Инициации транскрипции фактора TFIID субъединица 2 представляет собой белок , который у человека кодируется TAF2 гена . [5] [6] [7]
TAF2 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | TAF2 , CIF150, MRT40, TAF2B, TAFII150, фактор 2, связанный с связывающим белком TATA-боксом | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 604912 MGI : 2443028 HomoloGene : 31137 GeneCards : TAF2 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 8: 119,73 - 119,83 Мб | Chr 15: 55.02 - 55.07 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Инициирование транскрипции с помощью РНК - полимеразы II требует деятельность более 70 полипептидов. Белок, координирующий эти активности, представляет собой фактор транскрипции IID (TFIID), который связывается с коровым промотором для правильного позиционирования полимеразы, служит каркасом для сборки остатка транскрипционного комплекса и действует как канал для регуляторных сигналов. TFIID состоит из TATA-связывающего белка (TBP) и группы эволюционно консервативных белков, известных как TBP-ассоциированные факторы или TAF. TAF могут участвовать в базальной транскрипции, служить коактиваторами , участвовать в распознавании промоторов или модифицировать общие факторы транскрипции (GTF) для облегчения сборки комплекса и инициации транскрипции. Этот ген кодирует одну из более крупных субъединиц TFIID, которая стабильно связана с комплексом TFIID. Он вносит свой вклад во взаимодействия на сайте инициации транскрипции и ниже него, взаимодействия, которые помогают определить ответ транскрипционного комплекса на активаторы. [7]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000064313 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037343 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Мартинес Э., Ге Х., Тао Й., Юань С.Х., Палхан В., Рёдер Р.Г. (ноябрь 1998 г.). «Новые кофакторы и TFIIA опосредуют функциональную селективность корового промотора с помощью человеческого комплекса TFIID, содержащего TAFII150» . Mol Cell Biol . 18 (11): 6571–83. DOI : 10.1128 / mcb.18.11.6571 . PMC 109242 . PMID 9774672 .
- ^ Кауфманн Дж., Аренс К., Куп Р., Смейл С. Т., Мюллер Р. (январь 1998 г.). «CIF150, человеческий кофактор для функции инициатора, зависимой от фактора транскрипции IID» . Mol Cell Biol . 18 (1): 233–9. DOI : 10.1128 / mcb.18.1.233 . PMC 121482 . PMID 9418870 .
- ^ а б «Ген Entrez: TAF2 TAF2 РНК-полимераза II, фактор, ассоциированный с ТАТА-бокс-связывающим белком (ТВР), 150 кДа» .
дальнейшее чтение
- Comai L, Zomerdijk JC, Beckmann H, et al. (1995). «Восстановление транскрипционного фактора SL1: исключительное связывание TBP субъединицами SL1 или TFIID». Наука . 266 (5193): 1966–72. DOI : 10.1126 / science.7801123 . PMID 7801123 .
- Чжоу Кью, Шарп PA (1995). «Новый механизм и фактор регуляции Tat ВИЧ-1» . EMBO J . 14 (2): 321–8. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086 . PMID 7835343 .
- Parada CA, Юн JB, Roeder RG (1995). «Новое LBP-1-опосредованное ограничение транскрипции ВИЧ-1 на уровне элонгации in vitro» . J. Biol. Chem . 270 (5): 2274–83. DOI : 10.1074 / jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 .
- Ou SH, Гарсия-Мартинес LF, Паулссен EJ, Gaynor RB (1994). «Роль фланкирующих мотивов E-бокса в функции элемента TATA вируса иммунодефицита человека 1 типа» . J. Virol . 68 (11): 7188–99. DOI : 10,1128 / JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158 . PMID 7933101 .
- Кашанчи Ф., Пирас Г., Радонович М.Ф. и др. (1994). «Прямое взаимодействие человеческого TFIID с трансактиватором ВИЧ-1 tat». Природа . 367 (6460): 295–9. Bibcode : 1994Natur.367..295K . DOI : 10.1038 / 367295a0 . PMID 8121496 . S2CID 4362048 .
