращения 26 мая 2015 .
  7. ^ a b Стернс, Беверли Петерсон; Stearns, SC; Стернс, Стивен С. (2000). Наблюдая с края исчезновения . Издательство Йельского университета. п. предисловие x. ISBN 978-0-300-08469-6. Дата обращения 30 мая 2017 .
  8. ^ a b Новачек, Майкл Дж. (8 ноября 2014 г.). «Блестящее будущее предыстории» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 25 декабря 2014 .
  9. ^ a b Вайс, Мэдлин С .; Sousa, Filipa L .; Мрнявац, Наталья; Нойкирхен, Синье; Рёттгер, Мэйо; Нельсон-Сати, Шиджулал; Мартин, Уильям Ф. (2016). «Физиология и среда обитания последнего универсального общего предка». Природная микробиология . 1 (9): 16116. DOI : 10.1038 / nmicrobiol.2016.116 . PMID 27562259 . S2CID 2997255 .  
  10. ↑ Уэйд, Николас (25 июля 2016 г.). «Познакомьтесь с Лукой, прародителем всего живого» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 25 июля +2016 .
  11. ^ ὄργανον . Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте Perseus
  12. ^ "организм" . Интернет-словарь этимологии .
  13. ^ Кант I., Критика суждения : §64.
  14. ^ "организм". Словарь Chambers 21st Century (онлайн-изд.). 1999 г.
  15. ^ "организм" . Оксфордский словарь английского языка (Интернет-изд.). Издательство Оксфордского университета. 2004 г. (Требуется подписка или членство в учреждении-участнике .)
  16. ^ Келли, Кевин (1994). Из-под контроля: новая биология машин, социальных систем и экономического мира . Бостон: Эддисон-Уэсли. С.  98 . ISBN 978-0-201-48340-6.
  17. ^ Дюпре, J. (2010). «Полигеномный организм». Социологическое обозрение . 58 : 19–99. DOI : 10.1111 / j.1467-954X.2010.01909.x . S2CID 142512990 . 
  18. ^ Folse Hj, 3 .; Рафгарден, Дж. (2010). «Что такое индивидуальный организм? Многоуровневая селекционная перспектива». Ежеквартальный обзор биологии . 85 (4): 447–472. DOI : 10.1086 / 656905 . PMID 21243964 . S2CID 19816447 .  CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
  19. ^ Pradeu, Т. (2010). «Что такое организм? Иммунологический ответ». История и философия наук о жизни . 32 (2–3): 247–267. PMID 21162370 . 
  20. ^ Кларк, Э. (2010). «Проблема биологической индивидуальности». Биологическая теория . 5 (4): 312–325. DOI : 10.1162 / BIOT_a_00068 . S2CID 28501709 . 
  21. ^ Гарднер, А .; Графен, А. (2009). «Захват суперорганизма: формальная теория групповой адаптации» . Журнал эволюционной биологии . 22 (4): 659–671. DOI : 10.1111 / j.1420-9101.2008.01681.x . PMID 19210588 . S2CID 8413751 .  
  22. ^ Michod, RE (1999). Дарвиновская динамика: эволюционные переходы в приспособленности и индивидуальности . Издательство Принстонского университета. ISBN 978-0-691-05011-9.
  23. ^ Queller, округ Колумбия; JE Strassmann (2009). «Вне общества: эволюция организменности» . Философские труды Королевского общества B: биологические науки . 364 (1533): 3143–3155. DOI : 10.1098 / rstb.2009.0095 . PMC 2781869 . PMID 19805423 .  
  24. ^ Сантелисес Б. (1999). «Сколько существует индивидуумов?». Тенденции в экологии и эволюции . 14 (4): 152–155. DOI : 10.1016 / s0169-5347 (98) 01519-5 . PMID 10322523 . 
  25. Перейти ↑ Wilson, R (2007). «Биологическое понятие личности». Стэнфордская энциклопедия философии .
  26. ^ Лонго, Джузеппе; Монтевиль, Маэль (2014). Перспективы организмов - Спрингер . Конспект лекций по морфогенезу. DOI : 10.1007 / 978-3-642-35938-5 . ISBN 978-3-642-35937-8. S2CID  27653540 .
