Эта статья была обновлена ​​внешним экспертом в рамках модели двойной публикации. Соответствующая рецензируемая статья опубликована в журнале Gene. Щелкните для просмотра.
Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
PAX3
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3CMY

Идентификаторы
ПсевдонимыРах3 , CDHS, HUP2, WS1, WS3, Pax3, парные коробки 3
Внешние идентификаторыOMIM : 606597 MGI : 97487 HomoloGene : 22494 GeneCards : Рах3
Расположение гена ( человек )
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человека) [1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение PAX3
Геномное расположение PAX3
Группа2q36.1Начинать222 199 888 п.н. [1]
Конец222 298 996 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 1 (мышь)
Chr.Хромосома 1 (мышь) [2]
Хромосома 1 (мышь)
Геномное расположение PAX3
Геномное расположение PAX3
Группа1 C4 | 1 39,79 смНачинать78 101 267 п.н. [2]
Конец78 197 134 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE PAX3 207680 x в формате fs.png

PBB GE PAX3 216059 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• домен ГМГ окно связывания
• ДНК связывания
• GO: связывание 0001948 белок
• последовательность ДНК-специфическое связывание
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающую активность фактора транскрипции
• GO: 0001200, GO: 0001133 , GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II
Сотовый компонент• ядро клетки
• нуклеоплазма
Биологический процесс• морфогенез органов животных
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• развитие многоклеточных организмов
• развитие мышечных органов
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• сенсорное восприятие звука
• транскрипция, ДНК-шаблон
• нервная система развитие
• положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• апоптотический процесс
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

5077

18505

Ансамбль

ENSG00000135903

ENSMUSG00000004872

UniProt

P23760

P24610

RefSeq (мРНК)
NM_000438
NM_001127366
NM_013942
NM_181457
NM_181458

NM_181459
NM_181460
NM_181461

NM_001159520
NM_008781

RefSeq (белок)
NP_000429
NP_001120838
NP_039230
NP_852122
NP_852123

NP_852124
NP_852125
NP_852126
NP_852122.1

NP_001152992
NP_032807

Расположение (UCSC)Chr 2: 222,2 - 222,3 МбChr 1: 78,1 - 78,2 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Рах3 (ген коробки в паре 3) ген кодирует член парной коробки или PAX семейства факторов транскрипции . [5] Семейство PAX состоит из девяти человек (PAX1-PAX9) и девяти мышей (Pax1-Pax9) членов, разделенных на четыре подсемейства. PAX3 человека и Pax3 мыши присутствуют в подсемействе вместе с высокогомологичными генами PAX7 человека и Pax7 мыши. Ген PAX3 человека расположен в хромосомной области 2q36.1 и содержит 10 экзонов в области 100 т.п.н.

Склейка стенограммы [ править ]

Альтернативный сплайсинг и процессинг генерируют несколько изоформ PAX3 , которые были обнаружены на уровне мРНК. [6]PAX3e является самой длинной изоформой и состоит из 10 экзонов, кодирующих белок из 505 аминокислот. У других видов млекопитающих, включая мышь, самые длинные мРНК соответствуют изоформам PAX3c и PAX3d человека, которые состоят из первых 8 или 9 экзонов гена PAX3 соответственно. Более короткие изоформы PAX3 включают мРНК, которые пропускают экзон 8 (PAX3g и PAX3h), и мРНК, содержащие 4 или 5 экзонов (PAX3a и PAX3b). В ограниченных исследованиях, сравнивающих экспрессию изоформ, PAX3d экспрессируется на самых высоких уровнях. С функциональной точки зрения PAX3c, PAX3d и PAX3h стимулируют такие активности, как рост клеток, тогда как PAX3e и PAX3g ингибируют эти активности, а PAX3a и PAX3b не проявляют активности или ингибируют эти конечные точки.

Обычный альтернативный сплайс, затрагивающий мРНК PAX3, включает последовательность CAG на 5'-конце экзона 3. [7] Это сплайсинг либо включает, либо исключает эти три основания, что приводит к присутствию или отсутствию остатка глутамина в парном бокс-мотиве. . Ограниченные исследования секвенирования полноразмерных кДНК человека идентифицировали это событие сплайсинга как вариант изоформы PAX3d, и эта сплайсированная изоформа была отдельно названа изоформой PAX3i. Q + и Q- изоформы PAX3 обычно коэкспрессируются в клетках. На функциональном уровне изоформа Q + демонстрирует такое же или меньшее связывание с ДНК и активацию транскрипции, чем изоформа Q-.

