Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

PLD2
Идентификаторы
ПсевдонимыPLD2 , фосфолипаза D2, PLD1C
Внешние идентификаторыOMIM : 602384 MGI : 892877 HomoloGene : 55672 GeneCards : PLD2
Расположение гена ( человек )
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человека) [1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение PLD2
Геномное расположение PLD2
Группа17p13.2Начинать4 807 152 п.н. [1]
Конец4 823 434 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 11 (мышь)
Chr.Хромосома 11 (мышь) [2]
Хромосома 11 (мышь)
Геномное расположение PLD2
Геномное расположение PLD2
Группа11 B3 | 11 42,99 смНачинать70 540 064 п.н. [2]
Конец70 558 110 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE PLD2 209643 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• активность фосфолипазы D
• N-ацилфосфатидилэтаноламин-специфическая активность фосфолипазы D
• Связывание с белком GO: 0001948
• каталитическая активность
• связывание фосфатидилинозитола
• гидролазная активность
Сотовый компонент• Аппарат Гольджи
• мембрана эндоплазматического ретикулума
• мембрана
• клеточная мембрана
• пресинапс
Биологический процесс• Путь передачи сигналов рецептора Fc-гамма, участвующий в фагоцитозе
• метаболизм липидов
• подвижность клеток
• передача сигнала, опосредованная малой GTPase
• липидный катаболический процесс
• рециклинг синаптических пузырьков
• организация цитоскелета
• процесс биосинтеза фосфатидной кислоты
• передача сигналов, опосредованная липидами инозитола
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

5338

18806

Ансамбль

ENSG00000129219

ENSMUSG00000020828

UniProt

O14939

P97813

RefSeq (мРНК)

NM_001243108
NM_002663

NM_008876
NM_001302475
NM_001302476
NM_001361935

RefSeq (белок)

NP_001230037
NP_002654

NP_001289404
NP_001289405
NP_032902
NP_001348864

Расположение (UCSC)Chr 17: 4.81 - 4.82 МбChr 11: 70,54 - 70,56 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фосфолипазы D2 представляет собой фермент , который у человека кодируется PLD2 геном . [5] [6]

Функция [ править ]

Фосфатидилхолин (PC) -специфические фосфолипазы D (PLD) катализируют гидролиз PC с образованием фосфатидной кислоты и холина . Активация PC-специфических PLD происходит в результате стимуляции агонистами как тирозинкиназы, так и рецепторов, связанных с G-белком . Было высказано предположение, что PC-специфические PLD функционируют в регулируемой секреции, реорганизации цитоскелета, регуляции транскрипции и контроле клеточного цикла. [Предоставлено OMIM] [7]

Механизм активации [ править ]

PLD2 активируется презентацией субстрата . [8] Фермент пальмитоилирован, что приводит к перемещению PLD2 в липидные рафты. Субстрат ПК полиненасыщен и находится в мембране отдельно от липидных рафтов рядом с фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфатом (PIP2). Когда уровни PIP2 увеличиваются, PLD2 переходит в PIP2, где встречает свой ПК-субстрат. Каркасные белки, которые взаимодействуют с PLD2, вероятно, изменяют его предпочтение липидным рафтам по сравнению с PIP2.

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что PLD2 взаимодействует с:

  • ARF1 , [9] [10]
  • Альдолаза А , [11]
  • Амфифизин , [12]
  • BIN1 , [12]
  • Кавеолин 1 , [13] [14]
  • Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа , [15]
  • PLCG1 , [16]
  • PRKCD , [17]
  • Src , [18] и
  • Белок синдрома Вискотта-Олдрича . [19]

Ингибиторы [ править ]

