Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Транскрипция фактор инициации TFIID субъединица 1 , также известный как инициации транскрипции фактора TFIID 250 кДа субъединицы (TAFII-250) или ТБФ-ассоциированным фактором 250 кДа (P250), представляет собой белок , который у человека кодируется TAF1 гена . [5] [6]

Функция [ править ]

Инициирование транскрипции с помощью РНК - полимеразы II требует деятельность более 70 полипептидов. Белок, который координирует эти активности, представляет собой базальный фактор транскрипции TFIID , который связывается с коровым промотором для правильного позиционирования полимеразы, служит каркасом для сборки остатка транскрипционного комплекса и действует как канал для регуляторных сигналов. TFIID состоит из TATA-связывающего белка ( TBP ) и группы эволюционно консервативных белков, известных как TBP-ассоциированные факторы или TAF. TAF могут участвовать в базальной транскрипции, служить коактиваторами., функционируют в распознавании промотора или модифицируют общие факторы транскрипции (GTF) для облегчения сборки комплекса и инициации транскрипции. Этот ген кодирует самую большую субъединицу TFIID. Эта субъединица связывается с коровыми последовательностями промотора , охватывающими сайт начала транскрипции. Он также связывается с активаторами и другими регуляторами транскрипции, и эти взаимодействия влияют на скорость инициации транскрипции. Эта субъединица содержит два независимых домена протеинкиназы на N- и C-концах, но также обладает ацетилтрансферазной активностью и может действовать как фермент, активирующий / конъюгирующий убиквитин . Для этого гена были идентифицированы два транскрипта, кодирующие разные изоформы. [5]Гистоны часто ацетилируются, чтобы открыть ДНК для транскрипции. TAF1 содержит два бромодомена, каждый из которых может связывать один из двух остатков ацетиллизина в положениях 5 и 12 в хвосте H4, чтобы стабилизировать комплекс TBP-TATA box.

Клиническое значение [ править ]

Была выявлена ​​мутация в TAF1, которая способствует фенотипу с тяжелой интеллектуальной инвалидностью (ID), характерной межъягодичной складкой и характерными чертами лица, включая широкий вздернутый нос, обвисшие щеки, наклонные вниз глазные щели, выступающие периорбитальные гребни, глубокие морщины. посаженные глаза, относительный гипертелоризм, тонкая верхняя губа, высокое арочное небо, выступающие уши с утолщенными спиралями и заостренный подбородок [7] [8] Это несинонимичное изменение TAF1, которое приводит к изолейцину (гидрофобному) к изменение треонина (полярное) на 1337-м аминокислотном остатке в белке (NP_001273003.1). Две другие мутации были зарегистрированы в TAF1 в двух семьях с умственной отсталостью, хотя дальнейшие клинические подробности не сообщались. [9]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что TAF1 взаимодействует с:

  • CSNK2A1 , [10]
  • CCND1 , [11] [12]
  • GTF2F1 , [13] [14] [15] [16]
  • RB1 , [12] [13] [17] [18]
  • TAF7 , [19]
  • TBP , [13] [20] [21] [22] и
  • UBTF . [23]

См. Также [ править ]

