Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлен с белка P17 )
Перейти к навигации Перейти к поиску

Генома и белки из ВИЧ (вирус иммунодефицита человека) были предметом интенсивных исследований с момента открытия вируса в 1983 г. [1] [2] «В поисках возбудителя, он был первоначально считали , что вирус форма вируса Т-клеточного лейкоза человека (HTLV), который, как было известно в то время, влияет на иммунную систему человека и вызывает определенные лейкемии. Однако исследователи из Института Пастера в Париже выделили у пациентов ранее неизвестный и генетически отличный ретровирус. со СПИДом, который позже был назван ВИЧ ». [3] Каждый вирион включает вирусную оболочку и связанную матрицу, включающуюкапсид , который включает в себя две копии генома одноцепочечной РНК и несколько ферментов . Открытие самого вируса произошло через два года после сообщения о первых серьезных случаях заболеваний, связанных со СПИДом. [4] [5]

Структура [ править ]

Схема ВИЧ
Структура незрелого капсида ВИЧ-1 в интактных вирусных частицах
Диаграмма спайкового белка ВИЧ (зеленый), эпитоп слитого пептида выделен красным цветом, а нейтрализующее антитело в широком смысле (желтый) связывается со слитым пептидом.

Полная последовательность генома ВИЧ-1, выделенная из инфекционных вирионов, была решена с точностью до одного нуклеотида. [6] Геном ВИЧ кодирует небольшое количество вирусных белков, неизменно устанавливая кооперативные ассоциации между белками ВИЧ и между ВИЧ и белками хозяина, чтобы проникнуть в клетки хозяина и захватить их внутренние механизмы. [7] ВИЧ отличается по структуре от других ретровирусов . Вирион ВИЧ имеет диаметр ~ 100 нм. Его самая внутренняя область состоит из конусообразного ядра, которое включает две копии (положительного смысла) генома оцРНК, ферменты обратной транскриптазы, интегразы и протеазы, некоторые второстепенные белки и основной основной белок. [8]Геном вируса иммунодефицита человека (ВИЧ) кодирует 8 вирусных белков, играющих важную роль в жизненном цикле ВИЧ. [7]

ВИЧ-1 состоит из двух копий нековалентно связанной, несплицированной одноцепочечной РНК с положительным смыслом, заключенной в конический капсид, состоящий из вирусного белка p24 , типичного для лентивирусов . [9] [10] Две копии цепей РНК жизненно важны для участия в рекомбинации ВИЧ-1, которая происходит во время обратной транскрипции вирусной репликации. Удержание двух копий одноцепочечной РНК внутри вириона, но образование только одного ДНК-провируса, называется псевдодиплоидией. [11] Компонент РНК 9749 нуклеотидов длиной [12] [13] и несет 5' колпачок (ГПЭС), 3' поли (А) хвости множество открытых рамок считывания (ORF). [14] Вирусные структурные белки кодируются длинными ORF, тогда как меньшие ORF кодируют регуляторы жизненного цикла вируса: прикрепление, слияние мембран, репликацию и сборку. [14]

Одноцепочечная РНК прочно связана с белками нуклеокапсида p7 , белком поздней сборки p6 и ферментами, необходимыми для развития вириона, такими как обратная транскриптаза и интеграза . Лизиновая тРНК является праймером для магний-зависимой обратной транскриптазы. [9] Нуклеокапсид связывается с геномной РНК (одна молекула на гексамер) и защищает РНК от переваривания нуклеазами . В частицу вириона также заключены Vif , Vpr , Nef и вирусная протеаза . [ необходима цитата ][Вирусная оболочка | оболочка]] вириона образована плазматической мембраной, происходящей из клетки-хозяина, которая поддерживается матрицей, состоящей из вирусного белка p17, обеспечивая целостность частицы вириона. На поверхности вириона можно обнаружить ограниченное количество гликопротеина оболочки (Env) ВИЧ, тример, образованный гетеродимерами gp120 и gp41 . Env отвечает за связывание со своим первичным рецептором-хозяином, CD4, и его корецептором (в основном CCR5 или CXCR4 ), что приводит к проникновению вируса в его клетку-мишень. [15]