Структура и функции белков [ править ]

Структура гена PAX3 , мРНК и белка. Экзоны на диаграммах ДНК и мРНК пронумерованы, а горизонтальная стрелка на диаграмме ДНК показывает промотор и направление транскрипции. Стартовый и стоп-кодоны показаны на диаграмме мРНК вертикальными стрелками. Консервативные области обозначены открытыми прямоугольниками на диаграмме белков, а функциональные домены обозначены жирными горизонтальными линиями над диаграммой белков. Типичные размеры показаны тонкими сегментами горизонтальной линии на диаграммах ДНК, мРНК и белков. Сокращения: PB - домен парного бокса; HD, гомеодомен; PST, богатая пролином, серином и треонином область; DBD, ДНК-связывающий домен; TAD, домен активации транскрипции.

PAX3 кодирует фактор транскрипции с N-концевым ДНК-связывающим доменом, состоящим из парного бокса (PD), кодируемого экзонами 2, 3 и 4, и октапептида и полного гомеодомена (HD), кодируемого экзонами 5 и 6. [8] Кроме того, белок PAX3 имеет С-концевой домен активации транскрипции, кодируемый экзонами 7 и 8. Высококонсервативный PD состоит из 128 аминокислотной области, которая связывается с последовательностями ДНК, относящимися к мотиву TCACGC / G. [9] Мотив HD обычно состоит из 60 аминокислот и связывается с последовательностями, содержащими основной мотив TAAT. [10] Комбинация этих двух ДНК-связывающих доменов позволяет белку PAX3 распознавать более длинные последовательности, содержащие сайты связывания PD и HD. [11]На С-конце PAX3 находится богатая пролином, серином и треонином (PST) область размером 78 аминокислот, которая стимулирует транскрипционную активность. [12] Существуют также домены репрессии транскрипции в HD и N-концевой области (включая первую половину PD), которые репрессируют C-концевой домен активации транскрипции. [13]

PAX3 действует как активатор транскрипции для большинства генов-мишеней, но также может репрессировать меньшее подмножество генов-мишеней. [14] Эти изменения экспрессии осуществляются путем связывания PAX3 со специфическими сайтами узнавания, которые расположены в различных местах генома. [15]Некоторые сайты связывания расположены в генах-мишенях или рядом с ними, например, 5'-промотор, первый интрон и 3'-нетранслируемая область. Значительное количество сайтов связывания PAX3 расположено на больших расстояниях выше и ниже целевых генов. Среди генов-мишеней PAX3 есть одна группа, связанная с развитием мышц, а вторая группа - с развитием нервных клеток и меланоцитов. Белки, кодируемые этими генами-мишенями, регулируют различные функциональные активности в этих клонах, включая дифференцировку, пролиферацию, миграцию, адгезию и апоптоз.

PAX3 взаимодействует с другими ядерными белками, которые модулируют транскрипционную активность PAX3. Димеризация PAX3 с другой молекулой PAX3 или молекулой PAX7 позволяет связываться с палиндромным сайтом связывания HD (TAATCAATTA). [16] Взаимодействие PAX3 с другими факторами транскрипции (такими как SOX10) или факторами хроматина (такими как PAX3 / 7BP) делает возможной синергическую активацию генов-мишеней PAX3. [17] [18] Напротив, связывание PAX3 с корепрессорами, такими как кальмирин, ингибирует активацию генов-мишеней PAX3. [19] Эти ко-репрессоры могут функционировать, изменяя структуру хроматина в генах-мишенях, ингибируя распознавание PAX3 его сайта связывания ДНК или напрямую изменяя транскрипционную активность PAX3.

Наконец, экспрессия и функция белка PAX3 могут модулироваться посттрансляционными модификациями. PAX3 может фосфорилироваться по серинам 201, 205 и 209 с помощью киназ, таких как GSK3b, что в некоторых случаях увеличивает стабильность белка PAX3. [20] [21] Кроме того, PAX3 может также подвергаться убиквитинированию и ацетилированию по лизинам 437 и 475, что регулирует стабильность и функцию белка. [22] [23]

Таблица 1. Типичные гены-мишени транскрипции PAX3.

Категория белкаИмяФенотипическая активность
Молекула клеточной адгезииNRCAMМежклеточная адгезия
Хемокиновый рецепторCXCR4Подвижность
Рецепторная тирозинкиназаFGFR4Распространение, дифференциация, миграция
ВСТРЕТИЛИСЬРаспространение, миграция, выживание
RETРаспространение, миграция, дифференциация
Фактор транскрипцииMITFДифференциация, распространение, выживание
MYF5Дифференциация
MYOD1Дифференциация

Выражение во время разработки [ править ]

