Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Гидролиз из белка (красного цвета) путем нуклеофильной атаки воды (синей). Некаталитический период полураспада составляет несколько сотен лет.

Протеолиз - это расщепление белков на более мелкие полипептиды или аминокислоты . Некатализируемый, то гидролиз из пептидных связей происходит крайне медленно, принимая сотни лет. Протеолиз обычно катализируется клеточными ферментами, называемыми протеазами , но также может происходить при внутримолекулярном пищеварении. Низкий pH или высокие температуры также могут вызывать неферментативный протеолиз.

Протеолиз в организмах служит многим целям; например, пищеварительные ферменты расщепляют белки в пище, чтобы обеспечить организм аминокислотами, в то время как протеолитическая обработка полипептидной цепи после ее синтеза может быть необходима для производства активного белка. Он также важен для регуляции некоторых физиологических и клеточных процессов, а также для предотвращения накопления нежелательных или аномальных белков в клетках. Следовательно, нарушение регуляции протеолиза может вызвать заболевание. Некоторые яды используют протеолиз .

Протеолиз важен как аналитический инструмент для изучения белков в лабораторных и промышленных условиях, например, при переработке пищевых продуктов и удалении пятен.

Биологические функции [ править ]

Посттрансляционный протеолитический процессинг [ править ]

Ограниченный протеолиз полипептида во время или после трансляции в синтезе белка часто происходит для многих белков. Это может включать удаление N-концевого метионина , сигнального пептида и / или превращение неактивного или нефункционального белка в активный. Предшественник конечной функциональной формы белка называется пропротеином , и эти пропротеины могут быть сначала синтезированы как препропротеин. Например, альбуминсначала синтезируется как препроальбумин и содержит нерасщепленный сигнальный пептид. Это образует проальбумин после отщепления сигнального пептида, и дальнейшая обработка для удаления пропептида с 6 N-концевыми остатками дает зрелую форму белка. [1]

Удаление N-концевого метионина [ править ]

Инициирующий метионин (и, у прокариот, fMet ) может быть удален во время трансляции растущего белка. В случае E. coli fMet эффективно удаляется, если второй остаток небольшой и незаряженный, но не, если второй остаток является объемным и заряженным. [2] Как у прокариот, так и у эукариот незащищенный N-концевой остаток может определять период полужизни белка в соответствии с правилом N-конца .

Удаление сигнальной последовательности [ править ]

Белки, которые должны быть нацелены на конкретную органеллу или для секреции, имеют N-концевой сигнальный пептид, который направляет белок к его конечной цели. Этот сигнальный пептид удаляется протеолизом после транспорта через мембрану .

Расщепление полипротеинов [ править ]

Некоторые белки и большинство эукариотических полипептидных гормонов синтезируются в виде большого полипептида-предшественника, известного как полипротеин, который требует протеолитического расщепления на отдельные более мелкие полипептидные цепи. Полипротеина проопиомеланокортина (РОМС) содержит много полипептидных гормонов. Однако картина расщепления POMC может варьироваться в разных тканях, давая разные наборы полипептидных гормонов из одного и того же полипротеина.

Многие вирусы также сначала продуцируют свои белки в виде единой полипептидной цепи, которая транслируется с полицистронной мРНК. Этот полипептид впоследствии расщепляется на отдельные полипептидные цепи. [1] Общие наименования для полипротеина включают затычку ( специфический антиген-группу ) в ретровирусах и ORF1ab в Nidovirales . Последнее название относится к тому факту, что скользкая последовательность в мРНК, которая кодирует полипептид, вызывает сдвиг рамки считывания рибосом , что приводит к двум разным длинам пептидных цепей ( a и ab) при приблизительно фиксированном соотношении.