Будучи единственными белками на поверхности вируса, гликопротеины оболочки (gp120 и gp41) являются основными целями при разработке вакцины против ВИЧ . [16] Более половины массы шипа тримерной оболочки составляют N-связанные гликаны . Плотность высока, поскольку гликаны защищают нижележащий вирусный белок от нейтрализации антителами. Это одна из известных молекул с наиболее плотным гликозилированием, и ее плотность достаточно высока, чтобы предотвратить нормальный процесс созревания гликанов во время биогенеза в эндоплазматическом аппарате и аппарате Гольджи. [17] [18] Таким образом, большинство гликанов застопорились как незрелые «высокоманнозные» гликаны, которые обычно не присутствуют на секретируемых гликопротеинах или гликопротеинах клеточной поверхности человека.[19] Необычная обработка и высокая плотность означают, что почти все широко нейтрализующие антитела, которые были идентифицированы до сих пор (от подгруппы пациентов, которые были инфицированы в течение многих месяцев или лет), связываются с этими оболочками или адаптированы к ним. гликаны. [20]

Молекулярная структура вирусного спайка в настоящее время определена с помощью рентгеновской кристаллографии [21] и криоэлектронной микроскопии. [22] Эти успехи в структурной биологии стали возможными благодаря развитию стабильных рекомбинантных форм вирусного шипа путем введения межсубъединичной дисульфидной связи и мутации изолейцина в пролин в gp41. [23] Так называемые тримеры SOSIP не только воспроизводят антигенные свойства нативного вирусного шипа, но также демонстрируют ту же степень незрелости гликанов, что и нативный вирус. [24]Рекомбинантные тримерные вирусные шипы являются многообещающими кандидатами в вакцины, поскольку они демонстрируют меньше ненейтрализующих эпитопов, чем рекомбинантный мономерный gp120, который подавляет иммунный ответ на целевые эпитопы. [25]

Организация генома [ править ]

Структура РНК-генома ВИЧ-1

ВИЧ имеет несколько основных генов, кодирующих структурные белки, присутствующие во всех ретровирусах, а также несколько неструктурных («дополнительных») генов, уникальных для ВИЧ. [26] Геном ВИЧ содержит девять генов, кодирующих пятнадцать вирусных белков. [27] Они синтезируются как полипротеины, которые продуцируют белки внутренней части вириона, называемые Gag, группоспецифический антиген; вирусные ферменты (Pol, полимераза) или гликопротеины вириона окр (огибающей). [28] В дополнение к этому, ВИЧ кодирует белки, которые также выполняют определенные регуляторные и вспомогательные функции. [28]ВИЧ-1 имеет два важных регуляторных элемента: Tat и Rev и несколько важных дополнительных белков, таких как Nef, Vpr, Vif и Vpu, которые не являются необходимыми для репликации в определенных тканях. [28] Ген gag обеспечивает базовую физическую инфраструктуру вируса, а ген pol обеспечивает основной механизм воспроизводства ретровирусов, в то время как другие помогают ВИЧ проникнуть в клетку-хозяин и усилить ее размножение. Хотя они могут быть изменены мутацией, все эти гены, кроме tev, существуют во всех известных вариантах ВИЧ; см. Генетическая изменчивость ВИЧ . [ необходима цитата ]

ВИЧ использует сложную систему дифференциального сплайсинга РНК для получения девяти различных генных продуктов из генома размером менее 10 килобайт. [29] ВИЧ имеет геномный транскрипт размером 9,2 КБ, который кодирует предшественники gag и pol; однократно сплайсированная мРНК размером 4,5 т.п.н., кодирующая env, Vif, Vpr и Vpu, и многократно сплайсированная мРНК размером 2 т.п.н., кодирующая Tat, Rev и Nef. [29]

