Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
TRIB3
Идентификаторы
ПсевдонимыTRIB3 , C20orf97, НИПК, SINK, SKIP3, TRB3, триблы псевдокиназы 3
Внешние идентификаторыOMIM : 607898 MGI : 1345675 HomoloGene : 10902 GeneCards : TRIB3
Расположение гена ( человек )
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человека) [1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение TRIB3
Геномное расположение TRIB3
Группа20p13Начинать362 835 п.н. [1]
Конец397,559 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 2 (мышь)
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Хромосома 2 (мышь)
Геномное расположение TRIB3
Геномное расположение TRIB3
Группа2 G3 | 2 74,83 смНачинать152 337 422 п.н. [2]
Конец152 344 032 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE TRIB3 218145 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• ГО: 0001106 транскрипции корепрессор активность
• убиквитин-протеин трансферазы регулятор активности
• ингибитор протеинкиназы активность
• активность киназы
• ГО: 0001948 связывание белка
• митоген-активированной протеинкиназы киназы связывания
• АТФ связывания
• протеинкиназа связывания
• убиквитин белка лигазы связывания
Сотовый компонент• цитозоль
• клеточная мембрана
• ядро клетки
Биологический процесс• негативная регуляция дифференцировки жировых клеток
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• негативная регуляция процесса биосинтеза жирных кислот
• негативная регуляция активности протеинкиназы
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция, ДНК-шаблон
• ответ на эндоплазматический стресс ретикулума
• фосфорилирование белков
• внутренний путь апоптотической передачи сигналов в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума
• положительная регуляция активности убиквитин-протеинтрансферазы
• клеточный ответ на инсулиновый стимул
• регуляция активности киназы MAP
• позитивная регуляция связывания с белками
• негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• регуляция транспорта глюкозы
• позитивная регуляция протеасомного убиквитин-зависимого белкового катаболического процесса
• апоптотический процесс
• регуляция липидного метаболического процесса
• негативная регуляция протеина передача сигналов киназы B
• регуляция аутофагии
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

57761

228775

Ансамбль

ENSG00000101255

ENSMUSG00000032715

UniProt

Q96RU7

Q8K4K2

RefSeq (мРНК)
NM_021158
NM_001301188
NM_001301190
NM_001301193
NM_001301196

NM_001301201

NM_144554
NM_175093

RefSeq (белок)
NP_001288117
NP_001288119
NP_001288122
NP_001288125
NP_001288130

NP_066981

NP_780302

Расположение (UCSC)Chr 20: 0,36 - 0,4 МбChr 2: 152.34 - 152.34 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Tribbles гомолог 3 представляет собой белок , который у человека кодируется TRIB3 гена . [5] [6] [7]

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, является предполагаемой протеинкиназой , индуцируемой фактором транскрипции NF-kappaB . Это псевдофермент, который считается негативным регулятором NF-kappaB, а также может сенсибилизировать клетки к апоптозу, индуцированному TNF и TRAIL . Кроме того, сообщалось, что этот белок отрицательно регулирует выживание клеток серин-треонинкиназой AKT1 . [7] TRIB3 недавно был связан с нейрональной передачей сигналов, и, как TRIB1 и TRIB2 , может рассматриваться как потенциальная мишень для аллостерических лекарств [8] [9]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что TRIB3 взаимодействует с:

