Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Стенотрофомонады
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Учебный класс:
Гаммапротеобактерии
Заказ:
Xanthomonadales
Семья:
Xanthomonadaceae
Род:
Стенотрофомонады

Паллерони и Брэдбери 1993
Разновидность

С. acidaminiphila
С. bentonitica [1]
С. chelatiphaga [1]
С. daejeonensis [1]
S. dokdonensis
С. ginsengisoli [1]
С. Humi [1]
С. индикатрисы [1]
S. koreensis
С. lactitubi [1 ]
S. maltophilia
S. nitritireducens
S. pavanii [1]
S. pictorum [1]
S. rhizophila
S. terrae [1]
S. tumulicola [1]

Окраска по Граму

Stenotrophomonas является родом из грамотрицательных бактерий , [2] содержащийпо меньшей мередесять видов. Основные резервуары стенотрофомонад - почва и растения. [3] Виды Stenotrophomonas варьируются от обычных почвенных организмов ( S. nitritireducens ) до условно-патогенных микроорганизмов человека ( S. maltophilia ), молекулярная таксономия этого рода все еще остается неясной. [4]

Важность [ править ]

Самый распространенный вид, S. maltophilia , очень универсален и может быть полезен для роста и здоровья растений, может использоваться в сельском хозяйстве, в биоконтроле, в стратегиях биоремедиации и фиторемедиации, а также в производстве биомолекул, имеющих экономическую ценность. [3] С другой стороны, некоторые штаммы S. maltophilia патогенны для людей с профилем множественной лекарственной устойчивости . [3] S. indologenes также может вызывать или быть частью полимикробных инфекций у людей, особенно маленьких детей. [5] Stenotrophomonas также могут быть фитопатогенными, в отличие от близкородственных родов Xylella и Xanthomonas . [3]Представители рода Stenotrophomonas играют важную экологическую роль в круговоротах азота и серы. Виды Stenotrophomonas , особенно S. maltophilia и S. rhizophila , часто встречаются вместе с растениями, такими как огурец, масличный рапс, картофель, клубника, люцерна, подсолнечник, кукуруза, рис, пшеница, различные сорняки, ива и тополь. Stenotrophomonas можно выделить из ризосферы или из внутренних тканей растения, особенно из сосудистых тканей корня и стебля. [3]

История [ править ]

Первым описанным видом был S. maltophila Хью и Рищенко в 1961 году. В то время он назывался Pseudomonas maltophilia , но позже был переведен в род Xanthomonas, прежде чем ему был придан собственный род. Название рода (от греческого «stenos», что означает «узкий», «trophus», что означает «тот, кто кормит», и «monas», что означает «единица»), было предназначено, чтобы подчеркнуть ограниченный диапазон питания бактерии. Однако несколько исследований впоследствии продемонстрировали, что этот род способен к большой метаболической универсальности и внутривидовой гетерогенности. [3] [2]

Генетика [ править ]

Доступны полные геномные последовательности изолята S. maltophilia R551‑3 и клинического изолята S. maltophilia K279a. [3] Оба штамма содержат гены, кодирующие пили типа I , которые участвуют в адгезии и ранних стадиях образования биопленок, и пили типа IV , которые участвуют в адгезии, аутоагрегации, подергивании подвижности и формировании биопленок . Консервативное распределение кластеров генов, кодирующих пили, в секвенированных геномах может указывать на сходство в стратегиях колонизации растений и животных. [3] Идентификация Stenotrophomonas spp.. проблематично, поскольку эти бактерии не проявляют активности в большинстве стандартных панелей фенотипирования на основе метаболизма. Кроме того, виды генотипически сходны, с 95,7–99,6% сходства последовательностей гена 16S рРНК. Один из генов "домашнего хозяйства" gyrB, кодирующий B-субъединицу ДНК-гиразы, успешно используется для типирования. [6] [7] Более того, сравнение последовательностей gyrB показывает, что штаммы, идентифицированные как S. maltophilia, могут представлять собой отдельные новые виды. [7]

Было обнаружено, что небольшие палиндромные элементы, которые несут тетрануклеотид GTAG на одном конце, широко распространены в геноме Stenotrophomonas maltophilia . Повторы представляют собой видоспецифичные варианты суперсемейства повторяющихся экстрагенных палиндромов (REP). Сотни генов сразу фланкируются этими повторами, и они, вероятно, функционируют как контрольные последовательности РНК за счет укладки повторов в мРНК и либо стабилизации вышележащих транскриптов, либо способствуя их деградации. [8]

