Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
TBPL1
Идентификаторы
ПсевдонимыTBPL1 , MGC: 8389, MGC: 9620, STUD, TLF, TLP, TRF2, связывающий белок TATA-бокса, как 1
Внешние идентификаторыOMIM : 605521 MGI : 1339946 HomoloGene : 3577 GeneCards : TBPL1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человека) [1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение TBPL1
Геномное расположение TBPL1
Группа6q23.2Начинать133 952 170 п.н. [1]
Конец133 990 432 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 10 (мышь)
Chr.Хромосома 10 (мышь) [2]
Хромосома 10 (мышь)
Геномное расположение TBPL1
Геномное расположение TBPL1
Группа10 | 10 A3Начинать22 703 879 п.н. [2]
Конец22 731 938 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE TBPL1 208398 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание ДНК
• ГО: коактиватор активность 0001105 транскрипции
• GO: 0001948 связывание белка
• ГО: 0000980 РНК - полимераза область связывания ДНК последовательности специфических II цис-регуляторных
• ГО: 0001077, ГО: 0001212, ГО: 0001213, ГО: 0001211, ГО : 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II
• Связывание с ДНК-последовательностью основного промотора РНК-полимеразы II • Связывание ДНК регуляторной области РНК-полимеразы III
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• связывание фактора транскрипции
Сотовый компонент• цитоплазма
• комплекс фактора транскрипции TFIIA
• ядро клетки
• комплекс фактора транскрипции TFIIIB
• комплекс регулятора транскрипции
• комплекс фактора транскрипции TFIID
Биологический процесс• дифференциация ядра сперматид
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• сборка акросомы
• процесс биосинтеза dTTP
• транскрипция, ДНК-шаблон
• сперматогенез
• ДНК-шаблонная транскрипция, инициация
• позитивная регуляция транскрипции с РНК-полимеразы II промотор
• Сборка комплекса преинициации транскрипции РНК-полимеразы III
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

9519

237336

Ансамбль

ENSG00000028839

ENSMUSG00000071359

UniProt

P62380
Q7Z6T9

P62340

RefSeq (мРНК)

NM_004865
NM_001253676

NM_011603

RefSeq (белок)

NP_001240605
NP_004856

NP_035733

Расположение (UCSC)Chr 6: 133.95 - 133.99 МбChr 10: 22,7 - 22,73 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ТАТА - блок-связывающий белок-подобный белок 1 представляет собой белок , который у человека кодируется TBPL1 гена . [5] [6] [7] [8]

Функция [ править ]