Расщепление белков-предшественников [ править ]

Многие белки и гормоны синтезируются в виде их предшественников - зимогенов , проферментов и прегормонов . Эти белки расщепляются, чтобы сформировать свои окончательные активные структуры. Например, инсулин синтезируется в виде препроинсулина , который дает проинсулин после того, как сигнальный пептид был отщеплен. Затем проинсулин расщепляется в двух положениях с образованием двух полипептидных цепей, связанных двумя дисульфидными связями . Удаление двух С-концевых остатков из В-цепи затем дает зрелый инсулин. Сворачивание белков происходит в одноцепочечной форме проинсулина, которая способствует образованию в конечном итоге межпептидных дисульфидных связей и, в конечном итоге, внутрипептидных дисульфидных связей, обнаруживаемых в нативной структуре инсулина.

В частности, протеазы синтезируются в неактивной форме, чтобы их можно было безопасно хранить в клетках и при необходимости готовить к высвобождению в достаточном количестве. Это необходимо для того, чтобы протеаза активировалась только в правильном месте или в правильном контексте, поскольку неправильная активация этих протеаз может быть очень разрушительной для организма. Протеолиз зимогена дает активный белок; например, когда трипсиноген расщепляется с образованием трипсина , происходит небольшая перестройка структуры белка, которая дополняет активный сайт протеазы, тем самым активируя белок.

Следовательно, протеолиз может быть методом регулирования биологических процессов путем превращения неактивных белков в активные. Хорошим примером является каскад свертывания крови, при котором начальное событие запускает каскад последовательной протеолитической активации многих специфических протеаз, что приводит к свертыванию крови. Система комплемента в иммунном ответе также включает в себя сложный последовательный протеолитической активации и взаимодействия , которые приводят в результате нападения на вторжение болезнетворных микроорганизмов.

Распад белка [ править ]

Распад белка может происходить внутриклеточно или внеклеточно. При переваривании пищи пищеварительные ферменты могут высвобождаться в окружающую среду для внеклеточного переваривания, в результате чего протеолитическое расщепление расщепляет белки на более мелкие пептиды и аминокислоты, чтобы они могли абсорбироваться и использоваться. У животных пища может обрабатываться внеклеточно в специализированных органах или кишечнике , но у многих бактерий пища может интернализоваться через фагоцитоз . Микробная деградация белка в окружающей среде может регулироваться доступностью питательных веществ. Например, ограничение основных элементов в белках (углерод, азот и сера) индуцирует протеолитическую активность у гриба Neurospora crassa [3]а также в сообществах почвенных организмов. [4]

Белки в клетках расщепляются на аминокислоты. Это внутриклеточное разложение белка выполняет несколько функций: оно удаляет поврежденный и аномальный белок и предотвращает их накопление. Он также служит для регулирования клеточных процессов, удаляя ферменты и регуляторные белки, которые больше не нужны. Затем аминокислоты можно повторно использовать для синтеза белка.

Структура протеасомы. Его активные центры находятся внутри трубки (синяя), где разрушаются белки.

Лизосома и протеасома [ править ]

Внутриклеточная деградация белка может быть достигнута двумя способами - протеолизом в лизосомах или убиквитин- зависимым процессом, направленным на протеасомы нежелательных белков . Путь аутофагии- лизосомы обычно является неселективным процессом, но он может стать селективным при голодании, в результате чего белки с пептидной последовательностью KFERQ или подобными селективно расщепляются. Лизосома содержит большое количество протеаз, таких как катепсины .

Опосредованный убиквитином процесс является избирательным. Белки, подверженные деградации, ковалентно связаны с убиквитином. Многие молекулы убиквитина могут быть связаны вместе с белком, предназначенным для разложения. Полиубихнированный белок нацелен на АТФ-зависимый протеазный комплекс, протеасому. Убиквитин высвобождается и используется повторно, в то время как целевой белок разрушается.

