Внедорожник 39H1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
3МТС

Идентификаторы

Псевдонимы

SUV39H1 , H3-K9-HMTase 1, KMT1A, MG44, SUV39H, супрессор пестроты 3-9, гомолог 1

Внешние идентификаторы

OMIM : 300254 MGI : 1099440 HomoloGene : 2388 GeneCards : SUV39H1

Расположение гена ( человек )

Chr.	Х-хромосома (человека) ^[1]

Группа	Xp11.23	Начинать	48 695 554 п.н. ^[1]
Группа	Xp11.23	Конец	48709012 п.о. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Х-хромосома (мышь) ^[2]

Группа	X A1.1 \| X 3.64 см	Начинать	8 061 171 п.н. ^[2]
Группа	X A1.1 \| X 3.64 см	Конец	8 074 760 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• метилтрансферазы активность • трансферазной активность • метилтрансфераза активность гистон • гистон метилтрансфераза активность (Н3-К9 специфическая) • S-аденозилметионин-зависимая метилтрансфераза активность • белок N-конец связывание • ион цинк связывание • хроматин связывание • транскрипция регуляторной область последовательность-специфическая ДНК связывание • ион металла связывания • GO: 0001948 связывания белка • гистонов-лизин N-метилтрансфераза активность
Сотовый компонент	• ядерная пластинка • нуклеоплазма • хромосома • гетерохроматин • конденсированная ядерная хромосома • гетерохроматин рДНК • комплекс сайленсинга хроматина • хромосома, центромерная область • ядро клетки
Биологический процесс	• клеточная дифференцировка • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • диметилирование гистона H3-K9 • ритмический процесс • негативная регуляция циркадного ритма • негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • триметилирование гистона H3-K9 • клеточное ответ на стимул повреждения ДНК • метилирование • замалчивание хроматина на рДНК • процессинг рРНК • метилирование гистонового лизина • клеточный цикл • вирусный процесс GO: 0022415 • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный ответ на гипоксию • организация хроматина
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


6839


20937

Ансамбль


ENSG00000101945


ENSMUSG00000039231

UniProt


O43463


O54864

RefSeq (мРНК)


NM_003173 NM_001282166


NM_001290716 NM_011514 NM_001358237

RefSeq (белок)


NP_001269095 NP_003164


NP_001277645 NP_035644 NP_001345166

Расположение (UCSC)

Chr X: 48,7 - 48,71 Мб

Chr X: 8.06 - 8.07 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Гистоны-лизин N-метилтрансфераза SUV39H1 представляет собой фермент , который у человека кодируется SUV39H1 геном . ^[5]

Функция [ править ]

Этот ген является членом супрессорного семейства гомологов вариегации 3-9 и кодирует белок с хромодоменом и С-концевым доменом SET. Этот ядерный белок перемещается к центромерам во время митоза и действует как гистон-метилтрансфераза, метилируя Lys-9 гистона H3. В целом, он играет жизненно важную роль в организации гетерохроматина, сегрегации хромосом и митотической прогрессии. ^[6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что SUV39H1 взаимодействует с:

CBX1 , ^[5]
CBX5 , ^[7]^[8]^[9]
DNMT3A , ^[10]
HDAC1 , ^[11]
HDAC3 , ^[11]
HDAC9 , ^[7]
Гистоновая деацетилаза 2 , ^[11]
MBD1 , ^[8]
RUNX1 , ^[12]
Белок ретинобластомы , ^[13]^[14] и
SBF1 . ^[15]

