В энзимологии , A диоксигеназы phytanoyl-КоА ( EC 1.14.11.18 ) представляет собой фермент , который катализирует в химическую реакцию
фитаноил-КоА диоксигеназа | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
ЕС нет. | 1.14.11.18 | |||||||
№ CAS | 185402-46-4 | |||||||
Базы данных | ||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | |||||||
BRENDA | BRENDA запись | |||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | |||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | |||||||
MetaCyc | метаболический путь | |||||||
ПРИАМ | профиль | |||||||
Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Генная онтология | Amigo / QuickGO | |||||||
|
фитаноил-КоА 2-гидроксилаза | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||
Символ | PHYH | |||||
Альт. символы | PAHX | |||||
Ген NCBI | 5264 | |||||
HGNC | 8940 | |||||
OMIM | 602026 | |||||
RefSeq | NM_001037537 | |||||
UniProt | O14832 | |||||
Прочие данные | ||||||
Locus | Chr. 10 п15.3-10п12.2 | |||||
|
- фитаноил-CoA + 2-оксоглутарат + O 22-гидроксифитаноил-CoA + сукцинат + CO 2
Тремя субстратами этого фермента являются фитаноил-КоА , 2-оксоглутарат (2OG) и О 2 , тогда как его тремя продуктами являются 2-гидроксифитаноил-КоА , сукцинат и СО 2 .
Этот фермент принадлежит к семейству железо (II) -зависимых оксигеназ , которые обычно включают один атом кислорода в субстрат и один атом в сукцинат-карбоксилатную группу. Механизм сложен, но считается, что он включает упорядоченное связывание 2-оксоглутарата с ферментом, содержащим железо (II), а затем с субстратом. Связывание субстрата вызывает вытеснение молекулы воды из кофактора железа (II), оставляя вакантную координационную позицию, с которой связывается дикислород. Происходит перегруппировка с образованием высокоэнергетических частиц железа и кислорода (которые, как принято считать, представляют собой частицы железа (IV) = O), которые осуществляют фактическую реакцию окисления. [2] [3]
Номенклатура
Систематическое название данного фермента класс phytanoyl-КоА, 2-оксоглутарат: кислород оксидоредуктаза (2-гидроксилирование) . Этот фермент также называют фитаноил-КоА-гидроксилазой и фитаноил-КоА-альфа-гидроксилазой . [4]
Примеры
У людей, phytanoyl-КоА гидроксилазы кодируется PHYH ( он же PAHX ) гена и требуется для альфа-окисления с разветвленной цепью , жирных кислот (например , фитановой кислоты ) в пероксисом . Дефицит PHYH приводит к накоплению в тканях больших запасов фитановой кислоты и является основной причиной болезни Рефсума . [5]
Родственные ферменты
Железо (II) и 2OG-зависимые оксигеназы распространены у микроорганизмов , растений и животных; геном человека , по прогнозам, содержит около 80 примеров, и модели завода Резуховидка Таль вероятно , содержит больше. [2] У растений и микроорганизмов это семейство ферментов связано с большим разнообразием окислительных реакций. [6]
Рекомендации
- ↑ McDonough MA, Kavanagh KL, Butler D, Searls T, Oppermann U, Schofield CJ (декабрь 2005 г.). «Структура фитаноил-КоА 2-гидроксилазы человека определяет молекулярные механизмы болезни Рефсума» . Журнал биологической химии . 280 (49): 41101–10. DOI : 10.1074 / jbc.M507528200 . PMID 16186124 .
- ^ а б Хаузинджер, Роберт П. (2015). «ГЛАВА 1. Биохимическое разнообразие 2-оксоглутарат-зависимых оксигеназ» . 2-оксоглутарат-зависимые оксигеназы . Металлобиология. С. 1–58. DOI : 10.1039 / 9781782621959-00001 . ISBN 978-1-84973-950-4. S2CID 85596364 .
- ^ Мартинес С., Хаусингер Р.П. (август 2015 г.). «Каталитические механизмы Fe (II) - и 2-оксоглутарат-зависимых оксигеназ» . Журнал биологической химии . 290 (34): 20702–11. DOI : 10.1074 / jbc.R115.648691 . PMC 4543632 . PMID 26152721 .
- ^ «PHYH фитаноил-КоА 2-гидроксилаза [Homo sapiens (человек)]» . Национальный центр биотехнологической информации .
- ^ Михалик С.Дж., Моррелл Дж.С., Ким Д., Сакстедер К.А., Уоткинс П.А., Гулд С.Дж. (октябрь 1997 г.). «Идентификация PAHX, гена болезни Рефсума». Генетика природы . 17 (2): 185–9. DOI : 10,1038 / NG1097-185 . PMID 9326939 . S2CID 39214017 .
- ^ МакДоноу, Массачусетс, Лоенарз С., Чоудхури Р., Клифтон И.Дж., Скофилд С.Дж. (декабрь 2010 г.). «Структурные исследования 2-оксоглутарат зависимых оксигеназ человека». Текущее мнение в структурной биологии . 20 (6): 659–72. DOI : 10.1016 / j.sbi.2010.08.006 . PMID 20888218 .
дальнейшее чтение
- Янсен Г.А., Михалик С.Дж., Уоткинс П.А., Якобс С., Мозер Х.В., Вандерс Р.Дж. (март 1998 г.). «Характеристика гидроксилазы фитаноил-кофермента А в печени человека и измерения активности у пациентов с пероксисомальными расстройствами». Clinica Chimica Acta; Международный журнал клинической химии . 271 (2): 203–11. DOI : 10.1016 / S0009-8981 (97) 00259-3 . PMID 9565335 .
- Янсен Г.А., Михалик С.Дж., Уоткинс П.А., Мозер Х.В., Якобс К., Денис С., Вандерс Р.Дж. (декабрь 1996 г.). «Фитаноил-КоА-гидроксилаза присутствует в печени человека, локализована в пероксисомах и недостаточна при синдроме Зеллвегера: прямое, недвусмысленное свидетельство нового, пересмотренного пути альфа-окисления фитановой кислоты у людей». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 229 (1): 205–10. DOI : 10.1006 / bbrc.1996.1781 . PMID 8954107 .
- Янсен Г.А., Офман Р., Фердинандусс С., Ийлст Л., Муйзерс А.О., Скьелдал Огайо, Стокке О., Якобс С., Бесли Г.Т., Рэйт Дж.Э., Вандерс Р.Дж. (октябрь 1997 г.). «Болезнь Рефсума вызывается мутациями в гене гидроксилазы фитаноил-КоА». Генетика природы . 17 (2): 190–3. DOI : 10,1038 / NG1097-190 . PMID 9326940 . S2CID 5856245 .
- Михалик SJ, Рейнвилл AM, Уоткинс PA (сентябрь 1995). «Альфа-окисление фитановой кислоты в пероксисомах печени крыс. Производство альфа-гидроксифитаноил-КоА и формиата усиливается кофакторами диоксигеназы». Европейский журнал биохимии / FEBS . 232 (2): 545–51. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1995.545zz.x . PMID 7556205 .
Внешние ссылки
- GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о болезни Рефсума