  • N - (2- (1- (3-фторфенил) -4-оксо-1,3,8-триазаспиро [4.5] декан-8-ил) этил) -2-нафтамид: 75-кратная селективность по сравнению с PLD1 , IC 50 = 20 нМ. [20]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000129219 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020828 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Park SH, Ryu SH, Suh PG, Kim H (февраль 1999 г.). «Отнесение человеческого PLD2 к хромосомной полосе 17p13.1 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика . 82 (3-4): 225. DOI : 10,1159 / 000015106 . PMID 9858823 . S2CID 46805227 .  
  6. Перейти ↑ Lopez I, Arnold RS, Lambeth JD (май 1998). «Клонирование и начальная характеристика человеческой фосфолипазы D2 (hPLD2). Фактор ADP-рибозилирования регулирует hPLD2» . Журнал биологической химии . 273 (21): 12846–52. DOI : 10.1074 / jbc.273.21.12846 . PMID 9582313 . 
  7. ^ «Энтрез Ген: PLD2 фосфолипаза D2» .
  8. ^ Петерсен EN, Chung HW, Nayebosadri A, Hansen SB (декабрь 2016). «Кинетическое разрушение липидных рафтов - это механосенсор фосфолипазы D» . Nature Communications . 7 : 13873. Bibcode : 2016NatCo ... 713873P . DOI : 10.1038 / ncomms13873 . PMC 5171650 . PMID 27976674 .  
  9. ^ Ли S, Пак JB, Ким JH, Ким Y, Ким JH, Шин KJ, и др. (Июль 2001 г.). «Актин напрямую взаимодействует с фосфолипазой D, подавляя ее активность» . Журнал биологической химии . 276 (30): 28252–60. DOI : 10.1074 / jbc.M008521200 . PMID 11373276 . 
  10. ^ Пак JB, Ким JH, Ким Y, Ха Ш, Ю JS, Du G, и др. (Июль 2000 г.). «Сердечная фосфолипаза D2 локализуется на мембранах сарколеммы и ингибируется альфа-актинином обратимым фактором ADP-рибозилирования» . Журнал биологической химии . 275 (28): 21295–301. DOI : 10.1074 / jbc.M002463200 . PMID 10801846 . 
  11. ↑ Kim JH, Lee S, Kim JH, Lee TG, Hirata M, Suh PG, Ryu SH (март 2002 г.). «Фосфолипаза D2 напрямую взаимодействует с альдолазой через свой домен PH». Биохимия . 41 (10): 3414–21. DOI : 10.1021 / bi015700a . PMID 11876650 . 
  12. ^ а б Ли К., Ким С. Р., Чанг Дж. К., Фроман М. А., Килиманн М. В., Ри С. Г. (июнь 2000 г.). «Ингибирование фосфолипазы D амфифизинами» . Журнал биологической химии . 275 (25): 18751–8. DOI : 10.1074 / jbc.M001695200 . PMID 10764771 . 
  13. ^ Zheng X, Bollinger Боллаг W (декабрь 2003). «Аквапорин 3 взаимодействует с фосфолипазой d2 в богатых кавеолином микродоменах мембран и подавляется при дифференцировке кератиноцитов» . Журнал следственной дерматологии . 121 (6): 1487–95. DOI : 10.1111 / j.1523-1747.2003.12614.x . PMID 14675200 . 
  14. ^ Чарны M, Fiucci G, Лави Y, Y Банно, Nozawa Y, Liscovitch M (февраль 2000). «Фосфолипаза D2: функциональное взаимодействие с кавеолином в микродоменах мембраны низкой плотности» . Письма FEBS . 467 (2–3): 326–32. DOI : 10.1016 / s0014-5793 (00) 01174-1 . PMID 10675563 . S2CID 21891748 .  
  15. ^ Ким Дж. Х., Ли С., Пак Дж. Б., Ли С. Д., Ким Дж. Х., Ха Ш и др. (Июнь 2003 г.). «Перекись водорода индуцирует ассоциацию между глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназой и фосфолипазой D2 для облегчения активации фосфолипазы D2 в клетках PC12». Журнал нейрохимии . 85 (5): 1228–36. DOI : 10.1046 / j.1471-4159.2003.01755.x . PMID 12753082 . S2CID 27513985 .  
  16. ^ Jang IH, Lee S, Park JB, Kim JH, Lee CS, Hur EM и др. (Май 2003 г.). «Прямое взаимодействие фосфолипазы C-гамма 1 с фосфолипазой D2 важно для передачи сигналов эпидермального фактора роста» . Журнал биологической химии . 278 (20): 18184–90. DOI : 10.1074 / jbc.M208438200 . PMID 12646582 . 