Во время развития одним из основных клонов, экспрессирующих Pax3 [24], является клон скелетных мышц. [25] Экспрессия Pax3 сначала наблюдается в пресомитической параксиальной мезодерме, а затем в конечном итоге ограничивается дермомиотомом., который формируется из дорсальной области сомитов. Чтобы сформировать скелетные мышцы в центральных сегментах тела, экспрессирующие PAX3 клетки отделяются от дермомиотома, а затем экспрессия Pax3 отключается, когда активируется экспрессия Myf5 и MyoD1. Чтобы сформировать другие скелетные мышцы, экспрессирующие Pax3 клетки отделяются от дермомиотома и мигрируют в более отдаленные места, такие как конечности и диафрагма. Подмножество этих Pax3-экспрессирующих клеток, происходящих из дермомиотома, также служит в качестве постоянного пула предшественников для роста скелетных мышц во время развития плода. На более поздних стадиях развития миогенные предшественники, экспрессирующие Pax3 и / или Pax7, образуют сателлитные клетки в скелетных мышцах, которые вносят вклад в послеродовой рост мышц и регенерацию мышц. Эти взрослые сателлитные клетки остаются неподвижными до тех пор, пока не произойдет повреждение,а затем стимулируются к разделению и регенерации поврежденной мышцы.

Pax3 также участвует в развитии нервной системы. [26] Экспрессия Pax3 сначала обнаруживается в дорсальной области нервной бороздки, и по мере того, как эта нервная бороздка углубляется, образуя нервную трубку, Pax3 экспрессируется в дорсальной части нервной трубки. По мере увеличения нервной трубки экспрессия Pax3 локализуется в пролиферативных клетках во внутренней желудочковой зоне, а затем эта экспрессия отключается, поскольку эти клетки мигрируют в более поверхностные области. Pax3 экспрессируется по длине нервной трубки и на большей части развивающегося мозга, и эта экспрессия впоследствии отключается на более поздних стадиях развития в ростральном и каудальном направлении.

Во время раннего развития экспрессия Pax3 также происходит на латеральном и заднем краях нервной пластинки, которая является областью, из которой возникает нервный гребень . [27] Pax3 позже экспрессируется различными типами клеток и структурами, возникающими из нервного гребня, такими как меланобласты, предшественники шванновских клеток и ганглии задних корешков. Кроме того, экспрессирующие Pax3 клетки, происходящие из нервного гребня, вносят вклад в формирование других структур, таких как внутреннее ухо, нижняя челюсть и верхняя челюсть. [28]

Мутации зародышевой линии при болезни [ править ]

Мутации зародышевой линии гена Pax3 вызывают пятнистый фенотип у мышей. [29] [30]На молекулярном уровне этот фенотип вызывается точечными мутациями или делециями, которые изменяют или отменяют транскрипционную функцию Pax3. В гетерозиготном состоянии фенотип пятнистости характеризуется белыми пятнами на животе, хвосте и лапах. Эти белые пятна объясняются локальным дефицитом пигмент-образующих меланоцитов в результате дефектов клеток нервного гребня. В гомозиготном состоянии эти мутации Pax3 вызывают эмбриональную летальность, которая связана с выраженными дефектами закрытия нервной трубки и аномалиями структур, производных нервного гребня, таких как меланоциты, ганглии задних корешков и кишечные ганглии. Пороки развития сердца также возникают в результате потери клеток нервного гребня сердца, которые обычно способствуют оттоку сердца и иннервации сердца. Ну наконец то,мускулатура конечностей не развивается у гомозигот, а осевая мускулатура демонстрирует различные отклонения. Эти миогенные эффекты вызваны повышенной гибелью клеток миогенных предшественников в дермомиотоме и уменьшением миграции из дермомиотома.

Зародышевая линия мутация гена Рах3 происходит в человеческой болезни синдроме Waardenburg , [31] , который состоит из четырех аутосомно - доминантных генетических нарушений (WS1, WS2, WS3 и WS4). [32]Из четырех подтипов WS1 и WS3 обычно вызываются мутациями PAX3. Все четыре подтипа характеризуются потерей слуха, аномалиями глаз и нарушениями пигментации. Кроме того, WS1 часто ассоциируется с изменением средней зоны лица, называемым dystopia canthorum, тогда как WS3 (синдром Кляйна-Ваарденбурга) часто отличается скелетно-мышечными аномалиями, поражающими верхние конечности. Большинство случаев WS1 вызвано гетерозиготными мутациями PAX3, тогда как WS3 вызывается либо частичной или полной делецией PAX3 и смежных генов, либо меньшими мутациями PAX3 в гетерозиготном или гомозиготном состоянии. Эти мутации PAX3 в WS1 и WS3 включают бессмысленные, бессмысленные и сплайсинговые мутации; небольшие прошивки; и мелкие или крупные делеции. Хотя эти изменения обычно не повторяются,мутации обычно происходят в экзонах 2-6, причем наиболее распространены мутации экзона 2. Поскольку эти экзоны кодируют парный бокс и гомеодомен, эти мутации часто влияют на функцию связывания ДНК.