  • Фактор транскрипции II D


Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000147133 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031314 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Entrez: TAF1 TAF1 РНК-полимераза II, фактор, ассоциированный с ТАТА-бокс-связывающим белком (ТВР), 250 кДа» .
  6. Перейти ↑ Sekiguchi T, Yoshida MC, Sekiguchi M, Nishimoto T (апрель 1987). «Выделение человеческого гена, связанного с Х-хромосомой, необходимого для перехода от фазы G1 к фазе S клеточного цикла». Exp. Cell Res . 169 (2): 395–407. DOI : 10.1016 / 0014-4827 (87) 90200-X . PMID 3556424 . 
  7. ^ Он M, Person TN, Hebbring SJ, Гейнцен Е, Е Z, Schrodi SJ, McPherson EW, Lin SM, Peissig PL, Brilliant MH, O'Rawe J, Робисона RJ, Лион GJ, Ван K (январь 2015). «SeqHBase: набор инструментов для работы с большими данными для анализа данных секвенирования на основе семей» . Журнал медицинской генетики . 52 (4): 282–8. DOI : 10.1136 / jmedgenet-2014-102907 . PMC 4382803 . PMID 25587064 .  
  8. ^ O'Rawe JA, Wu Y, Dörfel MJ, Веревка AF, Au PY, Parboosingh JS, Moon S, M Kousi, Косма K, Smith CS, Tzetis M, Schuette JL, Хуфнагель RB, Prada CE, Martinez F, Орельяна C , Crain J, Caro-Llopis A, Oltra S, Monfort S, Jiménez-Barrón LT, Swensen J, Ellingwood S, Smith R, Fang H, Ospina S, Stegmann S, Den Hollander N, Mittelman D, Highnam G, Robison R , Yang E, Faivre L, Roubertie A, Rivière JB, Monaghan KG, Wang K, Davis EE, Katsanis N, Kalscheuer VM, Wang EH, Metcalfe K, Kleefstra T, Innes AM, Kitsiou-Tzeli S, Rosello M, Keegan CE , Lyon GJ (2015). «Вариант TAF1 связан с новым синдромом с тяжелой умственной отсталостью и характерными дисморфическими особенностями» . Американский журнал генетики человека . 97 (6): 922–932. Дои: 10.1016 / j.ajhg.2015.11.005 . PMC  4678794 . PMID  26637982 .
  9. ^ Hu H, Haas SA, Chelly J, Van Esch H, Raynaud M, de Brouwer AP, Weinert S, Froyen G, Frints SG, Laumonnier F, Zemojtel T, Love MI, Richard H, Emde AK, Bienek M, Jensen C, Hambrock M, Fischer U, Langnick C, Feldkamp M, Wissink-Lindhout W, Lebrun N, Castelnau L, Rucci J, Montjean R, Dorseuil O, Billuart P, Stuhlmann T., Shaw M, Corbett MA, Gardner A, Willis-Owen S, Tan C, Friend KL, Belet S, van Roozendaal KE, Jimenez-Pocquet M, Moizard MP, Ronce N, Sun R, O'Keeffe S, Chenna R, van Bömmel A, Göke J, Hackett A, Field M, Кристи Л., Бойл Дж., Хаан Э., Нельсон Дж., Тернер Дж., Байнам Дж., Гиллессен-Кесбах Дж., Мюллер У., Штайнбергер Д., Будни Б., Бадура-Стронка М., Латос-Беленская А., Усагер Л. Б., Виакер П., Родригес Криадо G, Bondeson ML, Annerén G, Dufke A, Cohen M, Van Maldergem L, Vincent-Delorme C, Echenne B, Simon-Bouy B, Kleefstra T, Willemsen M, Fryns JP,Devriendt K, Ullmann R, Vingron M, Wrogemann K, Wienker TF, Tzschach A, van Bokhoven H, Gecz J, Jentsch TJ, Chen W, Ropers HH, Kalscheuer VM (февраль 2015 г.).«Секвенирование X-экзома 405 неразрешенных семей выявило семь новых генов умственной отсталости» (PDF) . Молекулярная психиатрия . 21 (1): 133–48. DOI : 10.1038 / mp.2014.193 . PMC  5414091 . PMID  25644381 .