Скорость деградации внутриклеточного белка [ править ]

Разные белки разлагаются с разной скоростью. Аномальные белки быстро разрушаются, тогда как скорость деградации нормальных белков может широко варьироваться в зависимости от их функций. Ферменты в важных точках метаболического контроля могут разлагаться намного быстрее, чем те ферменты, активность которых в основном постоянна при всех физиологических условиях. Одним из наиболее быстро разрушающихся белков является орнитиндекарбоксилаза , период полураспада которой составляет 11 минут. Напротив, другие белки, такие как актин и миозин, имеют период полураспада месяц или более, в то время как, по сути, гемоглобин сохраняется на протяжении всей жизни эритроцита . [5]

N-конец правило может частично определить период полураспада белка, и белки с сегментами , богатых пролином , глутаминовой кислоты , серина и треонина (так называемые PEST белки ) имеют короткий период полураспада. [6] Другие факторы, которые, как предполагается, влияют на скорость разложения, включают скорость дезаминирования глутамина и аспарагина и окисления цистеина , гистидина и метионина, отсутствие стабилизирующих лигандов, присутствие присоединенных углеводных или фосфатных групп, присутствие свободных α-аминогрупп. группы, отрицательный заряд белка, а также гибкость и стабильность белка.[5] Белки с более высокой степенью внутреннего нарушения также имеют тенденцию к короткому периоду полужизни в клетке [7], причем неупорядоченные сегменты были предложены для облегчения эффективного инициирования деградации протеасомой . [8] [9]

Скорость протеолиза может также зависеть от физиологического состояния организма, такого как его гормональное состояние, а также от статуса питания. Во время голодания скорость разложения белка увеличивается.

Пищеварение [ править ]

При пищеварении человека белки в пище расщепляются на более мелкие пептидные цепи пищеварительными ферментами, такими как пепсин , трипсин , химотрипсин и эластаза , и на аминокислоты различными ферментами, такими как карбоксипептидаза , аминопептидаза и дипептидаза . Необходимо расщепить белки на небольшие пептиды (трипептиды и дипептиды) и аминокислоты, чтобы они могли всасываться в кишечнике, а абсорбированные трипептиды и дипептиды также далее расщепляются на аминокислоты внутриклеточно, прежде чем они попадут в кровоток. [10]Различные ферменты имеют разную специфичность в отношении своего субстрата; трипсин, например, расщепляет пептидную связь после положительно заряженного остатка ( аргинина и лизина ); химотрипсин расщепляет связь после ароматического остатка ( фенилаланин , тирозин и триптофан ); эластаза расщепляет связь после небольшого неполярного остатка, такого как аланин или глицин.

Чтобы предотвратить несоответствующую или преждевременную активацию пищеварительных ферментов (они могут, например, запускать самопереваривание поджелудочной железы, вызывая панкреатит ), эти ферменты секретируются в виде неактивного зимогена. Предшественник пепсина , пепсиноген , секретируется желудком и активируется только в кислой среде желудка. Поджелудочная железа секретирует предшественник ряда протеаза , такие как трипсин и химотрипсин . Зимоген трипсина трипсиноген , который активируется очень специфической протеаза, энтерокиназы , секретируемый слизистой оболочкой в двенадцатиперстной кишке. После активации трипсин может также расщеплять другие трипсиногены, а также предшественники других протеаз, таких как химотрипсин и карбоксипептидаза, для их активации.

В бактериях используется аналогичная стратегия использования неактивного зимогена или презимогена. Субтилизин , который продуцируется Bacillus subtilis , продуцируется как препросубтилизин и высвобождается только в том случае, если сигнальный пептид расщеплен и произошла автокаталитическая протеолитическая активация.

Клеточная регуляция [ править ]

Протеолиз также участвует в регуляции многих клеточных процессов путем активации или деактивации ферментов, факторов транскрипции и рецепторов, например, в биосинтезе холестерина [11] или в передаче сигналов тромбина через рецепторы, активируемые протеазой . [12]

Некоторые ферменты в важных контрольных точках метаболизма, такие как орнитиндекарбоксилаза, полностью регулируются скоростью синтеза и разложения. Другие быстро разрушающиеся белки включают белковые продукты протоонкогенов, которые играют центральную роль в регуляции роста клеток.

Регуляция клеточного цикла [ править ]

Циклины - это группа белков, которые активируют киназы, участвующие в делении клеток. Распад циклинов является ключевым этапом, который определяет выход из митоза и переход к следующему клеточному циклу . [13] Циклины накапливаются в ходе клеточного цикла, а затем внезапно исчезают непосредственно перед анафазой митоза. Циклины удаляются через убиквитин-опосредованный протеолитический путь.