PIN1 ^[16]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000101945 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039231 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b Aagaard L, Laible G, Selenko P, Schmid M, Dorn R, Schotta G, Kuhfittig S, Wolf A, Lebersorger A, Singh PB, Reuter G, Jenuwein T (июнь 1999). «Функциональные гомологи млекопитающих модификатора PEV Su (var) 3-9 дрозофилы кодируют ассоциированные с центромерой белки, которые образуют комплекс с гетерохроматиновым компонентом М31» . EMBO J . 18 (7): 1923–38. DOI : 10.1093 / emboj / 18.7.1923 . PMC 1171278 . PMID 10202156 .
^ "Entrez Gene: SUV39H1 супрессор пестроты 3-9 гомолог 1 (Drosophila)" .
^ a b Чжан С.Л., McKinsey TA, Olson EN (октябрь 2002 г.). «Ассоциация гистоновых деацетилаз класса II с гетерохроматиновым белком 1: потенциальная роль метилирования гистонов в контроле дифференцировки мышц» . Мол. Клетка. Биол . 22 (20): 7302–12. DOI : 10.1128 / mcb.22.20.7302-7312.2002 . PMC 139799 . PMID 12242305 .
^ a b Fujita N, Watanabe S, Ichimura T, Tsuruzoe S, Shinkai Y, Tachibana M, Chiba T, Nakao M (июнь 2003 г.). «Метил-CpG-связывающий домен 1 (MBD1) взаимодействует с гетерохроматическим комплексом Suv39h1-HP1 для репрессии транскрипции на основе метилирования ДНК» . J. Biol. Chem . 278 (26): 24132–8. DOI : 10.1074 / jbc.M302283200 . PMID 12711603 .
^ Руала ДФ, Венкатесан К, Хао Т, Hirozane-Kishikawa Т, Dricot А, Ли Н, Беррис Г.Ф., Джиббонс ФО, Дрезе М, Ayivi-Guedehoussou Н, Klitgord Н, Саймон С, Boxem М, Мильштейн S, Розенберг J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S , Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
^ Фукс F, Hurd PJ, Deplus R, Kouzarides T (май 2003). «ДНК-метилтрансферазы связываются с HP1 и гистон-метилтрансферазой SUV39H1» . Nucleic Acids Res . 31 (9): 2305–12. DOI : 10.1093 / NAR / gkg332 . PMC 154218 . PMID 12711675 .
^ a b c Vaute O, Nicolas E, Vandel L, Trouche D (январь 2002 г.). «Функциональное и физическое взаимодействие между гистон-метилтрансферазой Suv39H1 и гистон-деацетилазами» . Nucleic Acids Res . 30 (2): 475–81. DOI : 10.1093 / NAR / 30.2.475 . PMC 99834 . PMID 11788710 .
^ Чакраборти S Синха KK, Сенюк V, Nucifora G (август 2003). «SUV39H1 взаимодействует с AML1 и отменяет трансактивность AML1. AML1 метилируется in vivo» . Онкоген . 22 (34): 5229–37. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206600 . PMID 12917624 .
↑ Nielsen SJ, Schneider R, Bauer UM, Bannister AJ, Morrison A, O'Carroll D, Firestein R, Cleary M, Jenuwein T, Herrera RE, Kouzarides T (август 2001). «Rb нацелен на метилирование гистона H3 и HP1 на промоторы». Природа . 412 (6846): 561–5. Bibcode : 2001Natur.412..561N . DOI : 10.1038 / 35087620 . PMID 11484059 . S2CID 4378296 .
^ Vandel л, Николас Е, Vaute О, R Феррейра, айт-Си-Али С, D Trouche (октябрь 2001 г.). «Репрессия транскрипции белком ретинобластомы за счет привлечения гистон-метилтрансферазы» . Мол. Клетка. Биол . 21 (19): 6484–94. DOI : 10.1128 / mcb.21.19.6484-6494.2001 . PMC 99795 . PMID 11533237 .
^ Firestein R, Цуй X, Huie P, Клири ML (июль 2000). «Установить зависимую от домена регуляцию подавления транскрипции и контроля роста с помощью SUV39H1, ортолога млекопитающих Drosophila Su (var) 3-9» . Мол. Клетка. Биол . 20 (13): 4900–9. DOI : 10.1128 / mcb.20.13.4900-4909.2000 . PMC 85941 . PMID 10848615 .
^ Ханал, Прем; Ким, Гарам; Лим, Сунг-Чул; Юн, Хё-Чжон; Ли, Кван Юл; Чой, Ху-Кюн; Чой, Хонг Сок (2013). «Пролилизомераза Pin1 отрицательно регулирует стабильность SUV39H1, способствуя онкогенезу при раке груди» . Журнал FASEB . 27 (11): 4606–4618. DOI : 10.1096 / fj.13-236851 . PMID 23934277 . S2CID 5259616 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Шотта Г., Эберт А., Рейтер Г. (2003). «SU (VAR) 3-9 - это консервативная ключевая функция в подавлении гетерохроматического гена». Genetica . 117 (2–3): 149–58. DOI : 10,1023 / A: 1022923508198 . PMID 12723694 . S2CID 39517859 .
Хейманс Э.М., Вурхове П.М., Бейерсберген Р.Л., ван 'т Веер Л.Дж., Бернардс Р. (1995). «E2F-5, новый член семейства E2F, который взаимодействует с p130 in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 15 (6): 3082–9. DOI : 10.1128 / mcb.15.6.3082 . PMC 230539 . PMID 7760804 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Aagaard L, Schmid M, Warburton P, Jenuwein T (2000). «Митотическое фосфорилирование SUV39H1, нового компонента активных центромер, совпадает с временным накоплением в центромерах млекопитающих». J. Cell Sci . 113 (5): 817–29. PMID 10671371 .
Мельчер М., Шмид М., Аагард Л., Селенко П., Лайбл Г., Йенувейн Т. (2000). «Структурно-функциональный анализ SUV39H1 показывает доминирующую роль в организации гетерохроматина, сегрегации хромосом и митотической прогрессии» . Мол. Клетка. Биол . 20 (10): 3728–41. DOI : 10.1128 / MCB.20.10.3728-3741.2000 . PMC 85674 . PMID 10779362 .
Файрстейн Р., Цуй Х, Хьюи П., Клири М.Л. (2000). «Установить зависимую от домена регуляцию подавления транскрипции и контроля роста с помощью SUV39H1, ортолога млекопитающих Drosophila Su (var) 3-9» . Мол. Клетка. Биол . 20 (13): 4900–9. DOI : 10.1128 / MCB.20.13.4900-4909.2000 . PMC 85941 . PMID 10848615 .
Фрейзер М.Э., Джеймс М.Н., Бриджер В.А., Володко В.Т. (2000). «Фосфорилированные и дефосфорилированные структуры сердца свиньи, GTP-специфическая сукцинил-КоА синтетаза». J. Mol. Биол . 299 (5): 1325–39. DOI : 10.1006 / jmbi.2000.3807 . PMID 10873456 .
Rea S, Eisenhaber F, O'Carroll D, Strahl BD, Sun ZW, Schmid M, Opravil S, Mechtler K, Ponting CP, Allis CD, Jenuwein T (2000). «Регуляция структуры хроматина с помощью сайт-специфичных метилтрансфераз гистона H3». Природа . 406 (6796): 593–9. Bibcode : 2000Natur.406..593R . DOI : 10.1038 / 35020506 . PMID 10949293 . S2CID 205008015 .
Lachner M, O'Carroll D, Rea S, Mechtler K, Jenuwein T (2001). «Метилирование гистона H3 лизином 9 создает сайт связывания для белков HP1». Природа . 410 (6824): 116–20. Bibcode : 2001Natur.410..116L . DOI : 10.1038 / 35065132 . PMID 11242053 . S2CID 4331863 .