  10. Перейти ↑ Allende-Vega N, McKenzie L, Meek D (сентябрь 2008 г.). «Фактор транскрипции TAFII250 фосфорилирует кислый домен Mdm2 посредством привлечения протеинкиназы CK2». Мол. Клетка. Биохим . 316 (1-2): 99-106. DOI : 10.1007 / s11010-008-9816-3 . PMID 18548200 . 
  11. ^ Adnane Дж, Шао Z, Роббинс PD (январь 1999). «Циклин D1 связывается с TBP-ассоциированным фактором TAF (II) 250 для регулирования транскрипции, опосредованной Sp1» . Онкоген . 18 (1): 239–47. DOI : 10.1038 / sj.onc.1202297 . PMID 9926939 . 
  12. ^ a b Зигерт JL, Раштон JJ, Селлерс WR, Kaelin WG, Роббинс PD (ноябрь 2000 г.). «Циклин D1 подавляет опосредованное белком ретинобластомы ингибирование активности киназы TAFII250» . Онкоген . 19 (50): 5703–11. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203966 . PMID 11126356 . 
  13. ^ a b c Зигерт JL, Роббинс PD (январь 1999 г.). «Rb ингибирует внутреннюю киназную активность ТАТА-связывающего белка фактора TAFII250» . Мол. Клетка. Биол . 19 (1): 846–54. DOI : 10,1128 / MCB.19.1.846 . PMC 83941 . PMID 9858607 .  
  14. ^ Dikstein R, S Ruppert, Tjian R (март 1996). «TAFII250 представляет собой двухчастную протеинкиназу, которая фосфорилирует основной фактор транскрипции RAP74». Cell . 84 (5): 781–90. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (00) 81055-7 . PMID 8625415 . 
  15. ^ Ruppert S, Tjian R (ноябрь 1995). «Человеческий TAFII250 взаимодействует с RAP74: последствия для инициации РНК-полимеразы II» . Genes Dev . 9 (22): 2747–55. DOI : 10,1101 / gad.9.22.2747 . PMID 7590250 . 
  16. ^ Malik S, M Guermah, Редер RG (март 1998). «Динамическая модель функции коактиватора PC4 в транскрипции РНК-полимеразы II» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (5): 2192–7. DOI : 10.1073 / pnas.95.5.2192 . PMC 19292 . PMID 9482861 .  
  17. Перейти ↑ Shao Z, Ruppert S, Robbins PD (апрель 1995 г.). «Продукт гена восприимчивости к ретинобластоме связывается непосредственно с человеческим TATA-связывающим белком фактором TAFII250» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (8): 3115–9. DOI : 10.1073 / pnas.92.8.3115 . PMC 42115 . PMID 7724524 .  
  18. Перейти ↑ Shao Z, Siegert JL, Ruppert S, Robbins PD (июль 1997 г.). «Rb взаимодействует с TAF (II) 250 / TFIID через несколько доменов» . Онкоген . 15 (4): 385–92. DOI : 10.1038 / sj.onc.1201204 . PMID 9242374 . 
  19. ^ Gegonne A, Вайсман JD, Singer DS (октябрь 2001). «Связывание TAFII55 с TAFII250 ингибирует его ацетилтрансферазную активность» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (22): 12432–7. DOI : 10.1073 / pnas.211444798 . PMC 60071 . PMID 11592977 .  
  20. ^ Bellorini М, Ли Д. К., Dantonel JC, Zemzoumi К, Рёдер Р.Г., Тора л, Мантовани R (июнь 1997 г.). «CCAAT, связывающий взаимодействия NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, соседних с их гистоновыми укороченными мотивами для ассоциации с основными остатками TBP» . Nucleic Acids Res . 25 (11): 2174–81. DOI : 10.1093 / NAR / 25.11.2174 . PMC 146709 . PMID 9153318 .  
  21. ^ Ruppert S, Ван EH, Tjian R (март 1993). «Клонирование и экспрессия человеческого TAFII250: TBP-ассоциированный фактор, участвующий в регуляции клеточного цикла». Природа . 362 (6416): 175–9. DOI : 10.1038 / 362175a0 . PMID 7680771 . 
