ТАТ-бокс - связывающий белок , как 2 представляет собой белка , который у человека кодируется TBPL2 геном . [4] Белок TBPL2 также известен как TBP-связанный фактор 3 (TRF3) и TATA-связывающий белок 2 (TBP2). Белок был независимо обнаружен в трех лабораториях как специфичный для позвоночных член семейства ТАТА-связывающего белка (ТВР). [5] [6] [7] Ортологи были идентифицированы у мышей, лягушек ( Xenopus tropicalis ) и рыб ( Danio rerio ). В то время как ген TBP встречается у всех эукариот, TBPL2 встречается только у позвоночных. [8] [9]
TBPL2 |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | TBPL2 , TBP2, TRF3, TATA-бокс-связывающий белок, такой как 2 |
---|
Внешние идентификаторы | OMIM : 608964 MGI : 2684058 HomoloGene : 133152 GeneCards : TBPL2 |
---|
Расположение гена ( человек ) |
---|
| Chr. | Хромосома 14 (человека) [1] |
---|
| Группа | 14q22.3 | Начинать | 55 413 541 п.н. [1] |
---|
Конец | 55 456 726 п.н. [1] |
---|
|
Онтология генов |
---|
Молекулярная функция | • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • Связывание ДНК с последовательностью основного промотора РНК-полимеразы II • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регулятора транскрипции РНК-полимеразы III • Связывание с фактором транскрипции
|
---|
Сотовый компонент | • цитоплазма • ядро • комплекс фактора транскрипции TFIIIB • комплекс регулятора транскрипции • комплекс фактора транскрипции TFIID
|
---|
Биологический процесс | • развитие многоклеточных организмов • негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регулирование транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • ДНК-шаблонная транскрипция, инициация • регуляция транскрипции РНК-полимеразой II • транскрипция РНК-полимеразой II • РНК сборка преинициативного комплекса полимеразы III
|
---|
Источники: Amigo / QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Разновидность | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ансамбль | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Расположение (UCSC) | Chr 14: 55.41 - 55.46 Мб | н / д |
---|
PubMed поиск | [2] | [3] |
---|
Викиданные |
Просмотр / редактирование человека | Просмотр / редактирование мыши |
|
Подобно TBP, TBPL2 может связываться с блоком TATA . Он взаимодействует с другими общими факторами транскрипции, такими как TFIIA и TFIIB, и способствует инициации транскрипции in vitro . [6] [7] Коровой домен, который опосредует это связывание с ДНК, показывает 95% идентичности между TBP и TBPL2. [9] N-концевой домен TBPL2 проявляет лишь ограниченную гомологию с доменом TBP.
Ранние сообщения ошибочно предполагали широкий паттерн экспрессии TBPL2. Однако основным местом экспрессии является ооцит, где он действует как фактор замещения ТВР. [7] [10] [11] [12] Нокаутные мыши нормальны и жизнеспособны, но самки не могут фертильны в отсутствие TBPL2 из-за дефекта фолликулогенеза. [13] TBPL2 также был идентифицирован как фактор, необходимый для репрограммирования стволовых клеток в ооциты. [14]