Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
SYBR Зеленый I
SYBR Green I.png
Имена
Название ИЮПАК
N ', N' -диметил- N - [4 - [(E) - (3-метил- 1,3-бензотиазол- 2-илиден) метил] -1-фенилхинолин-1-иум-2-ил] - N -пропилпропан-1,3-диамин
Идентификаторы
  • 163795-75-3 проверятьY
3D модель ( JSmol )
ЧЭМБЛ
  • CN (C) CCCN (CCC) c1n (-c2ccccc2) c3ccccc3c (c1) = Cc4sc5ccccc5 [n +] 4C
Характеристики
C 32 H 37 N 4 S +
Молярная масса509,73 г / моль 
РастворимостьОбычно поставляется сольватированным в диметилсульфоксиде.
Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
☒N проверить  ( что есть   ?)проверятьY☒N
Ссылки на инфобоксы

SYBR Green I ( SG ) - асимметричный цианиновый краситель [1], используемый в молекулярной биологии в качестве красителя нуклеиновых кислот . Семейство красителей SYBR производится компанией Molecular Probes Inc. , ныне принадлежащей Thermo Fisher Scientific . SYBR Green I связывается с ДНК . Полученный комплекс ДНК-краситель лучше всего поглощает синий свет с длиной волны 497 нм (λ max = 497 нм) и излучает зеленый свет (λ max = 520 нм). Краситель предпочтительно связывается с двухцепочечной ДНК, но окрашивает одноцепочечную (ss) ДНК с меньшей эффективностью. SYBR Green также может окрашивать РНК с меньшей эффективностью, чем оцДНК.

Образец спермы сельди, окрашенный SYBR Green в кювете, освещенный синим светом в эпифлуоресцентном микроскопе . Зеленый SYBR в образце связывается с ДНК сперматозоидов и после связывания флуоресцирует, испуская зеленый свет при освещении синим светом.
Спектрограмма SYBR Green I

Использует [ редактировать ]

SYBR Green находит применение в нескольких областях биохимии и молекулярной биологии . Он используется в качестве красителя для количественного определения двунитевой ДНК в некоторых методах количественной ПЦР . [2] Он также используется для визуализации ДНК в гель-электрофорезе . Более высокие концентрации SYBR Green можно использовать для окрашивания гелей агарозы с целью визуализации присутствующей ДНК. Помимо мечения чистых нуклеиновых кислот SYBR Green также можно использовать для мечения ДНК внутри клеток для проточной цитометрии и флуоресцентной микроскопии . В этих случаях может потребоваться обработка РНКазой для уменьшения фона от РНК в клетках.

Безопасность [ править ]

SYBR Green I продается в качестве замены бромистого этидия , потенциального мутагена человека , поскольку с ним безопаснее работать и не возникает сложных проблем утилизации отходов этидия. Однако любая небольшая молекула, способная связывать ДНК с высоким сродством, является возможным канцерогеном , включая SYBR Green.

В исследовании с использованием теста Эймса , который измеряет способность химических веществ вызывать мутации, при анализе в той же концентрации не было четкой картины относительной мутагенности бромида этидия и SYBR зеленого I. [3] Бромид этидия был более мутагенным более высокие концентрации.

Подобные цианиновые красители [ править ]

  • PicoGreen (PG)
  • SYBR Сейф
  • SYBR Gold
  • Тиазол оранжевый (ТО)
  • Оксазол желтый (YO)
  • Безопасно-зеленый
  • Чай Грин

См. Также [ править ]

  • ГельЗеленый

Примечания и ссылки [ править ]

  1. ^ Молния H; Brunner H; Бернхаген Дж; Vitzthum F (2004). «Исследования интеркаляции ДНК и поверхностного связывания с помощью SYBR Green I, определение его структуры и методологические последствия» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (12): e103. DOI : 10.1093 / NAR / gnh101 . PMC  484200 . PMID  15249599 .
  2. ^ Mackay IM; Arden KE; Ниче А (март 2002 г.). «ПЦР в реальном времени в вирусологии» . Nucleic Acids Res . 30 (6): 1292–305. DOI : 10.1093 / NAR / 30.6.1292 . PMC 101343 . PMID 11884626 .  
  3. ^ Певица В.Л .; Лоулор TE; Юэ С. (февраль 1999 г.). «Сравнение мутагенности геля, окрашивающего нуклеиновую кислоту SYBR Green I, и мутагенности бромистого этидия в анализе обратной мутации сальмонелл / микросом млекопитающих (тест Эймса)». Мутационные исследования . 439 (1): 37–47. DOI : 10.1016 / s1383-5718 (98) 00172-7 . PMID 10029672 .