  22. O'Brien T, Tjian R (май 1998 г.). «Функциональный анализ N-концевого домена киназы TAFII250 человека». Мол. Cell . 1 (6): 905–11. DOI : 10.1016 / s1097-2765 (00) 80089-1 . PMID 9660973 . 
  23. Lin CY, Tuan J, Scalia P, Bui T, Comai L (декабрь 2002 г.). «Фактор регуляции клеточного цикла TAF1 стимулирует транскрипцию рибосомной ДНК путем связывания с активатором UBF». Curr. Биол . 12 (24): 2142–6. DOI : 10.1016 / s0960-9822 (02) 01389-1 . PMID 12498690 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Вассарман Д.А., Зауэр Ф. (2001). «TAF (II) 250: набор инструментов для транскрипции». J. Cell Sci . 114 (Pt 16): 2895–902. PMID  11686293 .
  • Ha I, Lane WS, Reinberg D (1991). «Клонирование человеческого гена, кодирующего общий фактор инициации транскрипции IIB». Природа . 352 (6337): 689–95. DOI : 10.1038 / 352689a0 . PMID  1876184 .
  • Секигучи Т., Нохиро Ю., Накамура Ю., Хисамото Н., Нишимото Т. (1991). «Ген CCG1 человека, необходимый для развития фазы G1, кодирует 210-килодальтонный ядерный ДНК-связывающий белок» . Мол. Клетка. Биол . 11 (6): 3317–25. DOI : 10.1128 / mcb.11.6.3317 . PMC  360184 . PMID  2038334 .
  • Секигучи Т., Мията Т., Нисимото Т. (1988). «Молекулярное клонирование кДНК гена Х-хромосомы человека (CCG1), которая дополняет чувствительные к температуре мутанты G1, tsBN462 и ts13, клеточной линии BHK» . EMBO J . 7 (6): 1683–7. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1988.tb02996.x . PMC  457153 . PMID  3169001 .
  • Секигучи Т., Ёсида М.С., Секигучи М., Нисимото Т. (1987). «Выделение человеческого гена, связанного с Х-хромосомой, необходимого для перехода от фазы G1 к фазе S клеточного цикла». Exp. Cell Res . 169 (2): 395–407. DOI : 10.1016 / 0014-4827 (87) 90200-X . PMID  3556424 .
  • Рупперт С., Тьян Р. (1995). «Человеческий TAFII250 взаимодействует с RAP74: последствия для инициации РНК-полимеразы II» . Genes Dev . 9 (22): 2747–55. DOI : 10,1101 / gad.9.22.2747 . PMID  7590250 .
  • Хисатаке К., Охта Т., Такада Р., Герма М., Хорикоши М., Накатани И., Родер Р. (1995). «Эволюционная консервация человеческих факторов, связанных с ТАТА-связывающим полипептидом TAFII31 и TAFII80, и взаимодействия TAFII80 с другими TAF и общими факторами транскрипции» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (18): 8195–9. DOI : 10.1073 / pnas.92.18.8195 . PMC  41123 . PMID  7667268 .
  • Рупперт С., Ван Э. Х., Цзянь Р. (1993). «Клонирование и экспрессия человеческого TAFII250: TBP-ассоциированный фактор, участвующий в регуляции клеточного цикла». Природа . 362 (6416): 175–9. DOI : 10.1038 / 362175a0 . PMID  7680771 .
  • Шао З., Рупперт С., Роббинс П.Д. (1995). «Продукт гена восприимчивости к ретинобластоме связывается непосредственно с человеческим TATA-связывающим белком фактором TAFII250» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (8): 3115–9. DOI : 10.1073 / pnas.92.8.3115 . PMC  42115 . PMID  7724524 .
  • ДеДжонг Дж, Бернштейн Р., Рёдер Р.Г. (1995). «Общий фактор транскрипции человека TFIIA: характеристика кДНК, кодирующей малую субъединицу, и потребность в базовой и активированной транскрипции» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (8): 3313–7. DOI : 10.1073 / pnas.92.8.3313 . PMC  42156 . PMID  7724559 .