Апоптоз [ править ]

Каспазы - важная группа протеаз, участвующих в апоптозе или запрограммированной гибели клеток . Предшественники каспазы, прокаспаза, могут быть активированы протеолизом через его ассоциацию с белковым комплексом, который образует апоптосомы , или гранзимом B , или через пути рецептора смерти .

Автопротеолиз [ править ]

В некоторых белках происходит автопротеолиз, в результате чего пептидная связь расщепляется в результате самокатализирующейся внутримолекулярной реакции . В отличие от зимогенов , эти автопротеолитические белки участвуют в реакции «однократного оборота» и не катализируют дальнейшие реакции после расщепления. Примеры включают расщепление связи Asp-Pro в подмножестве доменов фактора фон Виллебранда типа D (VWD) [14] [15] и самопроцессирующийся домен Neisseria meningitidis FrpC [16], расщепление связи Asn-Pro в Salmonella FlhB белок, [17] белок Yersinia YscU, [18]а также расщепление связи Gly-Ser в подмножестве доменов белка спермы морского ежа, энтерокиназы и агрина (SEA). [19] В некоторых случаях автопротеолитическому расщеплению способствует конформационный штамм пептидной связи. [19]

Протеолиз и болезни [ править ]

Аномальная протеолитическая активность связана со многими заболеваниями. [20] При панкреатите утечка протеаз и их преждевременная активация в поджелудочной железе приводит к самоперевариванию поджелудочной железы . У людей с сахарным диабетом может быть повышенная лизосомальная активность, а деградация некоторых белков может значительно возрасти. Хронические воспалительные заболевания, такие как ревматоидный артрит, могут включать высвобождение лизосомальных ферментов во внеклеточное пространство, которые разрушают окружающие ткани. Аномальный протеолиз и образование пептидов, которые агрегируют в клетках, и их неэффективное удаление могут привести к многим возрастным неврологическим заболеваниям, таким как болезнь Альцгеймера . [21]

Протеазы могут регулироваться антипротеазами или ингибиторами протеаз , и дисбаланс между протеазами и антипротеазами может приводить к заболеваниям, например, к разрушению тканей легких при эмфиземе, вызванной курением табака. Считается, что курение увеличивает количество нейтрофилов и макрофагов в легких, которые высвобождают чрезмерное количество протеолитических ферментов, таких как эластаза , так что они больше не могут подавляться серпинами, такими как α 1 -антитрипсин., что приводит к разрушению соединительных тканей в легких. Другие протеазы и их ингибиторы также могут быть вовлечены в это заболевание, например матриксные металлопротеиназы (ММП) и тканевые ингибиторы металлопротеиназ (ТИМП). [22]

Другие заболевания, связанные с аберрантным протеолизом, включают мышечную дистрофию , дегенеративные кожные заболевания, респираторные и желудочно-кишечные заболевания и злокачественные новообразования .

Неферментативный протеолиз [ править ]

Белковые скелеты очень стабильны в воде при нейтральном pH и комнатной температуре, хотя скорость гидролиза различных пептидных связей может варьироваться. Период полураспада пептидной связи в нормальных условиях может составлять от 7 лет до 350 лет, даже больше для пептидов, защищенных модифицированным концом или внутри белка. [23] [24] [25] Однако скорость протеолиза может быть значительно увеличена из-за экстремальных значений pH и тепла.

Сильные минеральные кислоты могут легко гидролизовать пептидные связи в белке ( кислотный гидролиз ). Стандартный способ гидролиза белка или пептида до составляющих его аминокислот для анализа - нагревание до 105 ° C в течение примерно 24 часов в 6M соляной кислоте . [26] Однако некоторые белки устойчивы к кислотному гидролизу. Одним из хорошо известных примеров является рибонуклеаза А , которую можно очистить обработкой сырых экстрактов горячей серной кислотой, так что другие белки расщепляются, а рибонуклеаза А остается нетронутой. [27]

Некоторые химические вещества вызывают протеолиз только после определенных остатков, и их можно использовать для выборочного расщепления белка на более мелкие полипептиды для лабораторного анализа. [28] Например, цианогенбромид расщепляет пептидную связь после метионина . Подобные методы можно использовать для специфического расщепления пептидных связей триптофанила , аспартила , цистеинила и аспарагинила . Для расщепления можно использовать кислоты, такие как трифторуксусная кислота и муравьиная кислота .