Мутации при раке человека [ править ]

Альвеолярная рабдомиосаркома (ARMS) - это агрессивная саркома мягких тканей, которая встречается у детей и обычно характеризуется повторяющейся хромосомной транслокацией t (2; 13) (q35; q14). [33] [34] Эта транслокация 2; 13 разрывает и воссоединяет части генов PAX3 и FOXO1 с образованием слитого гена PAX3-FOXO1, который экспрессирует слитый транскрипт PAX3-FOXO1, кодирующий слитый белок PAX3-FOXO1. [35]PAX3 и FOXO1 кодируют факторы транскрипции, и транслокация приводит к слиянию фактора транскрипции, содержащего N-концевой ДНК-связывающий домен PAX3 и C-концевой домен трансактивации FOXO1. Меньшая подгруппа случаев ARMS связана с менее распространенными слияниями PAX7 с FOXO1 или редкими слияниями PAX3 с другими факторами транскрипции, такими как NCOA1. [36] [37] По сравнению с белком PAX3 дикого типа слитый белок PAX3-FOXO1 более эффективно активирует гены-мишени PAX3. [13] В клетках ARMS PAX3-FOXO1 обычно действует как активатор транскрипции и чрезмерно увеличивает экспрессию последующих генов-мишеней. [38] [39]Кроме того, PAX3-FOXO1 связывается вместе с MYOD1, MYOG и MYCN, а также со структурными белками хроматина, такими как CHD4 и BRD4, чтобы способствовать образованию суперэнхансеров в непосредственной близости от подмножества этих генов-мишеней. [40] Эти нерегулируемые гены-мишени способствуют онкогенезу, изменяя сигнальные пути, которые влияют на пролиферацию, гибель клеток, миогенную дифференцировку и миграцию.

Хромосомная транслокация t (2; 4) (q35; q31.1), которая объединяет гены PAX3 и MAML3, встречается при бифенотипической синоназальной саркоме (BSNS), низкосортном злокачественном новообразовании взрослых, связанном как с миогенной, так и с нервной дифференцировкой. [41] MAML3 кодирует коактиватор транскрипции, участвующий в передаче сигналов Notch. Слияние PAX3-MAML3 сопоставляет N-концевой домен связывания ДНК PAX3 с C-концевым доменом трансактивации MAML3 для создания еще одного мощного активатора генов-мишеней с сайтами связывания PAX3. Следует отметить, что PAX3 перестраивается без участия MAML3 в меньшем подмножестве случаев BSNS, и некоторые из этих вариантов случаев содержат слияние PAX3-NCOA1 или PAX3-FOXO1. [42] [43]Хотя слияния PAX3-FOXO1 и PAX3-NCOA1 могут формироваться как в ARMS, так и в BSNS, существуют различия в паттерне активированных нижестоящих генов-мишеней, предполагая, что клеточная среда играет важную роль в модуляции продукции этих факторов транскрипции слияния.

Помимо опухолей с генами слияния, связанных с PAX3, существует несколько других категорий опухолей, которые экспрессируют ген PAX3 дикого типа. Присутствие экспрессии PAX3 в некоторых опухолях можно объяснить их происхождением от онтогенетических клонов, обычно экспрессирующих PAX3 дикого типа. Например, PAX3 экспрессируется при раковых заболеваниях, связанных с клонами, происходящими от нервной трубки (например, глиобластома), клонами, происходящими из нервного гребня (например, меланомой), и миогенными клонами (например, эмбриональной рабдомиосаркомой). [44] [45] [46] [47] Однако PAX3 также экспрессируется при других типах рака без четкой связи с PAX3-экспрессирующими линиями развития, такими как карцинома груди и остеосаркома. [48] [49]В этих злокачественных опухолях, экспрессирующих PAX3 дикого типа, функция PAX3 влияет на контроль пролиферации, апоптоза, дифференцировки и подвижности. [44] [45] Таким образом, PAX3 дикого типа играет регулирующую роль в онкогенезе и прогрессировании опухолей, что может быть связано с его ролью в нормальном развитии.