Белки, кодируемые геномом ВИЧ
КлассИмя генаПервичные белковые продуктыОбработанные белковые продукты
Структурные белки вирусовкляпПолипротеин рвотного типаMA, CA, SP1, NC, SP2, P6
polПолипротеинRT, РНКаза H, IN, PR
envgp160gp120, gp41
Основные регулирующие элементытатTat
revRev
Дополнительные регуляторные белкинефНеф
впрВпр
vifVif
впуВпу

Структурные белки вирусов [ править ]

Капсид ВИЧ состоит примерно из 200 копий белка p24. Структура p24 показана в двух изображениях: карикатура (вверху) и изоповерхность (внизу).
  • gag (группоспецифический антиген) кодирует предшественник полипротеина gag,который процессируется вирусной протеазой во время созревания до MA ( матричный белок , p17); CA (капсидный белок, p24 ); SP1 (спейсерный пептид 1, p2); NC (нуклеокапсидный белок, p7); SP2 (спейсерный пептид 2, p1) и белок P6. [30]
  • pol кодирует вирусные ферменты обратной транскриптазы (RT) и РНКазы H, интегразы (IN) и протеазы ВИЧ (PR). [28] Протеаза ВИЧ необходима для расщепления предшественника полипротеина Gag для получения структурных белков, ОТ требуется для транскрипции ДНК из матрицы РНК, а ИН необходим для интеграции двухцепочечной вирусной ДНК в геном хозяина. [26]
  • env (от «конверта») кодирует gp160 , который расщепляется протеазой хозяина, фурином , в эндоплазматическом ретикулуме клетки-хозяина. Посттрансляционный процессинг производит поверхностный гликопротеин, gp120 или SU, который прикрепляется крецепторам CD4, присутствующим на лимфоцитах, и gp41 или TM, который внедряется в вирусную оболочку, позволяя вирусу прикрепляться к клеткам-мишеням и сливаться с ними. [26] [30]

Основные регулирующие элементы [ править ]

  • tat (трансактиватор ВИЧ) играет важную роль в регуляции обратной транскрипции РНК вирусного генома, обеспечивая эффективный синтез вирусных мРНК и регулируя высвобождение вирионов из инфицированных клеток. [28] Tat экспрессируется как одноэкзонный Tat из 72 аминокислот, а также как двухэкзонный Tat из 86-101 аминокислоты, и играет важную роль на ранних стадиях ВИЧ-инфекции. Tat (14-15 кДа) связывается с выпуклойвторичной структурой « стебель-петля» геномной РНКоколо 5 'LTR-области, формируя элемент ответа на трансактивацию (TAR) . [9] [28]
  • rev (регулятор экспрессии белков вириона): белок Rev связывается с вирусным геномом через богатый аргинином РНК-связывающий мотив, который также действует как NLS ( сигналы ядерной локализации ), необходимый для транспорта Rev в ядро ​​из цитозоля. во время вирусной репликации. [28] Rev распознает сложную структуру «стебель-петля» мРНК env, расположенную в интроне, разделяющем кодирующий экзон Tat и Rev, известную как элемент ответа HIV Rev (RRE). [9] [28] Rev важен для синтеза основных вирусных белков и, следовательно, необходим для репликации вируса. [ необходима цитата ]

Дополнительные регуляторные белки [ править ]