Для инициации транскрипции РНК-полимеразой II требуется активность более 70 полипептидов. Белком, который координирует эти активности, является фактор транскрипции IID (TFIID), который связывается с коровым промотором для правильного позиционирования полимеразы, служит каркасом для сборки остатка транскрипционного комплекса и действует как канал для регуляторных сигналов. TFIID состоит из TATA-связывающего белка (TBP) и группы эволюционно консервативных белков, известных как TBP-ассоциированные факторы или TAF. TAF могут участвовать в базальной транскрипции, служить коактиваторами, участвовать в распознавании промоторов или модифицировать общие факторы транскрипции (GTF) для облегчения сборки комплекса и инициации транскрипции.Этот ген кодирует белок, который выполняет ту же функцию, что и TBP, и заменяет TBP на некоторых промоторах, которые не распознаются TFIID. Это важно для спермиогенеза и, как полагают, важно для экспрессии генов, регулируемых в процессе развития.[8]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что TBPL1 взаимодействует с GTF2A1 . [9] [10]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000028839 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000071359 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Ohbayashi Т, Т Kishimoto, Макино Y, Shimada М, Nakadai Т, Т Аоки, Kawata Т, S НИВА, Тамура Т (февраль 1999 г.). «Выделение кДНК, картирование хромосом и экспрессия человеческого ТВР-подобного белка». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 255 (1): 137–42. DOI : 10.1006 / bbrc.1999.0159 . PMID 10082669 . 
  6. ^ Rabenstein MD, Чжоу S, Lis JT, Tjian R (апрель 1999). «ТАТА-бокс-связывающий белок (ТВР), фактор 2 (TRF2), третий член семейства ТВР» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (9): 4791–6. Bibcode : 1999PNAS ... 96.4791R . DOI : 10.1073 / pnas.96.9.4791 . PMC 21770 . PMID 10220372 .  
  7. ↑ Chong JA, Moran MM, Teichmann M, Kaczmarek JS, Roeder R, Clapham DE (апрель 2005 г.). «TATA-связывающий белок (TBP) -подобный фактор (TLF) является функциональным регулятором транскрипции: реципрокная регуляция генов нейрофиброматоза 1 типа и c-fos с помощью TLF / TRF2 и TBP» . Молекулярная и клеточная биология . 25 (7): 2632–43. DOI : 10.1128 / MCB.25.7.2632-2643.2005 . PMC 1061635 . PMID 15767669 .  
  8. ^ a b «Ген Энтреса: TBPL1, подобный TBP 1» .
  9. ^ Юинга Р. М., Чу Р, Р Elisma, Ли Н, Р Тейлор, Клими S, McBroom-Cerajewski л, Робинсон М. Д., О'Коннор л, Ли М, R Тейлор, Dharsee М, Хо У, Heilbut А, Мур л, Чжан С., Орнатский О., Бухман Ю.В., Этье М., Шенг Й., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж. П., Дьювель Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К, Колвилл К., Глэдвиш К., Маскат Б., Кинах Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. DOI : 10.1038 / msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .  
  10. ^ Teichmann МЫ, Ван Z, Мартинес Е, Tjernberg А, Чжан D, Фолльмер F, Хаит BT, Рёдер RG (ноябрь 1999 г.). «Человеческий фактор-2, связанный с ТАТА-связывающим белком (hTRF2), стабильно связывается с hTFIIA в клетках HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (24): 13720–5. Bibcode : 1999PNAS ... 9613720T . DOI : 10.1073 / pnas.96.24.13720 . PMC 24131 . PMID 10570139 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Охбаяси Т., Макино Ю., Тамура Т.А. (февраль 1999 г.). «Идентификация мышиного TBP-подобного белка (TLP), отдаленно связанного с фактором, связанным с TBP дрозофилы» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (3): 750–5. DOI : 10.1093 / NAR / 27.3.750 . PMC  148243 . PMID  9889269 .
  • Тейхманн М., Ван З., Мартинес Э., Тьернберг А., Чжан Д., Фоллмер Ф., Чайт Б.Т., Рёдер Р.Г. (ноябрь 1999 г.). «Человеческий фактор-2, связанный с ТАТА-связывающим белком (hTRF2), стабильно связывается с hTFIIA в клетках HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (24): 13720–5. Bibcode : 1999PNAS ... 9613720T . DOI : 10.1073 / pnas.96.24.13720 . PMC  24131 . PMID  10570139 .
  • Мартианов И., Бранкорсини С., Гансмюллер А., Парвинен М., Дэвидсон И., Сассоне-Корси П. (февраль 2002 г.). «Отличительные функции TBP и TLF / TRF2 во время сперматогенеза: потребность TLF для образования гетерохроматического хромоцентра в гаплоидных круглых сперматидах». Развитие . 129 (4): 945–55. PMID  11861477 .
  • Киффер-Квон П., Мартианов И., Дэвидсон И. (октябрь 2004 г.). «Клеточно-специфическая ядрышковая локализация фактора 2, связанного с ТВР» . Молекулярная биология клетки . 15 (10): 4356–68. DOI : 10,1091 / mbc.E04-02-0138 . PMC  519132 . PMID  15269281 .
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY , Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID  16189514 .S2CID  4427026 .
  • Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. DOI : 10.1038 / msb4100134 . PMC  1847948 . PMID  17353931 .

Внешние ссылки [ править ]

  • TBPL1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .