Ретровирусные матричные белки являются компонентами оболочки -associated капсида из ретровирусов . Эти белки выстилают внутреннюю поверхность вирусных оболочек и связаны с вирусными мембранами. [1]
Матричные белки продуцируются как N-концевые домены полипротеинов- предшественников Gag . Полипротеина Gag направляет сборку и освобождение вирусных частиц из инфицированных клеток. Полипротеин Gag имеет три домена, необходимых для активности: N-концевой мембранно-связывающий (M) домен (который соответствует матриксному белку), который направляет Gag к плазматической мембране , домен взаимодействия (I), участвующий в агрегации Gag, и поздней сборки (L) домен, который опосредует процесс почкования . [2] Во время созревания вируса полипротеин Gag расщепляется ретровирусной протеазой на несколько соответствующих структурных белков, даваябелки матрицы (MA), капсида (CA) и нуклеокапсида (NC), а также некоторые более мелкие пептиды . Белки, производные от Gag, управляют всей сборкой и высвобождением вирусных частиц, при этом матричные белки играют ключевую роль в стабильности Gag, сборке капсида, транспорте и почковании.
Семейства белков ретровирусного матрикса [ править ]
| Gag_MA | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структура матричного белка вируса мышиного лейкоза Молони | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Условное обозначение | Gag_MA | ||||||||
| Pfam | PF01140 | ||||||||
| Клан пфам | CL0074 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000840 | ||||||||
| SCOP2 | 1 млн8 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| OPM суперсемейство | 42 | ||||||||
| Белок OPM | 1мн8 | ||||||||
| |||||||||
Хотя матричные белки разных вирусов, по-видимому, выполняют сходные функции и могут иметь сходные структурные складки, их первичные последовательности могут сильно отличаться. Типичные матричные белки ретровирусов образуют альфа - спиральную расслоение структуры . [3]
Одно семейство этих белков представляет собой матричные белки из гаммаретровирусов , таких как вирус лейкемии мышей Молони (MoMLV), вирус лейкемии кошек (FLV) и вирус саркомы кошек (FESV). [4] [5] Это семейство также включает матричные белки из нескольких эукариотических эндогенных ретровирусов , которые возникают, когда одна или несколько копий ретровирусного генома интегрируются в геном хозяина. [6]
| Retro_M | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
m-домен из полипротеина gag вируса саркомы Рауса, ЯМР, 20 структур | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Условное обозначение | Retro_M | ||||||||
| Pfam | PF02813 | ||||||||
| Клан пфам | CL0074 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR004028 | ||||||||
| SCOP2 | 1a6s / СФЕРА / СУПФАМ | ||||||||
| OPM суперсемейство | 42 | ||||||||
| Белок OPM | 1a6s | ||||||||
| |||||||||
Другое семейство представляет собой M-домен полипротеина Gag, обнаруженного в ретровирусах птиц. Он включает полипротеины Gag из нескольких эндогенных ретровирусов птиц. [7]
| Gag_p10 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
структура раствора матричного белка дикого типа m-pmv (p10) | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Условное обозначение | Gag_p10 | ||||||||
| Pfam | PF02337 | ||||||||
| Клан пфам | CL0074 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR003322 | ||||||||
| OPM суперсемейство | 44 | ||||||||
| Белок OPM | 2lpy | ||||||||
| |||||||||
Белки матрицы также являются компонентами бета-ретровирусов, таких как вирус обезьян Mason-Pfizer (MPMV) и вирус опухоли молочной железы мыши (MMTV). [8] [9] Эта запись также идентифицирует матричные белки из нескольких эукариотических эндогенных ретровирусов. [6]
| Gag_p15 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
кристаллическая структура матричного антигена вируса инфекционной анемии лошадей (eiav ma) | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Условное обозначение | Gag_p15 | ||||||||
| Pfam | PF08723 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR014834 | ||||||||
| SCOP2 | 1hek / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| OPM суперсемейство | 44 | ||||||||
| Белок OPM | 1hek | ||||||||
| |||||||||
Ссылки [ править ]
- ↑ Conte MR, Matthews S (июль 1998 г.). «Ретровирусные матричные белки: структурная перспектива». Вирусология . 246 (2): 191–8. DOI : 10.1006 / viro.1998.9206 . PMID 9657938 .
- ↑ Parent LJ, Cairns TM, Albert JA, Wilson CB, Wills JW, Craven RC (январь 2000 г.). «Дефект димеризации РНК в матриксе мутанта вируса саркомы Рауса» . J. Virol . 74 (1): 164–72. DOI : 10.1128 / jvi.74.1.164-172.2000 . PMC 111525 . PMID 10590103 .
- ^ McDonnell JM, Fushman D, Cahill С.М., Чжоу Вт, Волчий А, Уилсон СВ, Нелл ТД, Реш М. Д., Уиллс Дж, Cowburn D (июнь 1998 г.). «Структура раствора и динамика биоактивного ретровирусного М-домена вируса саркомы Рауса». J. Mol. Биол . 279 (4): 921–8. DOI : 10.1006 / jmbi.1998.1788 . PMID 9642071 .
- ^ Риффел Н, Harlos К, Iourin О, Рао Z, Kingsman А, Стюарт Д, Е Фрай (декабрь 2002 г.). «Структура атомного разрешения матричного белка вируса мышиного лейкоза Молони и его связь с другими ретровирусными матричными белками». Структура . 10 (12): 1627–36. DOI : 10.1016 / S0969-2126 (02) 00896-1 . PMID 12467570 .
- ^ Baker SJ, Козенца SC, Reddy EP (сентябрь 1998). «Роль миристоилирования v-Fgr и домена Gag в связывании мембраны и клеточной трансформации». Вирусология . 249 (1): 1–11. DOI : 10.1006 / viro.1998.9323 . PMID 9740771 .
- ^ a b Gifford R, Tristem M (май 2003 г.). «Эволюция, распространение и разнообразие эндогенных ретровирусов». Гены вирусов . 26 (3): 291–315. DOI : 10,1023 / A: 1024455415443 . PMID 12876457 . S2CID 34639116 .
- ↑ Борисенко Л (2003). «Эндогенные ретровирусы птиц». Folia Biol. (Прага) . 49 (5): 177–82. PMID 14680291 .
- ^ Stansell E, Tytler E, Walter MR, Hunter E (май 2004). «Ранняя стадия почкования вируса обезьяны Mason-Pfizer регулируется гидрофобностью ядра матричного домена Gag» . J. Virol . 78 (10): 5023–31. DOI : 10.1128 / jvi.78.10.5023-5031.2004 . PMC 400380 . PMID 15113883 .
- ^ Пун DT, Ли G, Aldovini A (март 1998). «Вклад нуклеокапсидов и белков матрикса в селективную упаковку геномной РНК вируса иммунодефицита человека типа 1» . J. Virol . 72 (3): 1983–93. DOI : 10,1128 / JVI.72.3.1983-1993.1998 . PMC 109491 . PMID 9499052 .