Как и другие биомолекулы, белки могут расщепляться только под действием высокой температуры. При 250 ° C пептидная связь может легко гидролизоваться, а ее период полураспада снижается примерно до минуты. [26] [29] Белок также может расщепляться без гидролиза путем пиролиза ; небольшие гетероциклические соединения могут начать образовываться при разложении. При температуре выше 500 ° C могут также образовываться полициклические ароматические углеводороды [30] [31], что представляет интерес при изучении образования канцерогенов в табачном дыме и приготовлении пищи при высокой температуре. [32] [33]

Лабораторные приложения [ править ]

Протеолиз также используется в исследовательских и диагностических целях:

  • Расщепление слитого белка, так что партнер слияния и белковая метка, используемые при экспрессии и очистке белка, могут быть удалены. Используемые протеазы, такие как тромбин , энтерокиназа и протеаза TEV , обладают высокой степенью специфичности, так что может быть отщеплена только целевая последовательность.
  • Полная инактивация нежелательной ферментативной активности или удаление нежелательных белков. Например, протеиназа K , протеиназа широкого спектра действия, стабильная в мочевине и SDS , часто используется при получении нуклеиновых кислот для удаления нежелательных примесей нуклеаз, которые в противном случае могут разрушить ДНК или РНК. [34]
  • Частичная инактивация или изменение функциональности определенного белка. Например, обработка ДНК - полимераза I с субтилизином дает фрагмент Кленова , который сохраняет свою функцию полимеразы , но испытывает недостаток в 5'-экзонуклеазную активность. [35]
  • Расщепление белков в растворе для протеомного анализа методом жидкостной хроматографии-масс-спектрометрии (ЖХ-МС). Это также может быть сделано путем в геле пищеварением из белков после разделения с помощью гель - электрофореза для идентификации с помощью масс - спектрометрии .
  • Анализ устойчивости свернутого домена в широком диапазоне условий. [36]
  • Увеличение количества успешных проектов кристаллизации [37]
  • Производство переваренного белка, используемого в питательной среде для культивирования бактерий и других организмов, например триптона в бульоне для лизогени .

Ферменты протеазы [ править ]

Протеазы можно классифицировать по каталитической группе, входящей в его активный центр. [38]

  • Цистеиновая протеаза
  • Сериновая протеаза
  • Треониновая протеаза
  • Аспарагиновая протеаза
  • Глутаминовая протеаза
  • Металлопротеиназа
  • Аспарагин пептид лиаза

Яды [ править ]

Некоторые типы ядов, например, вырабатываемые ядовитыми змеями , также могут вызывать протеолиз. Эти яды, по сути, представляют собой сложные пищеварительные жидкости, которые начинают свою работу вне тела. Протеолитические яды вызывают широкий спектр токсических эффектов [39], включая следующие:

  • цитотоксический (разрушающий клетки)
  • гемотоксический ( кроворазрушающий )
  • миотоксический (разрушающий мышцы)
  • геморрагический (кровотечение)

См. Также [ править ]

  • Карта протеолиза
  • PROTOMAP - протеомная технология для идентификации протеолитических субстратов.
  • Протеасома
  • Переваривание в геле