  • vpr ( лентивирусный белок R): Vpr представляет собой связанный с вирионом, ядерно-цитоплазматический регулирующий белок. [28] Считается, что он играет важную роль в репликации вируса, в частности, в ядерном импорте преинтеграционного комплекса. Vpr также, по-видимому, заставляет свои клетки-хозяева останавливать свой клеточный цикл в фазе G2. Этот арест активирует механизм репарации ДНК хозяина, который может сделать возможной интеграцию вирусной ДНК. [9] ВИЧ-2 и SIV кодируют дополнительный связанный с Vpr белок, называемый Vpx, который функционирует вместе с Vpr. [28]
  • vif - Vif представляет собой высококонсервативный фосфопротеин массой 23 кДа, важный для инфекционности вирионов ВИЧ-1 в зависимости от типа клетки. [9] Было обнаружено, что ВИЧ-1 требуется Vif для синтеза инфекционных вирусов в лимфоцитах, макрофагах и некоторых линиях клеток человека. Похоже, что он не требует Vif для того же процесса в клетках HeLa или COS , среди прочего. [28]
  • nef - Nef, негативный фактор, представляет собой N-концевой миристоилированный мембранно-ассоциированный фосфопротеин. Он участвует во многих функциях цикла репликации вируса. Считается, что он играет важную роль в апоптозе клеток и увеличивает инфекционность вируса. [28]
  • vpu (вирусный белок U) - Vpu специфичен для ВИЧ-1. Это олигомерный интегральный мембранный фосфопротеин класса I с многочисленными биологическими функциями. Vpu участвует вдеградации CD4 с участием убиквитинового протеасомного пути, а также в успешном высвобождении вирионов из инфицированных клеток. [9] [28]
  • tev : Этот ген присутствует только в нескольких изолятах ВИЧ-1. Он представляет собой слияние частей генов tat , env и rev и кодирует белок с некоторыми свойствами tat , но почти или совсем без свойств rev . [31]

Вторичная структура РНК [ править ]

Стеблевая петля pol-1 ВИЧ
Прогнозируемая вторичная структура стержневой петли pol-1 ВИЧ
Идентификаторы
Символpol
РфамRF01418
Прочие данные
Тип РНКСнг
Структуры PDBPDBe

В геноме РНК ВИЧ было идентифицировано несколько консервативных элементов вторичной структуры . Структура 5'UTR состоит из серии структур стержень-петля, соединенных небольшими линкерами. [10] Эти стержневые петли (от 5 'до 3') включают элемент области трансактивации (TAR), 5 'сигнал полиаденилирования [поли (A)], PBS, DIS, основной SD и шпильку ψ. структура, расположенная на 5'-конце генома, и элемент ответа HIV Rev (RRE) внутри гена env. [10] [32] [33] Другой структурой РНК, которая была идентифицирована, является петля 3 ствола gag (GSL3) , которая, как полагают, участвует в упаковке вируса. [34] [35]Было высказано предположение, что вторичные структуры РНК влияют на жизненный цикл ВИЧ, изменяя функцию протеазы ВИЧ и обратной транскриптазы , хотя не всем идентифицированным элементам приписана функция. [ необходима цитата ]

Вторичная структура РНК, определенная с помощью анализа SHAPE , содержит три петли ствола и расположена между генами протеазы ВИЧ и генами обратной транскриптазы. Было показано, что эта цис- регуляторная РНК сохраняется во всем семействе ВИЧ и, как полагают, влияет на жизненный цикл вируса. [36]

V3 loop [ править ]

Петли третьи переменные или петля V3 является частью или область вируса иммунодефицита человека . Петли V3 огибающего гликопротеина в Viron, в gp120 , позволяет ему инфицировать клетки иммунной системы человека путем связывания с цитокиновым рецептором на иммунные клетки мишени человека, такие как CCR5 клетка или CXCR4 клетку, в зависимости от штамма ВИЧ . [37]Гликопротеин оболочки (Env) gp 120/41 необходим для проникновения ВИЧ-1 в клетки. Env служит молекулярной мишенью для лекарства, которое лечат людей с инфекцией ВИЧ-1, и источником иммуногена для разработки вакцины против СПИДа. Однако структура функционального тримера Env остается неуловимой. [38]

См. Также [ править ]

  • Исследования в области ВИЧ / СПИДа

Ссылки [ править ]