  • Тут CJ, Chen JL, Klemm R, Tjian R (1995). «Активация транскрипции р53, опосредованная коактиваторами TAFII40 и TAFII60». Наука . 267 (5194): 100–4. DOI : 10.1126 / science.7809597 . PMID  7809597 .
  • Чжоу Кью, Шарп PA (1995). «Новый механизм и фактор регуляции Tat ВИЧ-1» . EMBO J . 14 (2): 321–8. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC  398086 . PMID  7835343 .
  • Parada CA, Юн JB, Roeder RG (1995). «Новое LBP-1-опосредованное ограничение транскрипции ВИЧ-1 на уровне элонгации in vitro» . J. Biol. Chem . 270 (5): 2274–83. DOI : 10.1074 / jbc.270.5.2274 . PMID  7836461 .
  • Жак Икс, Броу С., Лутц Й., Дэвидсон И., Шамбон П., Тора Л. (1994). «Человеческий TAFII30 присутствует в отдельном комплексе TFIID и необходим для активации транскрипции рецептором эстрогена». Cell . 79 (1): 107–17. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90404-9 . PMID  7923369 .
  • Ou SH, Гарсия-Мартинес LF, Паулссен EJ, Gaynor RB (1994). «Роль фланкирующих мотивов E-бокса в функции элемента TATA вируса иммунодефицита человека 1 типа» . J. Virol . 68 (11): 7188–99. DOI : 10,1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC  237158 . PMID  7933101 .
  • Сан X, Ма Д., Шелдон М., Йунг К., Рейнберг Д. (1994). «Восстановление активности человеческого TFIIA из рекомбинантных полипептидов: роль в TFIID-опосредованной транскрипции» . Genes Dev . 8 (19): 2336–48. DOI : 10,1101 / gad.8.19.2336 . PMID  7958900 .
  • Мец Р., Баннистер А. Дж., Сазерленд Дж. А., Хагемайер С., О'Рурк Е. К., Кук А., Браво Р., Кузаридес Т. (1994). «c-Fos-индуцированная активация промотора, содержащего ТАТА-бокс, включает прямой контакт со связывающим ТАТА-бокс белком» . Мол. Клетка. Биол . 14 (9): 6021–9. DOI : 10,1128 / MCB.14.9.6021 . PMC  359128 . PMID  8065335 .
  • Кашанчи Ф., Пирас Дж., Радонович М.Ф., Дюваль Дж. Ф., Фаттей А., Чанг С.М., Рёдер Р.Г., Брэди Дж. Н. (1994). «Прямое взаимодействие человеческого TFIID с трансактиватором ВИЧ-1 tat». Природа . 367 (6460): 295–9. DOI : 10.1038 / 367295a0 . PMID  8121496 .
  • Накашима Т, Секигучи Т, Сунамото Х, Юра К., Томода С, Го М, Кере Дж, Шлессингер Д., Нисимото Т (1994). «Структура гена CCG1 человека: взаимосвязь между экзонами / интронами и функциональным доменом / модулями белка». Джин . 141 (2): 193–200. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90570-3 . PMID  8163188 .
  • Ма Д., Ватанабе Х., Мермельштейн Ф., Адмон А., Огури К., Сан Х, Вада Т., Имаи Т., Широя Т., Рейнберг Д. (1993). «Выделение кДНК, кодирующей самую большую субъединицу TFIIA, выявляет функции, важные для активированной транскрипции» . Genes Dev . 7 (11): 2246–57. DOI : 10,1101 / gad.7.11.2246 . PMID  8224850 .

Внешние ссылки [ править ]

  • FactorBook TAF1
  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о Х-связанной дистонии-паркинсонизме
  • http://biorxiv.org/content/early/2015/01/21/014050
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P21675 (субъединица 1 фактора инициации транскрипции TFIID) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .