Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Ортонаировирус
Vir001485-f1.gif
ONSR.Nairo.Fig2.v3 WEB Dugbe virus.png
Вирион и геном ортонаировируса крымско-конгийской геморрагической лихорадки
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Негарнавирикота
Класс:Ellioviricetes
Заказ:Буньявиралес
Семья:Nairoviridae
Род:Ортонаировирус
Типовой вид
Дугбе ортонаировирус

Ортонаировирус - это род семейства Nairoviridae порядка Bunyavirales, который включает вирусы с кольцевой одноцепочечной РНК с отрицательным смыслом . [2] Он получил свое название от болезни овец Найроби, которая поражает желудочно-кишечный тракт овец и коз. [2] Подавляющее большинство, а возможно, и все вирусы этого рода являются клещевыми вирусами, которые могут иметь хозяина у человека или других позвоночных. [3]

Структура [ править ]

В вирионов на вирусы этого рода имеют сферическую форму. [4] Их размер варьируется от 80 до 120 нм в диаметре, причем 50% их веса приходится на белки, а 20–30% - на липиды. [2] Рибонуклеокапсид является нитчатым, имеет длину около 200–300 нм и ширину около 2–2,5 нм. [2] Эти нуклеокапсиды окружены единой оболочкой, на поверхности которой имеются выступы из гликопротеинов. Эти выступы равномерно покрывают поверхность вириона и имеют длину около 5–10 нм. [2] Они способствуют прикреплению к рецептору хозяина при репликации .

Геном [ править ]

Геном вируса крымско-конго геморрагической лихорадки (CCHFV)

Геномы наировирусов представляют собой одноцепочечные РНК с отрицательным смыслом . Полный геном составляет около 17 100–22 800 нуклеотидов и разделен на три сегмента: большой, средний и маленький. [3] Большой сегмент имеет длину около 11000–14400 нуклеотидов (11–14,4 т.п.н.) и кодирует вирусную полимеразу. [2] [4] Средний сегмент имеет длину около 4 400–6 300 нуклеотидов (4,4–6,3 т.п.н.) и кодирует гликопротеины Gn и Gc. [2] [4] Маленький сегмент имеет длину около 1700-2100 нуклеотидов (1,7-2,1 т.п.н.) и кодирует белок нуклеокапсид . [3] < [2] [4]

Геном имеет на конце повторяющиеся последовательности, причем последовательности повторяются на обоих концах. Концевые нуклеотиды представляют собой нековалентно замкнутую кольцевую РНК, образующую пары оснований . [2] Оба конца 5 'и 3' имеют консервативные области длиной 9 нуклеотидов. Последовательности 5'-конец: UCUCAAAGA и 3'-конец: AGAGUUUCU. [2]

Репликация [ править ]

Жизненный цикл наировируса

Наировирусы прикрепляются к рецептору хозяина с помощью димера гликопротеина Gn-Gc. [4] Затем вирус эндоцитозируется в клетку-хозяин через везикулу . Сегменты рибонуклеокапсида высвобождаются в цитоплазму , начиная транскрипцию . [4] Транскрипция и репликация происходят внутри клетки, и вновь синтезированные вирионы высвобождаются путем отпочкования .

Передача и распространение [ править ]

Члены этого вирусного рода заражают множество различных позвоночных- хозяев и передаются через клещей. [2]

Представителей рода Nairovirus можно встретить по всему миру, где бы ни находились их членистоногие- переносчики и позвоночные-хозяева. [4]

Клиническое значение [ править ]

На сегодняшний день только четыре вируса этого рода признаны патогенами человека:

  • Вирус крымско-конголезской геморрагической лихорадки
  • Вирус Дугбе
  • Вирус Найробийской болезни овец
  • Kasokero вирус.

Пятый - вирус Эрве - также может быть патогенным для человека.

Эволюция [ править ]

Филогенетический анализ показал, что эти вирусы делятся на две основные монофилетические группы: жесткие ( Ixodidae ) и мягкие ( Argasidae ) группы клещевого вектора. [5] Ископаемые и филогенетические данные места жесткого тик-тик мягкого Расхождение 120  миллионов лет назад и 92  миллионов лет назад . Это говорит о том, что найровирусы были связаны с этими клещами более 100 миллионов лет.

Кроме того, наировирусы, переносимые клещами из родов Argas , Carios и Ornithodoros, образуют три отдельные монофилетические линии, что снова подтверждает предположение о совместном видении вируса-хозяина.