  1. ^ Барре-Синусси Ж, Chermann JC, Rey F, Nugeyre МТ, Chamaret S, Gruest Дж, Dauguet С, Axler-Blin С, Vézinet-Брун Ж, Rouzioux С, Розенбаум Вт, Монтанье л (май 1983 г.). «Выделение Т-лимфотропного ретровируса от пациента с риском синдрома приобретенного иммунодефицита (СПИД)» . Наука . 220 (4599): 868–71. Bibcode : 1983Sci ... 220..868B . DOI : 10.1126 / science.6189183 . PMID  6189183 . S2CID  390173 .
  2. ↑ Gallo RC, Sarin PS, Gelmann EP, Robert-Guroff M, Richardson E, Kalyanaraman VS, Mann D, Sidhu GD, Stahl RE, Zolla-Pazner S, Leibowitch J, Popovic M (май 1983). «Выделение вируса Т-клеточного лейкоза человека при синдроме приобретенного иммунодефицита (СПИД)». Наука . 220 (4599): 865–7. Bibcode : 1983Sci ... 220..865G . DOI : 10.1126 / science.6601823 . PMID 6601823 . 
  3. ^ Churi С, Росс МВт (2015). «ВИЧ / СПИД» . В Whelehan P, Bolin A (ред.). Международная энциклопедия сексуальности человека . Вайли. ISBN 9781405190060. OCLC  949701914 .
  4. ^ Центры по контролю за заболеваниями (июнь 1981 г.). «Пневмоцистная пневмония - Лос-Анджелес». MMWR. Еженедельный отчет о заболеваемости и смертности . 30 (21): 250–2. PMID 6265753 . 
  5. ^ Центры по контролю за заболеваниями (CDC) (июль 1981 г.). «Саркома Капоши и пневмоцистная пневмония среди гомосексуальных мужчин - Нью-Йорк и Калифорния» (PDF) . MMWR. Еженедельный отчет о заболеваемости и смертности . 30 (25): 305–8. PMID 6789108 . Архивировано 22 октября 2012 года . Проверено 15 сентября 2017 года .  CS1 maint: неподходящий URL ( ссылка )
  6. ↑ Watts JM, Dang KK, Gorelick RJ, Leonard CW, Bess JW, Swanstrom R, Burch CL, Weeks KM (август 2009). «Архитектура и вторичная структура всего генома РНК ВИЧ-1» . Природа . 460 (7256): 711–6. Bibcode : 2009Natur.460..711W . DOI : 10,1038 / природа08237 . PMC 2724670 . PMID 19661910 .  
  7. ^ a b Li G, De Clercq E (сентябрь 2016 г.). «Белковые ассоциации по всему геному ВИЧ: обзор 30-летних исследований» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 80 (3): 679–731. DOI : 10.1128 / MMBR.00065-15 . PMC 4981665 . PMID 27357278 .  
  8. ^ Синглтон P, Sainsbury D, ред. (2006). «ВИЧ» . Словарь по микробиологии и молекулярной биологии (3-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. ISBN 9780470035450. OCLC  71223221 .
  9. ^ Б с д е е г Монтанье L (1999). «Вирусы иммунодефицита человека (Retroviridae)». Энциклопедия вирусологии (2-е изд.). С. 763–774.
  10. ^ a b c Лу К., Хэн Х, Саммерс М.Ф. (июль 2011 г.). «Структурные детерминанты и механизм упаковки генома ВИЧ-1» . Журнал молекулярной биологии . 410 (4): 609–33. DOI : 10.1016 / j.jmb.2011.04.029 . PMC 3139105 . PMID 21762803 .  
  11. ^ Hwang CK, Svarovskaia Е.С., Pathak В.К. (октябрь 2001). «Динамический выбор копии: устойчивое состояние между полимеразой вируса лейкемии мышей и зависимой от полимеразы активностью РНКазы Н определяет частоту переключения матрицы in vivo» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (21): 12209–14. Bibcode : 2001PNAS ... 9812209H . DOI : 10.1073 / pnas.221289898 . PMC 59793 . PMID 11593039 .  