- Ван З., Моррис Г.Ф., Райс А.П. и др. (1996). «Мутанты дикого типа и трансактивационные дефектные мутанты белка Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 связывают человеческий TATA-связывающий белок in vitro». J. Acquir. Иммунодефицит. Syndr. Гм. Ретровирол . 12 (2): 128–38. DOI : 10.1097 / 00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 .
- Пендерграст П.С., Моррисон Д., Танси В.П., Эрнандес Н. (1996). «Мутации в карбокси-концевом домене ТВР одинаково влияют на синтез полноразмерных и коротких транскриптов вируса иммунодефицита человека типа 1» . J. Virol . 70 (8): 5025–34. DOI : 10,1128 / JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456 . PMID 8764009 .
- Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, et al. (1996). «Взаимодействие Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 с уникальным сайтом TFIID ингибирует отрицательный кофактор Dr1 и стабилизирует комплекс TFIID-TFIIA» . J. Virol . 70 (8): 5503–10. DOI : 10,1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .
- Чжоу Кью, Шарп PA (1996). «Tat-SF1: кофактор для стимуляции удлинения транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука . 274 (5287): 605–10. Bibcode : 1996Sci ... 274..605Z . DOI : 10.1126 / science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
- Гарсиа-Мартинес Л.Ф., Иванов Д., Гейнор РБ (1997). «Ассоциация Tat с очищенными комплексами преинициации транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2» . J. Biol. Chem . 272 (11): 6951–8. DOI : 10.1074 / jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
- Мартинес Э., Кунду Т.К., Фу Дж., Родер Р.Г. (1998). «Ацетилазный комплекс SPT3-TAFII31-GCN5-L человека, отличный от фактора транскрипции IID» . J. Biol. Chem . 273 (37): 23781–5. DOI : 10.1074 / jbc.273.37.23781 . PMID 9726987 .
- Бренд М, Ямамото К., Стауб А, Тора Л. (1999). «Идентификация субъединиц комплекса, не содержащего TATA-связывающего белка, содержащего TAFII, предполагает их роль в ацетилировании нуклеосом и передаче сигнала» . J. Biol. Chem . 274 (26): 18285–9. DOI : 10.1074 / jbc.274.26.18285 . PMID 10373431 .
- Мартин Дж., Халенбек Р., Кауфман Дж. (1999). «Человеческий фактор транскрипции hTAF (II) 150 (CIF150) участвует в регуляции транскрипции клеточного цикла» . Мол. Клетка. Биол . 19 (8): 5548–56. DOI : 10.1128 / mcb.19.8.5548 . PMC 84407 . PMID 10409744 .
- Chalkley GE, Verrijzer CP (1999). «Выбор участка связывания ДНК с помощью TAF РНК-полимеразы II: комплекс TAF (II) 250-TAF (II) 150 распознает инициатор» . EMBO J . 18 (17): 4835–45. DOI : 10.1093 / emboj / 18.17.4835 . PMC 1171555 . PMID 10469661 .
- Судзуки Ю., Цунода Т., Сесе Дж. И др. (2001). «Идентификация и характеристика потенциальных промоторных областей 1031 вида генов человека» . Genome Res . 11 (5): 677–84. DOI : 10.1101 / gr.gr-1640r . PMC 311086 . PMID 11337467 .
- Бренд М., Моггс Дж. Г., Улад-Абдельгани М. и др. (2001). «Поврежденный УФ излучением ДНК-связывающий белок в комплексе TFTC связывает распознавание повреждений ДНК с ацетилированием нуклеосом» . EMBO J . 20 (12): 3187–96. DOI : 10.1093 / emboj / 20.12.3187 . PMC 150203 . PMID 11406595 .
- Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А. и др. (2001). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами связывания повреждений ДНК in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 21 (20): 6782–95. DOI : 10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856 . PMID 11564863 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Внешние ссылки
- TAF2 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q6P1X5 (субъединица 2 фактора инициации транскрипции TFIID) в PDBe-KB .