Примечания [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000135903 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004872 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Стюарт ET, Kioussi C, Gruss P (1994). «Гены Pax млекопитающих». рассмотрение. Ежегодный обзор генетики . 28 : 219–36. DOI : 10.1146 / annurev.ge.28.120194.001251 . PMID 7893124 . 
  6. Перейти ↑ Wang Q, Fang WH, Krupinski J, Kumar S, Slevin M, Kumar P (декабрь 2008 г.). «Гены Pax в эмбриогенезе и онкогенезе» . рассмотрение. Журнал клеточной и молекулярной медицины . 12 (6A): 2281–94. DOI : 10.1111 / j.1582-4934.2008.00427.x . PMC 4514106 . PMID 18627422 .  
  7. ^ Vogan KJ, Андерхилл Д.А., Gros P (декабрь 1996). «Альтернативное событие сплайсинга в парном домене Pax-3 идентифицирует линкерную область как ключевой детерминант ДНК-связывающей активности парного домена» . начальный. Молекулярная и клеточная биология . 16 (12): 6677–86. DOI : 10.1128 / mcb.16.12.6677 . PMC 231670 . PMID 8943322 .  
  8. ^ Baldwin CT, Гот CF, Macina RA, Milunsky A (август 1995). «Мутации в PAX3, которые вызывают синдром Ваарденбурга типа I: десять новых мутаций и обзор литературы». рассмотрение. Американский журнал медицинской генетики . 58 (2): 115–22. DOI : 10.1002 / ajmg.1320580205 . PMID 8533800 . 
  9. ^ Июня S, Desplan C (сентябрь 1996). «Кооперативные взаимодействия между парным доменом и гомеодоменом». начальный. Развитие . 122 (9): 2639–50. PMID 8787739 . 
  10. ^ Уилсон D, G Шэн, Lecuit Т, Dostatni Н, Desplan С (ноябрь 1993 года). «Кооперативная димеризация гомео доменов парного класса на ДНК» . начальный. Гены и развитие . 7 (11): 2120–34. DOI : 10,1101 / gad.7.11.2120 . PMID 7901121 . 
  11. ^ Фелан SA, Loeken MR (июль 1998). «Идентификация нового связывающего мотива для парного домена Pax-3 и необычные характеристики расстояния между двудольными элементами узнавания при связывании и активации транскрипции» . начальный. Журнал биологической химии . 273 (30): 19153–9. DOI : 10.1074 / jbc.273.30.19153 . PMID 9668101 . 
  12. ^ Bennicelli JL, Фредерикс WJ, Уилсон РБ, Рошер FJ, Барр FG (июль 1995). «Белок PAX3 дикого типа и слитый белок PAX3-FKHR альвеолярной рабдомиосаркомы содержат мощные, структурно разные домены активации транскрипции». начальный. Онкоген . 11 (1): 119–30. PMID 7624119 . 
  13. ^ а б Бенничелли Дж. Л., Эдвардс Р. Х., Барр Ф. Г. (май 1996 г.). «Механизм транскрипционного усиления функции в результате хромосомной транслокации в альвеолярной рабдомиосаркоме» . начальный. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (11): 5455–9. DOI : 10.1073 / pnas.93.11.5455 . PMC 39267 . PMID 8643596 .  
  14. ^ Mayanil CS, George D, L Freilich, Miljan EJ, Маня-Farnell B, McLone DG, Bremer EG (декабрь 2001). «Анализ микроматрицы обнаруживает новые гены-мишени нижестоящего Pax3» . начальный. Журнал биологической химии . 276 (52): 49299–309. DOI : 10.1074 / jbc.M107933200 . PMID 11590174 . 
  15. ^ Сулеймани В.Д., Панч В.Г., Кавабе Ю., Джонс А.Э., Палидвор Г.А., Портер С.Дж., Кросс Дж.В., Карвахал Дж.Дж., Коккс К.Э., ван Эйкен В.Ф., Перкинс Т.Дж., Ригби П.В., Гросвельд Ф., Рудницки М.А. (июнь 2012 г.). «Транскрипционное преобладание Pax7 в миогенезе взрослых обусловлено высокоаффинным распознаванием мотивов гомеодомена» . начальный. Клетка развития . 22 (6): 1208–20. DOI : 10.1016 / j.devcel.2012.03.014 . PMC 3376216 . PMID 22609161 .  
  16. ↑ Schäfer BW, Czerny T, Bernasconi M, Genini M, Busslinger M (ноябрь 1994 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика кДНК PAX-7 человека, экспрессируемой в нормальных и неопластических миоцитах» . начальный. Исследования нуклеиновых кислот . 22 (22): 4574–82. DOI : 10.1093 / NAR / 22.22.4574 . PMC 308503 . PMID 7527137 .  
  17. Перейти ↑ Lang D, Epstein JA (апрель 2003 г.). «Sox10 и Pax3 физически взаимодействуют, опосредуя активацию консервативного энхансера c-RET» . начальный. Молекулярная генетика человека . 12 (8): 937–45. DOI : 10,1093 / HMG / ddg107 . PMID 12668617 . 