  12. ^ Wain-Hobson S, Sonigo Р, Данос О, S Коул, Alizon М (январь 1985). «Нуклеотидная последовательность вируса СПИДа, LAV». Cell . 40 (1): 9–17. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (85) 90303-4 . PMID 2981635 . S2CID 33055050 .  
  13. ^ Ратнер Л., Хазелтин В., Патарка Р., Ливак К.Дж., Старчич Б., Джозефс С.Ф., Доран Э.Р., Рафальски Дж. А., Уайтхорн Е.А., Баумейстер К. (1985). «Полная нуклеотидная последовательность вируса СПИДа, HTLV-III». Природа . 313 (6000): 277–84. Bibcode : 1985Natur.313..277R . DOI : 10.1038 / 313277a0 . PMID 2578615 . S2CID 4316242 .  
  14. ^ a b Кастелли JC, Леви A (2002). «ВИЧ (вирус иммунодефицита человека)». Энциклопедия рака . 2 (2-е изд.). п. 407–415.
  15. ^ Checkly М.А., Фрид EO (22 июля 2011). «Биосинтез гликопротеина оболочки ВИЧ-1, торговля и включение» . Журнал молекулярной биологии . 410 (4): 582–608. DOI : 10.1016 / j.jmb.2011.04.042 . PMC 3139147 . PMID 21762802 . Проверено 20 апреля 2021 года .  
  16. ↑ Национальный институт здоровья (17 июня 1998 г.). «Кристаллическая структура ключевого белка ВИЧ открывает новые возможности для профилактики и лечения» (пресс-релиз). Архивировано из оригинального 19 -го февраля 2006 года . Проверено 14 сентября 2006 года .
  17. ^ Беренс AJ, Васильевич S, Причард LK, Харви DJ, Андев RS, Krumm SA, Struwe WB, Cupo A, Kumar A, Zitzmann N, Seabright GE, Kramer HB, Spencer DI, Royle L, Lee JH, Klasse PJ, Burton Д.Р., Уилсон И.А., Уорд А.Б., Сандерс Р.В., Мур Дж.П., Дурс К.Дж., Криспин М. (март 2016 г.). «Состав и антигенные эффекты отдельных гликановых сайтов тримерного гликопротеина оболочки ВИЧ-1» . Отчеты по ячейкам . 14 (11): 2695–706. DOI : 10.1016 / j.celrep.2016.02.058 . PMC 4805854 . PMID 26972002 .  
  18. ^ Притчард Л.К., Спенсер Д.И., Ройл Л., Бономелли С., Сибрайт Г.Е., Беренс А.Дж., Кулп Д.В., Менис С.А., Крамм С.А., Данлоп округ Колумбия, Криспин Д. М (июнь 2015 г.). «Кластеризация гликанов стабилизирует маннозный участок ВИЧ-1 и сохраняет уязвимость для широко нейтрализующих антител» . Nature Communications . 6 : 7479. Bibcode : 2015NatCo ... 6.7479P . DOI : 10.1038 / ncomms8479 . PMC 4500839 . PMID 26105115 .  
  19. ^ Притчард LK, Харви DJ, Bonomelli C, Криспин M, Doores KJ (сентябрь 2015). «Клетки и белки-направленное гликозилирование нативной расщепленной оболочки ВИЧ-1» . Журнал вирусологии . 89 (17): 8932–44. DOI : 10,1128 / JVI.01190-15 . PMC 4524065 . PMID 26085151 .  
  20. ^ Криспин M, Doores KJ (апрель 2015). «Нацеливание гликанов, полученных из хозяина, на вирусы с оболочкой для разработки вакцины на основе антител» . Текущее мнение в вирусологии . Вирусный патогенез • Профилактические и лечебные вакцины. 11 : 63–9. DOI : 10.1016 / j.coviro.2015.02.002 . PMC 4827424 . PMID 25747313 .  