  • АКТ1 , [5]
  • CSNK2B , [10]
  • Фибронектин [10]
  • MCM3AP , [11]
  • РЕЛА , [12]
  • SIAH1 , [10] и
  • TIAF1 . [10]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000101255 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032715 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ a b Du K, Herzig S, Kulkarni RN, Montminy M (июнь 2003 г.). «TRB3: гомолог Tribbles, который ингибирует активацию Akt / PKB инсулином в печени». Наука . 300 (5625): 1574–7. DOI : 10.1126 / science.1079817 . PMID 12791994 . S2CID 43360696 .  
  6. ^ Хегедуш Z, Czibula A, Кисс-Toth E (август 2006). «Tribbles: новые регуляторы клеточной функции; эволюционные аспекты». Cell Mol Life Sci . 63 (14): 1632–41. DOI : 10.1007 / s00018-006-6007-9 . PMID 16715410 . S2CID 24556931 .  
  7. ^ a b «Ген Entrez: TRIB3 tribbles, гомолог 3 (Drosophila)» .
  8. ^ Eyers PA, Keeshan K, Kannan N (2016). «Tribbles в 21 веке: эволюционирующие роли псевдокиназных трибблов в биологии и болезнях» . Тенденции в клеточной биологии . 27 (9): S0962-8924 (16) 30178-7. DOI : 10.1016 / j.tcb.2016.11.002 . PMC 5382568 . PMID 27908682 .  
  9. Перейти ↑ Foulkes DM, Byrne DP, Eyers PA (2015). «Псевдокиназы Tribbles: новые мишени для химической биологии и открытия лекарств?». Труды биохимического общества . 43 (5): 1095–1103. DOI : 10.1042 / BST20150109 . PMID 26517930 . 
  10. ^ а б в г Чжоу Й, Ли Л., Лю Цюй, Син Г, Куай Х, Сунь Дж, Инь Х, Ван Дж, Чжан Л., Хэ Ф (май 2008 г.). «Убиквитинлигаза E3 SIAH1 опосредует убиквитинирование и деградацию TRB3». Клетка. Сигнал . 20 (5): 942–8. DOI : 10.1016 / j.cellsig.2008.01.010 . PMID 18276110 . 
  11. ^ Bowers AJ, Скалли S, Бойлан JF (май 2003). «SKIP3, новый ортолог Drosophila tribbles, сверхэкспрессируется в опухолях человека и регулируется гипоксией» . Онкоген . 22 (18): 2823–35. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206367 . PMID 12743605 . 
  12. ↑ Wu M, Xu LG, Zhai Z, Shu HB (июль 2003 г.). «SINK представляет собой взаимодействующий с p65 негативный регулятор NF-kappaB-зависимой транскрипции» . J. Biol. Chem . 278 (29): 27072–9. DOI : 10.1074 / jbc.M209814200 . PMID 12736262 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. DOI : 10.1038 / 414865a . PMID  11780052 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Ву М., Сюй LG, Чжай З., Шу HB (2003). «SINK представляет собой взаимодействующий с p65 негативный регулятор NF-kappaB-зависимой транскрипции» . J. Biol. Chem . 278 (29): 27072–9. DOI : 10.1074 / jbc.M209814200 . PMID  12736262 .
  • Бауэрс А.Дж., Скалли С., Бойлан Дж. Ф. (2003). «SKIP3, новый ортолог Drosophila tribbles, сверхэкспрессируется в опухолях человека и регулируется гипоксией» . Онкоген . 22 (18): 2823–35. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206367 . PMID  12743605 .
  • Хуанг Дж., Тэн Л., Лю Т. и др. (2003). «Идентификация новой серин / треонинкиназы, которая ингибирует TNF-индуцированную активацию NF-kappaB и индуцированную p53 транскрипцию». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 309 (4): 774–8. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2003.08.069 . PMID  13679039 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .
  • Kiss-Toth E, Bagstaff SM, Sung HY и др. (2004). «Человеческие трибблы, семейство белков, контролирующих каскады митоген-активируемых протеинкиназ» . J. Biol. Chem . 279 (41): 42703–8. DOI : 10.1074 / jbc.M407732200 . PMID  15299019 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Охока Н., Йошии С., Хаттори Т. и др. (2005). «TRB3, новый ген, индуцируемый стрессом ER, индуцируется посредством пути ATF4-CHOP и участвует в гибели клеток» . EMBO J . 24 (6): 1243–55. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600596 . PMC  556400 . PMID  15775988 .
  • Ord D, Ord T (2005). «Характеристика активации гена NIPK (TRB3, SKIP3) человека в стрессовых условиях». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 330 (1): 210–8. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2005.02.149 . PMID  15781252 .
  • Prudente S, Hribal ML, Flex E и др. (2005). «Функциональный полиморфизм Q84R гомолога TRB3 Tribbles млекопитающих связан с инсулинорезистентностью и связанным с этим риском сердечно-сосудистых заболеваний у кавказцев из Италии» . Диабет . 54 (9): 2807–11. DOI : 10.2337 / diabetes.54.9.2807 . PMID  16123373 .
  • Шварцер Р., Дамес С., Тондера Д. и др. (2006). «TRB3 является зависимым от PI 3-киназы индикатором недостаточности питательных веществ». Клетка. Сигнал . 18 (6): 899–909. DOI : 10.1016 / j.cellsig.2005.08.002 . PMID  16129579 .
  • Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Cell . 122 (6): 957–68. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID  16169070 . S2CID  8235923 .
  • Мацусима Р., Харада Н., Вебстер Н.Дж. и др. (2006). «Влияние TRB3 на стимулируемую инсулином и питательными веществами активность киназы p70 S6 в печени» . J. Biol. Chem . 281 (40): 29719–29. DOI : 10.1074 / jbc.M511636200 . PMID  16887816 .
  • Koh HJ, Arnolds DE, Fujii N, et al. (2007). «Избирательный нокаут LKB1 в скелетных мышцах увеличивает чувствительность к инсулину, улучшает гомеостаз глюкозы и снижает TRB3» . Мол. Клетка. Биол . 26 (22): 8217–27. DOI : 10.1128 / MCB.00979-06 . PMC  1636784 . PMID  16966378 .


  • v
  • т
  • е