  18. ↑ Diao Y, Guo X, Li Y, Sun K, Lu L, Jiang L, Fu X, Zhu H, Sun H, Wang H, Wu Z (август 2012). «Pax3 / 7BP представляет собой Pax7- и Pax3-связывающий белок, который регулирует пролиферацию клеток-предшественников мышечной ткани с помощью эпигенетического механизма» . начальный. Стволовая клетка . 11 (2): 231–41. DOI : 10.1016 / j.stem.2012.05.022 . PMID 22862948 . 
  19. ^ Hollenbach AD, McPherson CJ, Лагутина I, Grosveld G (апрель 2002). «Кальмирин, связывающий кальций, белок EF-hand, ингибирует транскрипционную и ДНК-связывающую активность Pax3». начальный. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1574 (3): 321–8. DOI : 10.1016 / s0167-4781 (02) 00230-0 . PMID 11997098 . 
  20. Перейти ↑ Dietz KN, Miller PJ, Iyengar AS, Loupe JM, Hollenbach AD (июнь 2011 г.). «Идентификация серинов 201 и 209 как сайтов фосфорилирования Pax3 и измененного статуса фосфорилирования Pax3-FOXO1 во время ранней миогенной дифференцировки» . начальный. Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 43 (6): 936–45. DOI : 10.1016 / j.biocel.2011.03.010 . PMC 3095663 . PMID 21440083 .  
  21. ^ Kubic JD, Маскаренхас JB, Иизука T, Wolfgeher D, Lang D (август 2012). «GSK-3 способствует выживанию клеток, росту и уровням PAX3 в клетках меланомы человека» . начальный. Молекулярное исследование рака . 10 (8): 1065–76. DOI : 10.1158 / 1541-7786.MCR-11-0387 . PMC 3422428 . PMID 22679108 .  
  22. ^ Буте SC, Disatnik MH, Chan LS, Иори K, Rando TA (июль 2007). «Регулирование Pax3 протеасомной деградацией моноубиквитинированного белка в предшественниках скелетных мышц» . начальный. Cell . 130 (2): 349–62. DOI : 10.1016 / j.cell.2007.05.044 . PMID 17662948 . 
  23. ^ Ichi S, Boshnjaku В, Shen YW, мания-Фарнелл В, Ahlgren S, S Сапру, Mansukhani N, McLone Д.Г., Томита Т, Mayanil CS (февраль 2011). «Роль ацетилирования Pax3 в регуляции Hes1 и Neurog2» . начальный. Молекулярная биология клетки . 22 (4): 503–12. DOI : 10,1091 / mbc.E10-06-0541 . PMC 3038648 . PMID 21169561 .  
  24. ^ Обзор Pax 3
  25. ^ Букингемский M, Relaix F (2007). «Роль генов Pax в развитии тканей и органов: Pax3 и Pax7 регулируют функции клеток-предшественников мышц». рассмотрение. Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития . 23 : 645–73. DOI : 10.1146 / annurev.cellbio.23.090506.123438 . PMID 17506689 . 
  26. ^ Гоулдинг MD, Chalepakis G, Deutsch U, Erselius JR, Gruss P (май 1991). «Pax-3, новый ДНК-связывающий белок мыши, экспрессируемый во время раннего нейрогенеза» . начальный. Журнал EMBO . 10 (5): 1135–47. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1991.tb08054.x . PMC 452767 . PMID 2022185 .  
  27. ^ Монсоро-Burq АГ (август 2015). «Факторы транскрипции PAX в развитии нервного гребня». рассмотрение. Семинары по клеточной биологии и биологии развития . 44 : 87–96. DOI : 10.1016 / j.semcdb.2015.09.015 . PMID 26410165 . 
  28. ^ Wu M, Li J, Engleka KA, Чжоу B, Лу М., Плоткин JB, Эпштейн JA (июнь 2008). «Устойчивая экспрессия Pax3 в нервном гребне вызывает расщелину неба и дефектный остеогенез у мышей» . начальный. Журнал клинических исследований . 118 (6): 2076–87. DOI : 10.1172 / JCI33715 . PMC 2381747 . PMID 18483623 .  
  29. ^ Эпштейн DJ, Vekemans M, Gros P (ноябрь 1991). «Splotch (Sp2H), мутация, влияющая на развитие нервной трубки мыши, обнаруживает делецию в парном гомеодомене Pax-3». начальный. Cell . 67 (4): 767–74. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (91) 90071-6 . PMID 1682057 . S2CID 25966319 .  
  30. ^ Трамбле P, Gruss P (1994). «Pax: гены мышей и людей». рассмотрение. Фармакология и терапия . 61 (1–2): 205–26. DOI : 10.1016 / 0163-7258 (94) 90063-9 . PMID 7938171 . 