  27. ^ Пеппер, JW; MD Herron (2008). «Нужна ли биологии концепция организма?». Биологические обзоры . 83 (4): 621–627. DOI : 10.1111 / j.1469-185X.2008.00057.x . PMID 18947335 . S2CID 4942890 .  
  28. Перейти ↑ Wilson, J (2000). «Онтологическая бойня: концепции организма и биологические обобщения». Философия науки . 67 : 301–311. DOI : 10.1086 / 392827 . JSTOR 188676 . S2CID 84168536 .  
  29. Перейти ↑ Bateson, P. (2005). «Возвращение всего организма». Журнал биологических наук . 30 (1): 31–39. DOI : 10.1007 / BF02705148 . PMID 15824439 . S2CID 26656790 .  
  30. ^ Докинз, Ричард (1982). Расширенный фенотип . Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-286088-0.
  31. ^ а б Морейра, Д .; Лопес-Гарсия, PN (2009). «Десять причин исключить вирусы из древа жизни». Обзоры природы микробиологии . 7 (4): 306–311. DOI : 10.1038 / nrmicro2108 . PMID 19270719 . S2CID 3907750 .  
  32. ^ Универсальные особенности клеток на Земле в главе 1четвертого издания молекулярной биологии клетки под редакцией Брюса Альберта (2002), опубликованной издательством Garland Science.
  33. ^ Теобальд, РМИ (2010), "Формальная проверка теории универсального общего предка", Nature , 465 (7295): 219-222, Bibcode : 2010Natur.465..219T , DOI : 10.1038 / nature09014 , PMID 20463738 , S2CID 4422345  
  34. ^ Дулитл, WF (2000), "выкорчевывание древо жизни" (PDF) , Scientific American , 282 (6): 90-95, Bibcode : 2000SciAm.282b..90D , DOI : 10.1038 / scientificamerican0200-90 , PMID 10710791 , архивировано из оригинального (PDF) 31 января 2011 года.  
  35. ^ Glansdorff, N .; Сюй, Y; Лабедан, Б. (2008), «Последний всеобщий общий предок: возникновение, конституция и генетическое наследие неуловимого предшественника», Biology Direct , 3 : 29, DOI : 10.1186 / 1745-6150-3-29 , PMC 2478661 , PMID 18613974 .  
  36. ^ Йоко Отомо; Такеши Какегава; Акизуми Исида; Тоширо Нагасе; Миник Т. Розинг (8 декабря 2013 г.). «Доказательства биогенного графита в метаосадочных породах Исуа раннего архея». Природа Геонауки . 7 (1): 25–28. Bibcode : 2014NatGe ... 7 ... 25оС . DOI : 10.1038 / ngeo2025 .
  37. ^ Borenstein, Сет (13 ноября 2013). «Самая старая найденная окаменелость: познакомьтесь со своей микробной мамой» . AP News . Проверено 15 ноября 2013 года .
  38. ^ Ноффке, Нора; Кристиан, Даниэль; Уэйси, Дэвид; Хазен, Роберт М. (8 ноября 2013 г.). "Осадочные структуры, вызванные микробами, регистрирующие древнюю экосистему в формации Дрессера возрастом около 3,48 миллиардов лет, Пилбара, Западная Австралия" . Астробиология . 13 (12): 1103–1124. Bibcode : 2013AsBio..13.1103N . DOI : 10.1089 / ast.2013.1030 . PMC 3870916 . PMID 24205812 .  
  39. ^ Дулиттл, У. Форд (2000). «Искоренение древа жизни» (PDF) . Scientific American . 282 (6): 90–95. Bibcode : 2000SciAm.282b..90D . DOI : 10.1038 / Scientificamerican0200-90 . PMID 10710791 . Архивировано из оригинального (PDF) 7 сентября 2006 года.  
  40. ^ Теобальд, Дуглас Л. (13 мая 2010 г.), «Формальный тест теории универсального общего происхождения» , Nature , 465 (7295): 219–222, Bibcode : 2010Natur.465..219T , doi : 10.1038 / nature09014 , ISSN 0028-0836 , PMID 20463738 , S2CID 4422345 .   
  41. ^ Браун, младший; Дулитл, У. Ф. (1995). «Корень универсального древа жизни, основанный на дупликациях древних генов аминоацил-тРНК синтетазы» . Proc Natl Acad Sci USA . 92 (7): 2441–2445. Bibcode : 1995PNAS ... 92.2441B . DOI : 10.1073 / pnas.92.7.2441 . PMC 42233 . PMID 7708661 .  