Вандель Л., Труш Д. (2001). «Физическая ассоциация между CBP гистонацетилтрансферазы и гистон-метилтрансферазы» . EMBO Rep . 2 (1): 21–6. DOI : 10.1093 / embo-reports / kve002 . PMC 1083799 . PMID 11252719 .
Nielsen SJ, Schneider R, Bauer UM, Bannister AJ, Morrison A, O'Carroll D, Firestein R, Cleary M, Jenuwein T, Herrera RE, Kouzarides T (2001). «Rb нацелен на метилирование гистона H3 и HP1 на промоторы». Природа . 412 (6846): 561–5. Bibcode : 2001Natur.412..561N . DOI : 10.1038 / 35087620 . PMID 11484059 . S2CID 4378296 .
Вандель Л., Николас Е., Воте О, Феррейра Р., Айт-Си-Али С., Труш Д. (2001). «Репрессия транскрипции белком ретинобластомы за счет привлечения гистон-метилтрансферазы» . Мол. Клетка. Биол . 21 (19): 6484–94. DOI : 10.1128 / MCB.21.19.6484-6494.2001 . PMC 99795 . PMID 11533237 .
Vaute O, Nicolas E, Vandel L, Trouche D (2002). «Функциональное и физическое взаимодействие между гистон-метилтрансферазой Suv39H1 и гистон-деацетилазами» . Nucleic Acids Res . 30 (2): 475–81. DOI : 10.1093 / NAR / 30.2.475 . PMC 99834 . PMID 11788710 .
Шотта Г., Эберт А., Краусс В., Фишер А., Хоффманн Дж., Реа С., Йенувейн Т., Дорн Р., Рейтер Г. (2002). «Центральная роль SU (VAR) 3-9 дрозофилы в метилировании гистона H3-K9 и подавлении гетерохроматического гена» . EMBO J . 21 (5): 1121–31. DOI : 10.1093 / emboj / 21.5.1121 . PMC 125909 . PMID 11867540 .
Sewalt RG, Lachner M, Vargas M, Hamer KM, den Blaauwen JL, Hendrix T, Melcher M, Schweizer D, Jenuwein T, Otte AP (2002). «Избирательные взаимодействия между гомологами polycomb позвоночных и гистон-лизинметилтрансферазой SUV39H1 предполагают, что метилирование гистона H3-K9 способствует хромосомному нацеливанию белков группы Polycomb» . Мол. Клетка. Биол . 22 (15): 5539–53. DOI : 10.1128 / MCB.22.15.5539-5553.2002 . PMC 133945 . PMID 12101246 .
Чжан CL, McKinsey TA, Olson EN (2002). «Ассоциация гистоновых деацетилаз класса II с гетерохроматиновым белком 1: потенциальная роль метилирования гистонов в контроле дифференцировки мышц» . Мол. Клетка. Биол . 22 (20): 7302–12. DOI : 10.1128 / MCB.22.20.7302-7312.2002 . PMC 139799 . PMID 12242305 .
Ямамото К., Сонода М. (2003). «Самовзаимодействие гетерохроматинового белка 1 необходимо для прямого связывания с гистон-метилтрансферазой, SUV39H1». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 301 (2): 287–92. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 03021-8 . PMID 12565857 .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000101945 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039231 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10202156-5] Aagaard L, Laible G, Selenko P, Schmid M, Dorn R, Schotta G, Kuhfittig S, Wolf A, Lebersorger A, Singh PB, Reuter G, Jenuwein T (июнь 1999). «Функциональные гомологи млекопитающих модификатора PEV Su (var) 3-9 дрозофилы кодируют ассоциированные с центромерой белки, которые образуют комплекс с гетерохроматиновым компонентом М31» . EMBO J . 18 (7): 1923–38. DOI : 10.1093 / emboj / 18.7.1923 . PMC 1171278 . PMID 10202156 .

