Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с Picobirnaviridae )
Перейти к навигации Перейти к поиску


Пикобирнавирус
Journal.ppat.1005523.g006.A.WT.png
Электронная микрофотография частиц пикобирнавируса человека
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Учебный класс:Duplopiviricetes
Заказ:Дурнавиралес
Семья:Picobirnaviridae
Род:Пикобирнавирус
Типовой вид
Пикобирнавирус человека

Пикобирнавирус - это род вирусов с двухцепочечной РНК . Это единственный род семейства Picobirnaviridae . [1] Хотя амниоты , особенно млекопитающие, считались хозяевами, недавно было высказано предположение, что эти вирусы могут инфицировать бактерии и, возможно, некоторых других беспозвоночных. [2] [3] В настоящее время существует три вида этого рода, включая типовой вид пикобирнавируса человека . Сопутствующие симптомы включают гастроэнтерит у животных и людей, хотя связь с заболеванием неясна. [4] [5]

Этимология [ править ]

Пикобирнавирус - это небольшой ( пико , испанский язык для малого ), двусегментированный ( би , латинский язык для двух ), двухцепочечный РНК-вирус. Первоначально пикобирнавирусы считались бирна-подобными вирусами, а название было получено от бирнавируса (двусегментированная РНК), но вирионы намного меньше (диаметр 35 нм против 65 нм). [6] Пикобирнавирусы были впервые обнаружены у людей и черноногих рисовых крыс-пигмеев в 1988 году. [7]

Структура [ править ]

Вирусы рода picobirnavirus не имеют оболочки, имеют форму икосаэдра и симметрию T = 3. Диаметр около 35-40 нм. [5] [4]

Геном [ править ]

Расположение генома дцРНК1 и дцРНК2 пикобирнавируса человека

Геном является линейным, двудольным и состоят из двухцепочечной РНК . Она включает в себя сегмент 1 , который является 2,2-2,7 т.п.н. (КБ) в длину и сегмент 2 , который является 1,2-1,9 кб в длину. Геном кодирует от трех до четырех белков. [4] Ген капсидного белка кодируется второй открытой рамкой считывания большего геномного сегмента 1. [4]

Пикобирнавирусы делятся на две геногруппы на основе последовательности сегмента 2 . РНК-зависимая РНК - полимераза (RdRp) кодируются сегментом 2 . Вирусы этой группы были изолированы от людей и других млекопитающих, а также птиц и чешуекрылых . [8]

Жизненный цикл [ править ]

Репликация пикобирнавируса RdRp (L) и транскрипция (R) в вирусном капсиде .

Пикобирнавирусы поражают ткань кишечника. Попадание в хозяйскую клетку достигается за счет проникновения в хозяйскую клетку. Попав в хозяйскую клетку, вирусная репликация происходит в цитоплазме. Репликация следует модели репликации вируса с двухцепочечной РНК. Транскрипция двухцепочечной РНК вируса - это метод транскрипции. Вирусы высвобождаются из клетки путем отпочкования. Млекопитающие служат естественным хозяином. Пути передачи фекально-оральные. [5] [4]

Таксономия [ править ]

Первоначально считалось, что пикобирнавирусы принадлежат к семейству Birnaviridae , но позже было подтверждено, что они различаются в отношении хозяина, размера вириона, капсида, РНК-зависимой РНК-полимеразы, размера генома и организации. [9] Семейство Picobirnaviridae теперь четко классифицируется и состоит из одного рода Picobirnavirus , который имеет три вида: [10]

  • Бейхай пикобирнавирус
  • Пикобирнавирус лошадей
  • Пикобирнавирус человека

Ссылки [ править ]