  17. ^ Хан Дж. М., Ким Дж. Х., Ли Б. Д., Ли С. Д., Ким И., Юнг Ю. В. и др. (Март 2002 г.). «Зависимая от фосфорилирования регуляция фосфолипазы D2 с помощью протеинкиназы C дельта в клетках феохромоцитомы крысы PC12» . Журнал биологической химии . 277 (10): 8290–7. DOI : 10.1074 / jbc.M108343200 . PMID 11744693 . 
  18. ^ Ан Б.Х., Ким С.И., Ким Э.Х., Чой К.С., Квон Т.К., Ли Й.Х. и др. (Май 2003 г.). «Трансмодуляция между фосфолипазой D и c-Src усиливает пролиферацию клеток» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (9): 3103–15. DOI : 10.1128 / mcb.23.9.3103-3115.2003 . PMC 153190 . PMID 12697812 .  
  19. ^ Kantonen S, Хаттон N, Mahankali М, Henkels КМ, Парк Н, Кокс Д, Гомес-Cambronero J (ноябрь 2011 года). «Новый гетеротример фосфолипазы D2-Grb2-WASp регулирует фагоцитоз лейкоцитов по двухступенчатому механизму» . Молекулярная и клеточная биология . 31 (22): 4524–37. DOI : 10.1128 / MCB.05684-11 . PMC 3209255 . PMID 21930784 .  
  20. ^ Лавьери Р.Р., Скотт С.А., Селви П.Е., Ким К., Джадхав С., Моррисон Р.Д. и др. (Сентябрь 2010 г.). «Дизайн, синтез и биологическая оценка галогенированных N- (2- (4-оксо-1-фенил-1,3,8-триазаспиро [4.5] декан-8-ил) этил) бензамидов: открытие изоформ-селективных» низкомолекулярный ингибитор фосфолипазы D2 " . Журнал медицинской химии . 53 (18): 6706–19. DOI : 10.1021 / jm100814g . PMC 3179181 . PMID 20735042 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Сундарам М., Кук Х.В., Байерс Д.М. (февраль 2004 г.). «Семейство MARCKS фосфолипидсвязывающих белков: регуляция фосфолипазы D и других клеточных компонентов». Биохимия и клеточная биология . 82 (1): 191–200. DOI : 10.1139 / o03-087 . PMID  15052337 .
  • Макдермотт М., Вакелам М.Дж., Моррис А.Дж. (февраль 2004 г.). «Фосфолипаза D». Биохимия и клеточная биология . 82 (1): 225–53. DOI : 10.1139 / o03-079 . PMID  15052340 .
  • Колли У.С., Сунг Т.К., Ролл Р., Дженко Дж., Хаммонд С.М., Альтшуллер Й. и др. (Март 1997 г.). «Фосфолипаза D2, отдельная изоформа фосфолипазы D с новыми регуляторными свойствами, которая провоцирует реорганизацию цитоскелета». Текущая биология . 7 (3): 191–201. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (97) 70090-3 . PMID  9395408 . S2CID  14008613 .
  • Steed PM, Clark KL, Boyar WC, Lasala DJ (октябрь 1998 г.). «Характеристика человеческого PLD2 и анализ вариантов сплайсинга изоформ PLD». Журнал FASEB . 12 (13): 1309–17. DOI : 10.1096 / fasebj.12.13.1309 . PMID  9761774 . S2CID  27394831 .
  • Слааби Р., Дженсен Т., Хансен Х.С., Фроман М.А., Зеедорф К. (декабрь 1998 г.). «PLD2 объединяется с рецептором EGF и подвергается фосфорилированию тирозина в одном месте при стимуляции агонистом» . Журнал биологической химии . 273 (50): 33722–7. DOI : 10.1074 / jbc.273.50.33722 . PMID  9837959 .
  • Чарни М., Фиуччи Дж., Лави Ю., Банно Ю., Нозава Ю., Лискович М. (февраль 2000 г.). «Фосфолипаза D2: функциональное взаимодействие с кавеолином в микродоменах мембраны низкой плотности» . Письма FEBS . 467 (2–3): 326–32. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01174-1 . PMID  10675563 . S2CID  21891748 .
  • Ли К., Ким С.Р., Чунг Дж. К., Фроман М.А., Килиманн М.В., Ри С.Г. (июнь 2000 г.). «Ингибирование фосфолипазы D амфифизинами» . Журнал биологической химии . 275 (25): 18751–8. DOI : 10.1074 / jbc.M001695200 . PMID  10764771 .