  31. ^ Baldwin CT, Гот CF, Амос JA, да-Сильва EO, Milunsky A (февраль 1992). «Экзонная мутация в гене парного домена HuP2 вызывает синдром Ваарденбурга». начальный. Природа . 355 (6361): 637–8. DOI : 10.1038 / 355637a0 . PMID 1347149 . S2CID 4319436 .  
  32. ^ Pingault В, Вв Д, Dastot-Le Moal F, Гуссенс М, Marlin S, Bondurand N (апрель 2010 г.). «Обзор и обновление мутаций, вызывающих синдром Ваарденбурга» . рассмотрение. Мутация человека . 31 (4): 391–406. DOI : 10.1002 / humu.21211 . PMID 20127975 . S2CID 12278025 .  
  33. ↑ Barr FG (сентябрь 2001 г.). «Слияние генов с участием членов семейства PAX и FOX при альвеолярной рабдомиосаркоме» . рассмотрение. Онкоген . 20 (40): 5736–46. DOI : 10.1038 / sj.onc.1204599 . PMID 11607823 . 
  34. ^ Арндт, Калифорния; Крист, ВМ (1999-07-29). «Общая костно - мышечная опухоль детства и юности». Медицинский журнал Новой Англии . 341 (5): 342–352. DOI : 10.1056 / NEJM199907293410507 . ISSN 0028-4793 . PMID 10423470 .  
  35. ^ Galili N, Davis RJ, Фредерикс WJ, Mukhopadhyay S, Рошер FJ, Emanuel BS, Ровер G, Барр FG (ноябрь 1993). «Слияние гена домена вилки с PAX3 в твердой опухоли альвеолярной рабдомиосаркомы». начальный. Генетика природы . 5 (3): 230–5. DOI : 10.1038 / ng1193-230 . PMID 8275086 . S2CID 12374322 .  
  36. ^ Шерн Дж. Ф., Чен Л., Хмелецки Дж., Вей Дж. С., Патидар Р., Розенберг М. и др. (Февраль 2014). «Всесторонний геномный анализ рабдомиосаркомы выявляет ландшафт изменений, влияющих на общую генетическую ось в опухолях, положительных и отрицательных» . начальный. Открытие рака . 4 (2): 216–31. DOI : 10.1158 / 2159-8290.CD-13-0639 . PMC 4462130 . PMID 24436047 .  
  37. ^ Барр, Фредерик Г. (1995-02-15). "Молекулярные анализы хромосомных транслокаций в диагностике сарком мягких тканей у детей". JAMA: Журнал Американской медицинской ассоциации . 273 (7): 553–7. DOI : 10,1001 / jama.1995.03520310051029 . ISSN 0098-7484 . PMID 7530783 .  
  38. ^ Davicioni E, Finckenstein FG, Шахбазян V, Buckley JD, Triche TJ, Андерсон MJ (июль 2006). «Идентификация сигнатуры экспрессии гена PAX-FKHR, которая определяет молекулярные классы и определяет прогноз альвеолярной рабдомиосаркомы» . начальный. Исследования рака . 66 (14): 6936–46. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-05-4578 . PMID 16849537 . 
  39. ↑ Cao L, Yu Y, Bilke S, Walker RL, Mayeenuddin LH, Azorsa DO, Yang F, Pineda M, Helman LJ, Meltzer PS (август 2010). «Полногеномная идентификация сайтов связывания PAX3-FKHR при рабдомиосаркоме выявляет гены-кандидаты-мишени, важные для развития и рака» . начальный. Исследования рака . 70 (16): 6497–508. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-10-0582 . PMC 2922412 . PMID 20663909 .  
  40. ^ Gryder BE, Yohe ME, Chou HC, Zhang X, Marques J, Wachtel M и др. (Август 2017 г.). «PAX3-FOXO1 устанавливает миогенные суперэнхансеры и обеспечивает бромодоменную уязвимость BET» . начальный. Открытие рака . 7 (8): 884–899. DOI : 10.1158 / 2159-8290.CD-16-1297 . PMID 28446439 . 
  41. ^ Ван X, Bledsoe KL, Graham RP, Асманн YW, Viswanatha DS, Льюис JE, Льюис JT, Chou М.М., Yaszemski MJ, Джен J, Westendorf JJ, Оливейра AM (июль 2014). «Рецидивирующее слияние PAX3-MAML3 при бифенотипической саркоме носовых пазух» . начальный. Генетика природы . 46 (7): 666–8. DOI : 10.1038 / ng.2989 . PMC 4236026 . PMID 24859338 .  
  42. ^ Fritchie KJ, Jin L, Wang X, Graham RP, Torbenson MS, Lewis JE и др. (Декабрь 2016 г.). «Профиль слитного гена бифенотипической саркомы носовых пазух: анализ 44 случаев». начальный. Гистопатология . 69 (6): 930–936. DOI : 10.1111 / his.13045 . PMID 27454570 . S2CID 9521589 .  
  43. ^ Хуанг SC, Ghossein RA, епископ JA, Zhang L, Chen TC, Huang HY, Antonescu CR (январь 2016). «Новые слияния PAX3-NCOA1 в бифенотипической синоназальной саркоме с очаговой рабдомиобластической дифференцировкой» . Американский журнал хирургической патологии . 40 (1): 51–9. DOI : 10,1097 / PAS.0000000000000492 . PMC 4679641 . PMID 26371783 .  