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b Томас Э. Крейтон (1993). Белки: структуры и молекулярные свойства (2-е изд.). WH Freeman and Company. С.  78–86 . ISBN 978-0-7167-2317-2.
  2. ^ PH Hirel; MJ Schmitter; P Dessen; G Fayat; С. Бланке (1989). «Степень удаления N-концевого метионина из белков Escherichia coli определяется длиной боковой цепи предпоследней аминокислоты» . Proc Natl Acad Sci USA . 86 (21): 8247–51. Bibcode : 1989PNAS ... 86.8247H . DOI : 10.1073 / pnas.86.21.8247 . PMC 298257 . PMID 2682640 .  
  3. ^ Hanson, MA, Marzluf, GA, 1975. Контроль синтеза одного фермента множеством регуляторных цепей у Neurospora crassa. Proc. Natl. Акад. Sci. USA 72, 1240–1244.
  4. Sims, GK и MM Wander. 2002. Протеолитическая активность при ограничении азота или серы. Прил. Soil Ecol. 568: 1-5.
  5. ^ a b Томас Э. Крейтон (1993). «Глава 10 - Деградация» . Белки: структуры и молекулярные свойства (2-е изд.). WH Freeman and Company. С.  463–473 . ISBN 978-0-7167-2317-2.
  6. ^ Voet & Voet (1995). Биохимия (2-е изд.). Джон Вили и сыновья. С.  1010–1014 . ISBN 978-0-471-58651-7.
  7. ^ Tompa, P .; Прилуски, Дж .; Silman, I .; Суссман, JL (2008-05-01). «Структурное нарушение служит слабым сигналом для деградации внутриклеточного белка». Белки . 71 (2): 903–909. DOI : 10.1002 / prot.21773 . ISSN 1097-0134 . PMID 18004785 .  
  8. ^ Инобе, Томонао; Матушек, Андреас (01.02.2014). «Парадигмы деградации белков протеасомами» . Текущее мнение в структурной биологии . 24 : 156–164. DOI : 10.1016 / j.sbi.2014.02.002 . ISSN 1879-033X . PMC 4010099 . PMID 24632559 .   
  9. ^ Ван дер Ли, Робин; Ланг, Бенджамин; Круз, Кай; Гспонер, Йорг; Санчес де Гроот, Наталия; Huynen, Martijn A .; Матушек, Андреас; Фуксрайтер, Моника; Бабу, М. Мадан (25 сентября 2014 г.). «Внутренне нарушенные сегменты влияют на период полужизни белка в клетке и во время эволюции» . Отчеты по ячейкам . 8 (6): 1832–1844. DOI : 10.1016 / j.celrep.2014.07.055 . ISSN 2211-1247 . PMC 4358326 . PMID 25220455 .   
  10. Перейти ↑ Silk DB (1974). «Отчет о прогрессе. Поглощение пептидов в человеке» . Кишечник . 15 (6): 494–501. DOI : 10.1136 / gut.15.6.494 . PMC 1413009 . PMID 4604970 .  
  11. ^ Майкл С. Браун; Джозеф Л. Гольдштейн (май 1997 г.). "Путь SREBP: регуляция метаболизма холестерина путем протеолиза связанного с мембраной фактора транскрипции". Cell . 89 (3): 331–340. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80213-5 . PMID 9150132 . S2CID 17882616 .  
  12. ^ Шон Р. Кафлин (2000). «Сигнализация тромбина и рецепторы, активируемые протеазой». Природа . 407 (6801): 258–264. DOI : 10.1038 / 35025229 . PMID 11001069 . S2CID 4429634 .  
  13. ^ Glotzer М, Мюррей AW, Киршнер МВт (1991). «Циклин разлагается убиквитиновым путем». Природа . 349 (6305): 132–8. Bibcode : 1991Natur.349..132G . DOI : 10.1038 / 349132a0 . PMID 1846030 . S2CID 205003883 .  
  14. ^ Лиделл, Мартин Э .; Йоханссон, Малин Э.В.; Ханссон, Гуннар К. (18 апреля 2003 г.). «Автокаталитическое расщепление на С-конце муцина MUC2 человека происходит при низком pH позднего секреторного пути» . Журнал биологической химии . 278 (16): 13944–13951. DOI : 10.1074 / jbc.M210069200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12582180 .  