  21. ^ Julien JP, Cupo A, D Sok, Стэнфилд RL, Lyumkis D, Deller MC, Klasse PJ, Burton DR, Sanders RW, Мур JP, Ward AB, Wilson IA (декабрь 2013). «Кристаллическая структура растворимого расщепленного тримера оболочки ВИЧ-1» . Наука . 342 (6165): 1477–83. Bibcode : 2013Sci ... 342.1477J . DOI : 10.1126 / science.1245625 . PMC 3886632 . PMID 24179159 .  
  22. ^ Люмкис Д., Жюльен Дж. П., де Валь Н., Купо А., Поттер С. С., Класс П. Дж., Бертон Д. Р., Сандерс Р. В., Мур Дж. П., Каррагер Б., Уилсон И. А., Уорд А.Б. «Крио-ЭМ структура полностью гликозилированного растворимого расщепленного тримера оболочки ВИЧ-1» . Наука . 342 (6165): 1484–90. Bibcode : 2013Sci ... 342.1484L . DOI : 10.1126 / science.1245627 . PMC 3954647 . PMID 24179160 .  
  23. ^ Сандерс RW, Derking R, Cupo A, Julien JP, Yasmeen A, de Val N, Kim HJ, Blattner C, de la Peña AT, Korzun J, Golabek M, de Los Reyes K, Ketas TJ, van Gils MJ, King CR, Уилсон IA, Ward AB, Klasse PJ, Moore JP (сентябрь 2013 г.). «Расщепленный растворимый тример Env ВИЧ-1 нового поколения, BG505 SOSIP.664 gp140, экспрессирует несколько эпитопов для широко нейтрализующих, но не ненейтрализующих антител» . PLOS Патогены . 9 (9): e1003618. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1003618 . PMC 3777863 . PMID 24068931 .  
  24. ^ Притчард LK, Vasiljevic S, Ozorowski G, Сибрайт GE, Cupo A, Ринге R, Ким HJ, Sanders RW, Doores KJ, Burton DR, Wilson IA, Уорд AB, Мур JP, Криспин M (июнь 2015). «Структурные ограничения определяют гликозилирование тримеров оболочки ВИЧ-1» . Отчеты по ячейкам . 11 (10): 1604–13. DOI : 10.1016 / j.celrep.2015.05.017 . PMC 4555872 . PMID 26051934 .  
  25. ^ de Taeye SW, Ozorowski G, Torrents de la Peña A, Guttman M, Julien JP, van den Kerkhof TL, Burger JA, Pritchard LK, Pugach P, Yasmeen A, Crampton J, Hu J, Bontjer I, Torres JL, Arendt H, ДеСтефано Дж., Кофф У. К., Шуйтмейкер Х., Эггинк Д., Беркхаут Б., Дин Х, Лабранш С., Кротти С., Криспин М., Монтефиори Д. К., Класс PJ, Ли К. К., Мур Дж. П., Уилсон И. А., Уорд А. Б., Сандерс Р. В. Декабрь 2015 г.). «Иммуногенность стабилизированных тримеров оболочки ВИЧ-1 с пониженным воздействием ненейтрализующих эпитопов» . Cell . 163 (7): 1702–15. DOI : 10.1016 / j.cell.2015.11.056 . PMC 4732737 . PMID 26687358 .  
  26. ^ a b c Мушахвар И.К. (2007). «Вирусы иммунодефицита человека: молекулярная вирусология, патогенез, диагностика и лечение». Перспективы медицинской вирусологии . 13 : 75–87. DOI : 10.1016 / S0168-7069 (06) 13005-0 . ISBN 9780444520739.
  27. ^ Li G, Piampongsant S, NR Фариа, Voet A, Пинеда-Пенья AC, Хури R, Lemey P, Vandamme AM, Theys K (февраль 2015). «Интегрированная карта вариаций генома ВИЧ с точки зрения популяции» . Ретровирология . 12 (1): 18. DOI : 10,1186 / s12977-015-0148-6 . PMC 4358901 . PMID 25808207 .  
  28. ^ Б с д е е г ч я J к л м Votteler Дж, Шуберта U (2008). «Вирусы иммунодефицита человека: молекулярная биология». Энциклопедия вирусологии (3-е изд.). С. 517–525.
  29. ^ а б Файнберг Марк Б., Грин Уорнер С (1992). «Молекулярные взгляды на патогенез вируса иммунодефицита человека 1 типа». Текущее мнение в иммунологии . 4 (4): 466–474. DOI : 10.1016 / s0952-7915 (06) 80041-5 . PMID 1356348 . 