[entrez-6] "Entrez Gene: SUV39H1 супрессор пестроты 3-9 гомолог 1 (Drosophila)" .

[pmid12242305-7] Чжан С.Л., McKinsey TA, Olson EN (октябрь 2002 г.). «Ассоциация гистоновых деацетилаз класса II с гетерохроматиновым белком 1: потенциальная роль метилирования гистонов в контроле дифференцировки мышц» . Мол. Клетка. Биол . 22 (20): 7302–12. DOI : 10.1128 / mcb.22.20.7302-7312.2002 . PMC 139799 . PMID 12242305 .

[pmid12711603-8] Fujita N, Watanabe S, Ichimura T, Tsuruzoe S, Shinkai Y, Tachibana M, Chiba T, Nakao M (июнь 2003 г.). «Метил-CpG-связывающий домен 1 (MBD1) взаимодействует с гетерохроматическим комплексом Suv39h1-HP1 для репрессии транскрипции на основе метилирования ДНК» . J. Biol. Chem . 278 (26): 24132–8. DOI : 10.1074 / jbc.M302283200 . PMID 12711603 .

[pmid16189514-9] Руала ДФ, Венкатесан К, Хао Т, Hirozane-Kishikawa Т, Dricot А, Ли Н, Беррис Г.Ф., Джиббонс ФО, Дрезе М, Ayivi-Guedehoussou Н, Klitgord Н, Саймон С, Boxem М, Мильштейн S, Розенберг J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S , Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .

[pmid12711675-10] Фукс F, Hurd PJ, Deplus R, Kouzarides T (май 2003). «ДНК-метилтрансферазы связываются с HP1 и гистон-метилтрансферазой SUV39H1» . Nucleic Acids Res . 31 (9): 2305–12. DOI : 10.1093 / NAR / gkg332 . PMC 154218 . PMID 12711675 .

[pmid11788710-11] Vaute O, Nicolas E, Vandel L, Trouche D (январь 2002 г.). «Функциональное и физическое взаимодействие между гистон-метилтрансферазой Suv39H1 и гистон-деацетилазами» . Nucleic Acids Res . 30 (2): 475–81. DOI : 10.1093 / NAR / 30.2.475 . PMC 99834 . PMID 11788710 .

[pmid12917624-12] Чакраборти S Синха KK, Сенюк V, Nucifora G (август 2003). «SUV39H1 взаимодействует с AML1 и отменяет трансактивность AML1. AML1 метилируется in vivo» . Онкоген . 22 (34): 5229–37. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206600 . PMID 12917624 .

[pmid11484059-13] Nielsen SJ, Schneider R, Bauer UM, Bannister AJ, Morrison A, O'Carroll D, Firestein R, Cleary M, Jenuwein T, Herrera RE, Kouzarides T (август 2001). «Rb нацелен на метилирование гистона H3 и HP1 на промоторы». Природа . 412 (6846): 561–5. Bibcode : 2001Natur.412..561N . DOI : 10.1038 / 35087620 . PMID 11484059 . S2CID 4378296 .

[pmid11533237-14] Vandel л, Николас Е, Vaute О, R Феррейра, айт-Си-Али С, D Trouche (октябрь 2001 г.). «Репрессия транскрипции белком ретинобластомы за счет привлечения гистон-метилтрансферазы» . Мол. Клетка. Биол . 21 (19): 6484–94. DOI : 10.1128 / mcb.21.19.6484-6494.2001 . PMC 99795 . PMID 11533237 .

[pmid10848615-15] Firestein R, Цуй X, Huie P, Клири ML (июль 2000). «Установить зависимую от домена регуляцию подавления транскрипции и контроля роста с помощью SUV39H1, ортолога млекопитающих Drosophila Su (var) 3-9» . Мол. Клетка. Биол . 20 (13): 4900–9. DOI : 10.1128 / mcb.20.13.4900-4909.2000 . PMC 85941 . PMID 10848615 .

[16] Ханал, Прем; Ким, Гарам; Лим, Сунг-Чул; Юн, Хё-Чжон; Ли, Кван Юл; Чой, Ху-Кюн; Чой, Хонг Сок (2013). «Пролилизомераза Pin1 отрицательно регулирует стабильность SUV39H1, способствуя онкогенезу при раке груди» . Журнал FASEB . 27 (11): 4606–4618. DOI : 10.1096 / fj.13-236851 . PMID 23934277 . S2CID 5259616 .

[1]