  15. ^ Би, Мин; Хикокс, Джон Р.; Уинфри, Вирджиния П.; Олсон, Гэри Э; Харди, Дэниел М (2003-10-15). «Процессинг, локализация и связывающая активность зонадгезина предполагают функцию адгезии сперматозоидов к блестящей оболочке во время экзоцитоза акросомы» . Биохимический журнал . 375 (Pt 2): 477–488. DOI : 10.1042 / BJ20030753 . ISSN 0264-6021 . PMC 1223699 . PMID 12882646 .   
  16. ^ Садилкова, Ленка; Осичка, Радим; Сульц, Мирослав; Линхартова Ирена; Новак, Петр; Себо, Питер (октябрь 2008 г.). «Одностадийная аффинная очистка рекомбинантных белков с использованием самоизечивающего модуля из Neisseria meningitidis FrpC» . Белковая наука . 17 (10): 1834–1843. DOI : 10.1110 / ps.035733.108 . PMC 2548358 . PMID 18662906 .  
  17. ^ Минамино, Тору; Макнаб, Роберт М. (2001-09-01). «Доменная структура Salmonella FlhB, экспортный компонент жгутика, ответственный за переключение специфичности субстрата» . Журнал бактериологии . 182 (17): 4906–4914. DOI : 10.1128 / JB.182.17.4906-4914.2000 . ISSN 1098-5530 . PMC 111371 . PMID 10940035 .   
  18. ^ Björnfot, Ann-Catrin; Лаванда, Моа; Форсберг, Оке; Вольф-Вац, Ганс (01.07.2009). «Автопротеолиз YscU Yersinia pseudotuberculosis важен для регуляции экспрессии и секреции белков Yop» . Журнал бактериологии . 191 (13): 4259–4267. DOI : 10.1128 / JB.01730-08 . ISSN 0021-9193 . PMC 2698497 . PMID 19395493 .   
  19. ^ а б Йоханссон, Денни Г.А.; Макао, Бертил; Сандберг, Андерс; Хярд, Торлейф (4 апреля 2008 г.). «Автопротеолиз домена SEA, ускоренный конформационным напряжением: механистические аспекты». Журнал молекулярной биологии . 377 (4): 1130–1143. DOI : 10.1016 / j.jmb.2008.01.050 . ISSN 1089-8638 . PMID 18314133 .  
  20. ^ Кэтлин М. Сакамото (2002). «Убиквитин-зависимый протеолиз: его роль в заболеваниях человека и разработка терапевтических стратегий» (PDF) . Молекулярная генетика и метаболизм . 77 (1–2): 44–56. DOI : 10.1016 / S1096-7192 (02) 00146-4 . PMID 12359129 .  
  21. ^ De Strooper B. (2010). «Протеазы и протеолиз при болезни Альцгеймера: многофакторный взгляд на процесс болезни». Физиологические обзоры . 90 (2): 465–94. DOI : 10.1152 / Physrev.00023.2009 . PMID 20393191 . 
  22. ^ Abboud RT1, Vimalanathan S (2008). «Патогенез ХОБЛ. Часть I. Роль протеазно-антипротеазного дисбаланса при эмфиземе». Международный журнал туберкулеза и болезней легких . 12 (4): 361–7. PMID 18371259 . 
  23. ^ Даниэль. Кане; В. Кларк Стилл (1988). «Гидролиз пептидной связи в нейтральной воде». Варенье. Chem. Soc . 110 (22): 7529–7534. DOI : 10.1021 / ja00230a041 .
  24. ^ Радзичка, Анна; Вольфенден, Ричард (январь 1996 г.). "Скорость некаталитического гидролиза пептидных связей в нейтральном растворе и переходное состояние сродства протеаз". Журнал Американского химического общества . 118 (26): 6105–6109. DOI : 10.1021 / ja954077c .
  25. Бернард Теста, Иоахим М. Майер (1 июля 2003 г.). Гидролиз в метаболизме лекарств и пролекарств . Wiley VCH. С. 270–288. ISBN 978-3906390253.CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
  26. ^ a b Томас Э. Крейтон (1993). Белки: структуры и молекулярные свойства (2-е изд.). WH Freeman and Company. п. 6 . ISBN 978-0-7167-2317-2.
  27. ^ «Рибонуклеаза А» . Банк данных белков.
  28. ^ Брайан Джон Смит (2002). «Глава 71-75». В Джоне М. Уокере (ред.). Справочник протоколов белков (2-е изд.). Humana Press. стр.  485 -510. DOI : 10.1385 / 1592591698 . ISBN 978-0-89603-940-7. S2CID  3692961 .
