Стивен Франк Альтшул (родился 28 февраля 1957 г.) - американский математик , разработавший алгоритмы , используемые в области биоинформатики (алгоритм Карлина-Альтшула [2] и его последователи [3] ). Альтшуль является соавтором по BLAST алгоритма , используемого для анализа последовательности из белков и нуклеотидов . [4] [5]
Стивен Альтшул | |
---|---|
Родившийся | Стивен Франк Альтшул 28 февраля 1957 г. |
Гражданство | Соединенные Штаты |
Альма-матер | Гарвардский университет (AB, математика) Массачусетский технологический институт (доктор философии, математика) |
Известен | ВЗРЫВ |
Супруг (а) | Кэролайн Кершоу Джеймс (м. 1994) |
Научная карьера | |
Поля | Биоинформатика |
Учреждения | NCBI |
Тезис | Аспекты сравнения биологической последовательности (1987) |
Докторант | Даниэль Клейтман [1] |
Веб-сайт | www |
Образование
Альтшуль закончил с отличием [6] из Гарвардского университета , где он был избран в Phi Beta Kappa в математике и имеет степень доктора философии в той же области Массачусетского технологического института . [7]
Исследовать
Его исследовательский интерес сосредоточен на алгоритмах выравнивания последовательностей, статистике сравнения последовательностей и измерении сходства последовательностей. [4] [5]
Задний план
Он сын Стефани Розмари (урожденная Вагнер) и Артура Альтшула , бывшего партнера Goldman Sachs . [8] [9] В 1994 году он женился на Кэролайн Кершоу Джеймс, дочери Кэролайн Джеймс-Приц из Цинциннати и Гарри Кейтана Джеймса из Дейтона, штат Огайо . Преподобный Лютер Д. Миллер-младший провел церемонию в епископальной церкви Святого Давида в Вашингтоне. [6]
Его сводная сестра - журналистка Серена Альтшул, известная по работе на MTV . Со стороны отца он является членом семьи Lehman .
У него есть два сына, Джеймс и Уильям Альтшул. Уильям Альтшул - бывший игрок колледжа Ultimate Вашингтонского университета в Сент-Луисе. [10]
От математики до биоинформатики
Во время учебы в университете Альтшул заинтересовался биологией. В результате он начал читать книги о ДНК. Одной из прочитанных им книг была «Двойная спираль » Ватсона. [ необходима цитата ] Кроме того, он также прошел курс эволюционной биологии. [ необходима цитата ] Альтшул также провел два лета, работая в лабораториях Университета Рокфеллера, где он помогал писать компьютерные коды для проекта рентгеновской кристаллографии. [ необходима цитата ]
Из-за своего интереса Альтшул подумывал о поступлении в аспирантуру по биологии. [ необходима цитата ] Вместо этого он решил подать заявку на участие в программах по прикладной математике в надежде найти некоторые приложения математики к биологии, над которыми можно было бы поработать.
Заметные назначения / занимаемые должности
По окончании учебы Стивен Франк Альтшул работал в отделе математических исследований Национального института диабета, болезней органов пищеварения и почек в качестве постдокторской стипендии IRTA. С 1990 года по настоящее время он работал в отделении вычислительной биологии NCBI, занимая должность старшего исследователя.
Рекомендации
- ^ Стивен Альтшуль на Математическая генеалогия
- ^ Altschul, S .; Gish, W .; Миллер, В .; Майерс, Э .; Липман, Д. (1990). «Базовый инструмент поиска местного выравнивания». Журнал молекулярной биологии . 215 (3): 403–410. DOI : 10.1016 / S0022-2836 (05) 80360-2 . PMID 2231712 .
- ^ Альтшул, С .; Мэдден, TL; Schäffer, AA; Zhang, J .; Zhang, Z .; Миллер, В .; Липман, ди-джей (1997). «Gapped BLAST и PSI-BLAST: новое поколение программ поиска по базам данных белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (17): 3389–3402. DOI : 10.1093 / NAR / 25.17.3389 . PMC 146917 . PMID 9254694 .
- ^ Б Список публикаций от Microsoft Academic
- ^ a b Стивен Ф. Альтшул на сервере библиографии DBLP
- ^ a b New York Times: "Свадьбы; Кэролайн Джеймс, Стивен Альтшул" 17 апреля 1994 г.
- ^ Альтшул, Стивен Франк (1987). Аспекты сравнения биологических последовательностей (кандидатская диссертация). Массачусетский Институт Технологий.
- ↑ Уведомление о смерти Артура Гудхарта Альтшула
- ^ https://www.nytimes.com/1956/03/18/archives/trota-announced-of-miss-wagner-to-be-wed-in-may.html
- ^ https://play.usaultimate.org/teams/events/Eventteam/?TeamId=x%2f0V5EX9wIVnzxDyk7NGO5XjowKF%2boMV0pElxx1dgY8%3d
Внешние ссылки
- highcited.com