  42. ^ Гогартен, JP; Kibak, H .; Dittrich, P .; Таиз, Л .; Bowman, EJ; Боуман, Б.Дж.; Манолсон, MF; и другие. (1989). «Эволюция вакуолярной H + -АТФазы: последствия для происхождения эукариот» . Proc Natl Acad Sci USA . 86 (17): 6661–6665. Bibcode : 1989PNAS ... 86.6661G . DOI : 10.1073 / pnas.86.17.6661 . PMC 297905 . PMID 2528146 .  
  43. ^ Гогартен, JP; Таиз, Л. (1992). "Эволюция АТФаз, перекачивающих протон: укоренение Древа Жизни". Фотосинтез Исследования . 33 (2): 137–146. DOI : 10.1007 / BF00039176 . PMID 24408574 . S2CID 20013957 .  
  44. ^ Грибальдо, S; Каммарано, П. (1998). «Корень универсального древа жизни, полученный из древних дублированных генов, кодирующих компоненты механизма нацеливания на белок». Журнал молекулярной эволюции . 47 (5): 508–516. Bibcode : 1998JMolE..47..508G . DOI : 10.1007 / pl00006407 . PMID 9797401 . S2CID 21087045 .  
  45. ^ Iwabe, Наойуки; Кума, Кей-Ичи; Хасэгава, Масами; Осава, Сёдзо; Источник Мията, Такаши; Хасэгава, Масами; Осава, Сёдзо; Мията, Такаши (1989). «Эволюционное родство архебактерий, эубактерий и эукариот, выведенных из филогенетических деревьев дублированных генов» . Proc Natl Acad Sci USA . 86 (23): 9355–9359. Bibcode : 1989PNAS ... 86.9355I . DOI : 10.1073 / pnas.86.23.9355 . PMC 298494 . PMID 2531898 .  
  46. ^ Бун, Дэвид Р .; Кастенхольц, Ричард В .; Гаррити, Джордж М., ред. (2001). Археи и глубоко ветвление и ФОТОТРОФНАЯ бактерия. Руководство Берджи по систематической бактериологии. Springer. DOI : 10.1007 / 978-0-387-21609-6 . ISBN 978-0-387-21609-6. S2CID  41426624 .[ требуется страница ]
  47. ^ Валас, RE; Борн, ЧП (2011). «Происхождение производного сверхцарства: как грамположительная бактерия пересекла пустыню, чтобы стать археоном» . Биология Директ . 6 : 16. DOI : 10.1186 / 1745-6150-6-16 . PMC 3056875 . PMID 21356104 .  
  48. Перейти ↑ Cavalier-Smith T (2006). «Укоренение древа жизни путем анализа переходов» . Биология Директ . 1 : 19. DOI : 10.1186 / 1745-6150-1-19 . PMC 1586193 . PMID 16834776 .  
  49. ^ Гогартен, JP; Димер, Д. (ноябрь 2016 г.). "Является ли LUCA термофильным предшественником?" . Nat Microbiol . 1 (12): 16229. DOI : 10.1038 / nmicrobiol.2016.229 . PMID 27886195 . S2CID 205428194 .  
  50. ^ Dacks J; Роджер Эй Джей (июнь 1999 г.). «Первая половая линия и актуальность факультативного секса». J. Mol. Evol . 48 (6): 779–783. Bibcode : 1999JMolE..48..779D . DOI : 10.1007 / PL00013156 . PMID 10229582 . S2CID 9441768 .  
  51. ^ Рамеш MA; Малик С.Б .; Логсдон Дж. М. (январь 2005 г.). «Филогеномный перечень мейотических генов; доказательства пола лямблий и раннего эукариотического происхождения мейоза». Curr. Биол . 15 (2): 185–191. DOI : 10.1016 / j.cub.2005.01.003 . PMID 15668177 . S2CID 17013247 .  
  52. ^ Малик SB; Pightling AW; Стефаниак Л.М.; Щурко А.М.; Логсдон Дж. М. (2008). «Расширенный перечень консервативных мейотических генов предоставляет доказательства пола у Trichomonas vaginalis» . PLOS ONE . 3 (8): e2879. Bibcode : 2008PLoSO ... 3,2879M . DOI : 10.1371 / journal.pone.0002879 . PMC 2488364 . PMID 18663385 .  