  30. ^ а б Король Стивен Р. (1994). «ВИЧ: вирусология и механизмы заболевания». Летопись неотложной медицины . 24 (3): 443–449. DOI : 10.1016 / s0196-0644 (94) 70181-4 . PMID 7915889 . 
  31. ^ Бенко DM, Schwartz S, Pavlakis GN, Фельбер BK (июнь 1990). «Новый белок вируса иммунодефицита человека типа 1, tev, имеет общие последовательности с белками tat, env и rev» . Журнал вирусологии . 64 (6): 2505–18. DOI : 10,1128 / JVI.64.6.2505-2518.1990 . PMC 249426 . PMID 2186172 .  
  32. ^ Berkhout B (январь 1992). «Структурные особенности TAR РНК вирусов иммунодефицита человека и обезьян: филогенетический анализ» . Исследования нуклеиновых кислот . 20 (1): 27–31. DOI : 10.1093 / NAR / 20.1.27 . PMC 310321 . PMID 1738599 .  
  33. ^ Paillart JC, Скрипкин E, Эресман B, C Эресман, Marquet R (февраль 2002). «Доказательства in vitro длинного псевдоузла в 5'-нетранслируемых и матричных кодирующих областях геномной РНК ВИЧ-1» . Журнал биологической химии . 277 (8): 5995–6004. DOI : 10.1074 / jbc.M108972200 . PMID 11744696 . 
  34. ^ Дамгаард СК, Андерсен Е.С., Нудсен В, Городкин J, J Kjems (февраль 2004 г.). «РНК-взаимодействия в 5'-области генома ВИЧ-1». Журнал молекулярной биологии . 336 (2): 369–79. DOI : 10.1016 / j.jmb.2003.12.010 . PMID 14757051 . 
  35. ^ Rong L, Russell RS, Ху J, Laughrea М, Вайнберг М., Liang C (сентябрь 2003). «Делеция« стебель-петля 3 »компенсируется мутациями второго сайта в белке Gag вируса иммунодефицита человека 1 типа». Вирусология . 314 (1): 221–8. DOI : 10.1016 / S0042-6822 (03) 00405-7 . PMID 14517075 . 
  36. Перейти ↑ Wang Q, Barr I, Guo F, Lee C (декабрь 2008 г.). «Доказательства новой вторичной структуры РНК в кодирующей области гена pol ВИЧ-1» . РНК . 14 (12): 2478–88. DOI : 10,1261 / rna.1252608 . PMC 2590956 . PMID 18974280 .  
  37. ^ «Взаимодействие петли gp120 V3 различных штаммов ВИЧ-1 с мощным человеческим моноклональным антителом против ВИЧ 447-52D» . Институт Вейцмана: Отдел структурной биологии . Архивировано из оригинала на 2007-07-18 . Проверено 18 апреля 2017 .
  38. ↑ Takeda S, Takizawa M, Miyauchi K, Urano E, Fujino M, Murakami T, Murakami T, Komano J (июнь 2016). «Конформационные свойства третьей вариабельной петли гликопротеина оболочки ВИЧ-1AD8 в лигандированных условиях». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 475 (1): 113–8. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2016.05.051 . PMID 27178216 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • Вход rfam для стержневой петли pol-1 ВИЧ
  • 3D-модель полного вириона ВИЧ1
  • Лю Дж., Райт Э.Р., Винклер Х. (2010). «3D-визуализация вирионов ВИЧ с помощью криоэлектронной томографии». Крио-ЭМ, часть C: анализ, интерпретация и тематические исследования . Методы в энзимологии. 483 . С. 267–90. DOI : 10.1016 / S0076-6879 (10) 83014-9 . ISBN 9780123849939. PMC  3056484 . PMID  20888479 .