  44. ^ а б Ся Л., Хуан Кью, Не Д., Ши Дж, Гонг М., Ву Б., Гонг П, Чжао Л., Цзо Х, Джу С., Чен Дж, Ши В. (июль 2013 г.). «PAX3 сверхэкспрессируется в глиобластомах человека и критически регулирует онкогенность клеток глиомы». начальный. Исследование мозга . 1521 : 68–78. DOI : 10.1016 / j.brainres.2013.05.021 . PMID 23701726 . S2CID 11206561 .  
  45. ^ Б Scholl FA, Kamarashev J, Murmann О.В., Geertsen R, R, Dummer Schäfer BW (февраль 2001 г.). «PAX3 экспрессируется в меланомах человека и способствует выживанию опухолевых клеток». начальный. Исследования рака . 61 (3): 823–6. PMID 11221862 . 
  46. ↑ Barr FG, Fitzgerald JC, Ginsberg JP, Vanella ML, Davis RJ, Bennicelli JL (ноябрь 1999 г.). «Преобладающая экспрессия альтернативных форм PAX3 и PAX7 в линиях миогенных и нервных опухолевых клеток». начальный. Исследования рака . 59 (21): 5443–8. PMID 10554014 . 
  47. Перейти ↑ Plummer RS, Shea CR, Nelson M, Powell SK, Freeman DM, Dan CP, Lang D (май 2008 г.). «Экспрессия PAX3 в первичных меланомах и невусах» . Современная патология . 21 (5): 525–30. DOI : 10.1038 / modpathol.3801019 . PMC 2987639 . PMID 18327212 .  
  48. ^ Джонс А.М., Mitter R, Poulsom R, Джиллетт C, Hanby AM, Томлинсон IP, Sawyer EJ (декабрь 2008). «Профилирование экспрессии мРНК филлодий опухолей молочной железы: идентификация генов, важных в развитии пограничных и злокачественных филлодийных опухолей». начальный. Журнал патологии . 216 (4): 408–17. DOI : 10.1002 / path.2439 . PMID 18937276 . S2CID 5294598 .  
  49. Перейти ↑ Liu Q, Yang G, Qian Y (апрель 2017). «Потеря MicroRNA-489-3p способствует метастазированию остеосаркомы за счет активации пути PAX3-MET». начальный. Молекулярный канцерогенез . 56 (4): 1312–1321. DOI : 10.1002 / mc.22593 . PMID 27859625 . S2CID 4439256 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Вахтель М, Шефер Б.В. (2017). «PAX3-FOXO1: Увеличение« непробиваемой »цели» . рассмотрение. Семинары по биологии рака . 50 : 115–123. DOI : 10.1016 / j.semcancer.2017.11.006 . PMID  29146205 .
  • Кубо Т., Шимосе С., Фудзимори Дж., Фурута Т., Очи М. (2015). «Прогностическое значение статуса слияния PAX3 / 7-FOXO1 при альвеолярной рабдомиосаркоме: систематический обзор и метаанализ». рассмотрение. Критические обзоры в онкологии / гематологии . 96 (1): 46–53. DOI : 10.1016 / j.critrevonc.2015.04.012 . PMID  26008753 .
  • Букингем М, Relaix F (2015). «PAX3 и PAX7 как вышестоящие регуляторы миогенеза». рассмотрение. Семинары по клеточной биологии и биологии развития . 44 : 115–25. DOI : 10.1016 / j.semcdb.2015.09.017 . PMID  26424495 .
  • Eccles MR, He S, Ahn A, Slobbe LJ, Jeffs AR, Yoon HS, Baguley BC (2013). «MITF и PAX3 играют разные роли в миграции клеток меланомы; наброски теории« генетического переключения », вовлекающей MITF и PAX3 в пролиферативные и инвазивные фенотипы меланомы» . рассмотрение. Границы онкологии . 3 : 229. DOI : 10,3389 / fonc.2013.00229 . PMC  3769631 . PMID  24062982 .
  • Оланич М.Е., Барр Ф.Г. (2013). «Призыв к ARMS: нацеливание на ген PAX3-FOXO1 при альвеолярной рабдомиосаркоме» . рассмотрение. Мнение эксперта о терапевтических целях . 17 (5): 607–23. DOI : 10.1517 / 14728222.2013.772136 . PMC  6699745 . PMID  23432728 .
  • Медик С., Зиман М. (2009). «PAX3 по всему спектру: от меланобласта до меланомы». рассмотрение. Критические обзоры в биохимии и молекулярной биологии . 44 (2–3): 85–97. DOI : 10.1080 / 10409230902755056 . PMID  19401874 . S2CID  20634846 .
  • Кубич Дж. Д., Янг К. П., Пламмер Р. С., Людвик А. Е., Ланг Д. (2008). «PAX-пути пигментации: роль Pax3 в меланогенезе, поддержании стволовых клеток меланоцитов и заболеваниях» . рассмотрение. Исследование пигментных клеток и меланомы . 21 (6): 627–45. DOI : 10.1111 / j.1755-148X.2008.00514.x . PMC  2979299 . PMID  18983540 .

Внешние ссылки [ править ]

  • PAX3 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P23760 (Парный коробчатый белок Pax-3) в PDBe-KB .