Пентатрикопептидный повтор (PPR) представляет собой мотив последовательности из 35 аминокислот . Белки, содержащие пентатрикопептидные повторы, представляют собой семейство белков, обычно встречающихся в царстве растений . Их отличает наличие тандемных вырожденных мотивов PPR [1] и относительное отсутствие интронов в кодирующих их генах. [2]
Примерно 450 таких белков идентифицировано в геноме арабидопсиса и еще 477 — в геноме риса . [3] Несмотря на большой размер семейства белков, генетические данные позволяют предположить, что между белками PPR у Arabidopsis дублирование функций незначительно или вообще отсутствует . [2]
Назначение белков PPR в настоящее время является спорным. Было показано, что многие из них у Arabidopsis взаимодействуют (часто существенно) с митохондриями и другими органеллами [2] и, возможно, участвуют в редактировании РНК . [4] Однако для такого редактирования требуется много транс-белков, и исследования продолжают изучать, какие белки необходимы. [5]
Структура ППР решена. Он сворачивается в структуру спираль-поворот-спираль, аналогичную той, что встречается в тетратрикопептидном повторе. Несколько повторов белка образуют кольцо вокруг одноцепочечной молекулы РНК чувствительным к последовательности способом, напоминающим эффекторы TAL . [6]