  53. ^ Lahr DJ; Парфри Л.В.; Mitchell EA; Кац Л.А.; Лара Э (июль 2011 г.). «Целомудрие амеб: переоценка доказательств секса у амебоидных организмов» . Proc. Биол. Sci . 278 (1715): 2081–2090. DOI : 10.1098 / rspb.2011.0289 . PMC 3107637 . PMID 21429931 .  
  54. ^ Чен I; Дубнау Д. (март 2004 г.). «Поглощение ДНК во время бактериальной трансформации». Nat. Rev. Microbiol . 2 (3): 241–249. DOI : 10.1038 / nrmicro844 . PMID 15083159 . S2CID 205499369 .  
  55. ^ Johnsborg O; Эльдхольм V; Ховарштайн Л.С. (декабрь 2007 г.). «Естественная генетическая трансформация: распространенность, механизмы и функции». Res. Microbiol . 158 (10): 767–778. DOI : 10.1016 / j.resmic.2007.09.004 . PMID 17997281 . 
  56. ^ Штат Оклахома - горизонтальный перенос генов
  57. ^ Питер Гогартен. «Горизонтальный перенос генов - новая парадигма биологии» . esalenctr.org . Проверено 20 августа 2011 года .
  58. ^ Гибсона, Дэниел Г .; Benders, Gwynedd A .; Axelroda, Kevin C .; и другие. (2008). «Одностадийная сборка в дрожжах 25 перекрывающихся фрагментов ДНК для формирования полного синтетического генома Mycoplasma genitalium» . PNAS . 105 (51): 20404–20409. Bibcode : 2008PNAS..10520404G . DOI : 10.1073 / pnas.0811011106 . PMC 2600582 . PMID 19073939 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • BBCNews: 27 сентября 2000 г., Когда слизь не такая густая, Читат: «Это означает, что некоторые из низших существ в царстве растений и животных, такие как слизь и амеба, могут быть не такими примитивными, как когда-то считалось»
    • SpaceRef.com, 29 июля 1997 г .: Ученые обнаружили метановых ледяных червей на дне Мексиканского залива
      • Научный колледж Эберли: метановые ледяные черви обнаружены на морском дне Мексиканского залива скачать фотографии качества для публикации
    • Артикель, 2000: Метановые ледяные черви: Hesiocaeca methanicola. Колонизация запасов ископаемого топлива
    • SpaceRef.com, 4 мая 2001 г .: Новое определение «жизни, какой мы ее знаем» Hesiocaeca methanicola В 1997 году Чарльз Фишер, профессор биологии Пенсильванского университета, обнаружил это замечательное существо, живущее на холмах из метанового льда на глубине полумили океана на дно Мексиканского залива.
  • BBCNews, 18 декабря 2002 г., «Космические клопы» выращены в лаборатории Citat: « Bacillus simplex и Staphylococcus pasteuri ... Engyodontium album . Штаммы, культивируемые доктором Уэйнрайтом, оказались устойчивыми к воздействию ультрафиолета - качество, необходимое для выживания в космосе»
  • BBCNews, 19 июня 2003 г., Древний организм бросает вызов эволюции клеток Citat: «Похоже, что эта органелла сохранилась в процессе эволюции от прокариот до эукариот, поскольку присутствует в обоих»
  • Интерактивная программа по общей биологии - BI 04, колледж Святого Ансельма, лето 2003 г.
  • Джейкоб Фельдман: Stramenopila
  • Запись в таксономии NCBI: root
  • Колледж Святого Ансельма: Опрос представителей основных королевств Читат: «Число королевств не решено ... Бактерии представляют проблему своим разнообразием ... Протисты представляют проблему своим разнообразием ...»,
  • Виды 2000 Индексирование известных в мире видов . Задача "Вид 2000" - перечислить все известные виды растений, животных, грибов и микробов на Земле в качестве базового набора данных для исследований глобального биоразнообразия. Он также обеспечит простую точку доступа, позволяющую пользователям связываться отсюда с другими системами данных для всех групп организмов, используя прямые связи видов.
  • Самым большим организмом в мире может быть гриб, покрывающий почти 10 квадратных километров леса в Орегоне, а возраст его может составлять 10500 лет.
  • Древо жизни
  • Частые вопросы детей о жизни и их ответах