  1. ^ Дельмас, B; Attoui, H; Ghosh, S; Малик Ю.С. Mundt, E; Вахария, ВН; Отчет Ictv, Консорциум (февраль 2019 г.). "Профиль таксономии вируса ICTV: Picobirnaviridae" . Журнал общей вирусологии . 100 (2): 133–134. DOI : 10,1099 / jgv.0.001186 . PMID  30484763 .
  2. ^ Кришнамурти, Siddharth R .; Ван, Дэвид (1 марта 2018 г.). «Обширное сохранение прокариотических сайтов связывания рибосом в известных и новых пикобирнавирусах» . Вирусология . 516 : 108–114. DOI : 10.1016 / j.virol.2018.01.006 . ISSN 0042-6822 . PMID 29346073 .  
  3. ^ Yinda, Клод Kwe; Гхогому, Стивен Мбига; Консейсао-Нето, Надия; Беллер, Лин; Дебут, Уорд; Ванхулле, Эмиэль; Маес, Пит; Ван Ранст, Марк; Matthijnssens, Jelle (январь 2018 г.). «Камерунские плодовые летучие мыши являются носителями различных вирусов, включая ротавирус H, бастровирусы и пикобирнавирусы, использующие альтернативный генетический код» . Эволюция вирусов . 4 (1): vey008. DOI : 10,1093 / ве / vey008 . ISSN 2057-1577 . PMC 5888411 . PMID 29644096 .   
  4. ^ a b c d e «Вирусная зона» . ExPASy . Дата обращения 15 июня 2015 .
  5. ^ a b c "Отчет ICTV: Picobirnaviridae" .
  6. ^ Малик, Яшпал С .; Гош, Сувик (январь 2020 г.). «Этимология: пикобирнавирус» . Возникающие инфекционные заболевания . 26 (1). DOI : 10.3201 / eid2601.et2601 .
  7. ^ Перейра, HG; Flewett, TH; Candeias, JAN; Барт, О.М. (1988). «Вирус с двусегментным геномом двухцепочечной РНК в кишечнике крысы (Oryzomys nigripes)» . J Gen Virol . 69 (11): 2749–2754. DOI : 10.1099 / 0022-1317-69-11-2749 . PMID 3053986 . 
  8. ^ Смитс, SL; ван Леувен, М; Шапендонк, СМ; Schürch, AC; Bodewes, R; Haagmans, BL; Остерхаус, AD (2012). «Пикобирнавирусы в дыхательных путях человека» . Возникающие инфекционные заболевания . 18 (9): 1539–40. DOI : 10.3201 / eid1809.120507 . PMC 3437736 . PMID 22932227 .  
  9. ^ Малик, Ю.С.; Кумар, Н; Шарма, К; Дхама, К. Шабир, МЗ; Ганеш, Б; Кобаяши, N; Баньяи, К. (2014). «Эпидемиология, филогения и эволюция появляющихся кишечных пикобирнавирусов животного происхождения и их связь с человеческими штаммами» . Biomed Res. Int . 2014 : 1–13. DOI : 10.1155 / 2014/780752 . PMC 4124650 . PMID 25136620 .  
  10. ^ "Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV)" . talk.ictvonline.org . Проверено 8 октября 2020 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Малик Ю.С. (2014). «Эпидемиология, филогения и эволюция появляющихся кишечных пикобирнавирусов животного происхождения и их связь с человеческими штаммами» . Biomed Res Int . 2014 : 1–13. DOI : 10.1155 / 2014/780752 . PMC  4124650 . PMID  25136620 .
  • Чандра, Р. (1997). «Пикобирнавирус, новая группа неописанных вирусов млекопитающих и птиц: мини-обзор». Acta Virologica . 41 (1): 59–62. PMID  9199719 .
  • Розен, Б. Фанг, З.Ы .; Стекло, RI; Монро, СС (2000). «Клонирование геномных сегментов пикобирнавируса человека и разработка анализа обнаружения ОТ-ПЦР». Вирусология . 277 (2): 316–29. DOI : 10.1006 / viro.2000.0594 . PMID  11080479 .
  • Таксономическое предложение picobirnaviridae на ICTV
  • Вирусная зона : пикобирнавирус
  • Отчет ICTV: Picobirnaviridae