  • Пак Джей Би, Ким Дж. Х, Ким Й, Ха Ш, Ю Дж. С., Ду Джи и др. (Июль 2000 г.). «Сердечная фосфолипаза D2 локализуется на мембранах сарколеммы и ингибируется альфа-актинином обратимым фактором ADP-рибозилирования» . Журнал биологической химии . 275 (28): 21295–301. DOI : 10.1074 / jbc.M002463200 . PMID  10801846 .
  • Zhang Y, Redina O, Altshuller YM, Yamazaki M, Ramos J, Chneiweiss H, et al. (Ноябрь 2000 г.). «Регулирование экспрессии фосфолипазы D1 и D2 с помощью PEA-15, нового белка, который с ними взаимодействует» . Журнал биологической химии . 275 (45): 35224–32. DOI : 10.1074 / jbc.M003329200 . PMID  10926929 .
  • Мораш С.К., Байерс Д.М., Кук Х.В. (сентябрь 2000 г.). «Активация фосфолипазы D с помощью PKC и GTPgammaS в клетках нейробластомы человека, сверхэкспрессирующих MARCKS». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов . 1487 (2–3): 177–89. DOI : 10.1016 / s1388-1981 (00) 00094-9 . PMID  11018470 .
  • Дивеча Н., Рофс М., Холстед Дж. Р., Д'Андреа С., Фернандес-Борга М., Оомен Л. и др. (Октябрь 2000 г.). «Взаимодействие типа Ialpha PIPkinase с фосфолипазой D: роль местного образования фосфатидилинозитол 4, 5-бисфосфата в регуляции активности PLD2» . Журнал EMBO . 19 (20): 5440–9. DOI : 10.1093 / emboj / 19.20.5440 . PMC  314009 . PMID  11032811 .
  • Слааби Р., Ду Джи, Альтшуллер Ю.М., Фроман М.А., Зеедорф К. (ноябрь 2000 г.). «Инсулин-индуцированная активность фосфолипазы D1 и фосфолипазы D2 в человеческих эмбриональных клетках почки-293, опосредованная сигнальным каскадом фосфолипазы C гамма и протеинкиназы C альфа» . Биохимический журнал . 351 Pt 3 (3): 613–9. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3510613 . PMC  1221400 . PMID  11042115 .
  • Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC  310948 . PMID  11076863 .
  • Ли С., Пак Джей Би, Ким Дж. Х., Ким Й, Ким Дж. Х., Шин К. Дж. И др. (Июль 2001 г.). «Актин напрямую взаимодействует с фосфолипазой D, подавляя ее активность» . Журнал биологической химии . 276 (30): 28252–60. DOI : 10.1074 / jbc.M008521200 . PMID  11373276 .
  • Саркар С., Мива Н., Коминами Х., Игараси Н., Хаяси С., Окада Т. и др. (Ноябрь 2001 г.). «Регулирование фосфолипазы D2 млекопитающих: взаимодействие и стимуляция активатором G (M2)» . Биохимический журнал . 359 (Pt 3): 599–604. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3590599 . PMC  1222181 . PMID  11672434 .
  • Денмат-Уисс Л.А., Фебидиас С., Хонкаваара П., Робин П., Джени Б., Мин Д.С. и др. (Декабрь 2001 г.). «Регулирование конститутивного транзита белка фосфолипазой D в клетках HT29-cl19A» . Журнал биологической химии . 276 (52): 48840–6. DOI : 10.1074 / jbc.M104276200 . PMID  11687572 .
  • Ли С., Ким Дж. Х., Ли С. С., Ким Дж. Х., Ким И, Хео К. и др. (Февраль 2002 г.). «Медиаторный белок-2 ответа на коллапсин ингибирует активность нейрональной фосфолипазы D (2) путем прямого взаимодействия» . Журнал биологической химии . 277 (8): 6542–9. DOI : 10.1074 / jbc.M108047200 . PMID  11741937 .
  • Хан Дж. М., Ким Дж. Х., Ли Б. Д., Ли С. Д., Ким И., Юнг Ю. В. и др. (Март 2002 г.). «Зависимая от фосфорилирования регуляция фосфолипазы D2 с помощью протеинкиназы C дельта в клетках феохромоцитомы крысы PC12» . Журнал биологической химии . 277 (10): 8290–7. DOI : 10.1074 / jbc.M108343200 . PMID  11744693 .