  29. ^ Белый RH (1984). «Гидролитическая стабильность биомолекул при высоких температурах и ее значение для жизни при 250 градусах Цельсия». Природа . 310 (5976): 430–2. DOI : 10.1038 / 310430a0 . PMID 6462230 . S2CID 4315057 .  
  30. ^ Рамеш К. Шармаа; В. Джеффри Хана; Джеффри И. Симанб; Мохаммад Р. Хаджалигола (январь 2003 г.). «Образование низкомолекулярных гетероциклов и полициклических ароматических соединений (ПАС) при пиролизе α-аминокислот». Журнал аналитического и прикладного пиролиза . 66 (1–2): 97–121. DOI : 10.1016 / S0165-2370 (02) 00108-0 .
  31. ^ Фаббри D, Adamiano A, C Торри (2010). «ГХ-МС определение полициклических ароматических углеводородов, выделяющихся при пиролизе биомассы». Anal Bioanal Chem . 397 (1): 309–17. DOI : 10.1007 / s00216-010-3563-5 . PMID 20213167 . S2CID 33835929 .  CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
  32. ^ White JL, Conner BT, Перфетти TA, Bombick BR, Авалос JT, Fowler KW, Смит CJ, Дулитл DJ (май 2001). «Влияние температуры пиролиза на мутагенность конденсата табачного дыма». Food Chem Toxicol . 39 (5): 499–505. DOI : 10.1016 / s0278-6915 (00) 00155-1 . PMID 11313117 . 
  33. ^ «Химические вещества в мясе, приготовленном при высоких температурах, и риск рака» . Национальный институт рака .
  34. ^ Хилз Н, Wiegers U, Adamietz Р (1975). «Стимуляция действия протеиназы К денатурирующими агентами: применение для выделения нуклеиновых кислот и деградации« замаскированных »белков» . Европейский журнал биохимии . 56 (1): 103–108. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1975.tb02211.x . PMID 1236799 . 
  35. ^ Кленова H, Henningsen I (1970). «Селективное устранение экзонуклеазной активности полимеразы дезоксирибонуклеиновой кислоты из Escherichia coli B путем ограниченного протеолиза» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 65 (1): 168–175. Bibcode : 1970PNAS ... 65..168K . дои : 10.1073 / pnas.65.1.168 . PMC 286206 . PMID 4905667 .  
  36. ^ Minde DP; Морис, Маделон М .; Рюдигер, Стефан Г.Д. (2012). Уверский Владимир Н (ред.). «Определение биофизической стабильности белков в лизатах с помощью анализа быстрого протеолиза, FASTpp» . PLOS ONE . 7 (10): e46147. Bibcode : 2012PLoSO ... 746147M . DOI : 10.1371 / journal.pone.0046147 . PMC 3463568 . PMID 23056252 .  
  37. ^ Вернимонт, А; Эдвардс, А (2009). Песня, Хайвэй (ред.). «Протеолиз in situ для создания кристаллов для определения структуры: обновление» . PLOS ONE . 4 (4): e5094. Bibcode : 2009PLoSO ... 4.5094W . DOI : 10.1371 / journal.pone.0005094 . PMC 2661377 . PMID 19352432 .  
  38. Кохей Ода (2012). «Новые семейства карбоксилпептидаз: серин-карбоксилпептидазы и глутаминовые пептидазы» . Журнал биохимии . 151 (1): 13–25. DOI : 10.1093 / Jb / mvr129 . PMID 22016395 . 
  39. ^ Hayes WK. 2005. Исследование биологической роли и разнообразия ядов змей. Университет Лома Линда.

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Томас Э. Крейтон (1993). Белки: структуры и молекулярные свойства (2-е изд.). WH Freeman and Company. ISBN 978-0-7167-2317-2.

Внешние ссылки [ править ]

  • Journal of Proteolysis - это журнал с открытым доступом, который представляет собой международный форум для электронной публикации всего спектра высококачественных статей и обзоров во всех областях протеолиза и протеолитических путей.
  • Протеолиз MAP от Центра протеолитических путей