Серогруппы твердотельных клещей:

  • Крымско-Конго геморрагическая лихорадка
  • Найробийская болезнь овец
  • Сахалин
  • Тамды

Серогруппы клещей с мягким телом:

  • Хьюз
  • Дера Гази Хан
  • Калюб

Переносчики клещей для серогрупп Kasokero и Thiafora в настоящее время не известны.

Таксономия [ править ]

Ортонаировирус найробийской болезни овец (NSD) является прототипом вируса этого рода. [3] [6] NSD встречается в Восточной и Центральной Африке и вызывает острый геморрагический гастроэнтерит у овец и коз. Род включает 15 видов: [2]

  • Ортонайровирус Арташата
  • Хим ортонаировирус
  • Ортонаировирус крымско-конголезской геморрагической лихорадки
  • Ортонаировирус Дера Гази Хан
  • Дугбе ортонаировирус
  • Эстеро Настоящий ортонаировирус
  • Хазарский ортонаировирус
  • Ортонаировирус Хьюза
  • Kasokero orthonairovirus
  • Кетера ортонаировирус
  • Ортонаировирус найробийской болезни овец
  • Калюб ортонаировирус
  • Сахалинский ортонаировирус
  • Тамды ортонаировирус
  • Тиафора ортонаировирус

Серогруппы [ править ]

Род делится как минимум на девять серогрупп . Серогруппы Хьюза и Сахалина являются родственными группами. Внутри каждой серогруппы имеется ряд связанных вирусов:

Крымско-Конго серогруппа геморрагической лихорадки

Вирус крымско-конголезской геморрагической лихорадки
Вирус Хазара
Вирус тофла

Серогруппа Дера Гази Хан

Вирус Абу Хаммада
Вирус Абу Мина

Серогруппа Хьюза :

Каспий вирус
Фараллон вирус
Вирус Хьюза
Вирус острова Тупик
Вирус Пунте Салинас
Вирус Раза
Вирус Сольдадо
Вирус Zirqa

Kasokero серогруппа

Kasokero вирус
Вирус Леопардс Хилл
Вирус йога

Найробийская серогруппа болезни овец

Вирус Дугбе
Вирус Ганджама
Вирус Купе
Вирус Найробийской болезни овец

Калюб серогруппа

Вирус бандии
Chim вирус
Вирус герани
Калюб вирус

Сахалинская серогруппа

Вирус Авалон
Парамушир вирус
Сахалинский вирус
Вирус тилламук

Тамди серогруппа

Бурана вирус
Вирус Тамди

Тиафора серогруппа

Вирус Эрве
Вирус тиафора

Неклассифицированный

Вирус Ахуна
Вирус Арташат
Бурана вирус
Вирус Госсаса
Иссык-Кульский вирус
Кетера вирус
Вирус Южного залива
Вирус Тамди
Вирус Узун Агач

Ссылки [ править ]

  1. ^ Таксономия вирусов: выпуск 2018 г., EC 50, Вашингтон, округ Колумбия, июль 2018 г., ратификация электронной почты, октябрь 2018 г. (MSL # 33) https://talk.ictvonline.org/taxonomy/
  2. ^ a b c d e f g h i j k l "Отчет ICTV Nairoviridae" .
  3. ^ a b c d Крэбтри, Мэри Б., Розмари Санг и Барри Р. Миллер. «Вирус Купе, новый вирус в семействе Bunyaviridae, род Nairovirus, Кения». Новые инфекционные заболевания 15 (2009): 147–54.
  4. ^ a b c d e f g "Наировирус". Наировирус. Вирусная зона. < http://www.expasy.ch/viralzone/all_by_species/251.html >.
  5. ^ Honig JE, Osborne JC, Nichol ST (2004) Высокая генетическая изменчивость вирусов рода Nairovirus отражает разнообразие их преобладающих клещей-хозяев. Вирусология 318 (1): 10-16
  6. ^ Клеркс, Джон П.М., Хорди Касальс и Дэвид Х.Л. Бишоп. «Структурные характеристики найровирусов (род Nairovirus, Bunyaviridae)». Журнал общей вирусологии 55 (1981): 165–78.

Внешние ссылки [ править ]

  • Отчет ICTV : Nairoviridae
  • Вирусная зона : Наировирус