Метаболизм [ править ]

Stenotrophomonas spp. могут эффективно колонизировать такие различные биотопы, как растения, люди и морская среда. Stenotrophomonas spp. метаболизируют широкий спектр органических соединений, присутствующих в ризосфере, включая фенольные соединения, содержащиеся в экссудатах корней растений. S. maltophilia может разлагать п- нитрофенол и 4-хлорфенол, полициклические ароматические углеводороды , соединения селена, бензол, толуол, этилбензол и ксенобиотики. Stenotrophomonas spp. производит гормон роста растений индол-3-уксусную кислоту (ИУК), он также может способствовать росту растений за счет фиксации азота и окисления элементарной серы, которая, в свою очередь, обеспечивает растения сульфатом. Многие S. maltophiliaштаммы обладают внутренней устойчивостью к различным тяжелым металлам. [3] Большинство изолятов S. maltophilia продуцируют противогрибковые соединения, такие как мальтофилин и ксантобакцин, или летучие органические соединения с противогрибковой активностью. Штаммы S. maltophilia обладают чрезвычайно высоким гидролитическим потенциалом; они продуцируют различные протеазы, хитиназы, глюканазы, ДНКазы, РНКазы, липазы и лакказы. [3] S. maltophilia приспособлены для поглощения железа, поскольку они продуцируют сидерофор, энтеробактин и многие TonB-зависимые рецепторы (TBDR), используемые для активного транспорта комплексов железо-сидерофор. [3]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c d e f g h i j k Parte, AC "Stenotrophomonas" . LPSN .
  2. ^ a b Паллерони Н., Брэдбери Дж. (1993). «Stenotrophomonas, новый род бактерий Xanthomonas maltophilia (Хью, 1980), Swings et al., 1983» . Int J Syst Bacteriol . 43 (3): 606–9. DOI : 10.1099 / 00207713-43-3-606 . PMID 8347518 . 
  3. ^ a b c d e f g h i j k Райан, Роберт П .; Монши, Себастьян; Кардинале, Массимилиано; Тагави, Сафийх; Кроссман, Лиза; Avison, Matthew B .; Берг, Габриэле; ван дер Лели, Даниэль; Доу, Дж. Максвелл (2009). «Универсальность и адаптация бактерий из рода Stenotrophomonas». Обзоры природы микробиологии . 7 (7): 514–525. DOI : 10.1038 / nrmicro2163 . ISSN 1740-1526 . PMID 19528958 .  
  4. ^ Hauben л, Vauterin л, Мур Е, Hoste В, Качели J (1999). «Геномное разнообразие рода Stenotrophomonas» . Int J Syst Bacteriol . 49 (4): 1749–60. DOI : 10.1099 / 00207713-49-4-1749 . PMID 10555357 . 
  5. ^ Айкач, Кубра; Озсурекчи, Ясемин; Тунцер, Озлем; Санчак, Бану; Дженгиз, Али Бюлент; Кара, Атес; Джейхан, Мехмет (2016). «Шесть случаев инфекций Chryseobacterium indologenes в 2012–2015 гг. И обзор литературы у педиатрических пациентов». Канадский журнал микробиологии . 62 (10): 812–819. DOI : 10,1139 / CJM-2015-0800 . ISSN 0008-4166 . PMID 27397741 .  
  6. ^ Coenye, Том; Ванлаэре, Эльке; ЛиПума, Джон Дж; Вандамм, Питер (2004). «Идентификация геномных групп в роде Stenotrophomonas с использованием анализа gyrB RFLP» . FEMS Иммунология и медицинская микробиология . 40 (3): 181–185. DOI : 10.1016 / S0928-8244 (03) 00307-9 . PMID 15039092 . 
  7. ^ a b Svensson-Stadler, Liselott A .; Михайлова, Сашка А .; Мур, Эдвард РБ (2012). «Межвидовая дифференциация и идентификация Stenotrophomonas с помощью анализа последовательности gyrB» . Письма о микробиологии FEMS . 327 (1): 15–24. DOI : 10.1111 / j.1574-6968.2011.02452.x . PMID 22092789 . 
  8. ^ Рокко, Франческо; Де Грегорио, Элиана; Ди Ночера, Пьер Паоло (2010). «Гигантское семейство коротких палиндромных последовательностей в Stenotrophomonas maltophilia: Stenotrophomonas maltophilia REPs» . Письма FEMS Microbiology : нет. DOI : 10.1111 / j.1574-6968.2010.02010.x .

Внешние ссылки [ править ]

  • Род Stenotrophomonas