Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Торархеота
Научная классификация е
Домен:Архей
Королевство:Протеоархеи
Суперфилум:Асгард (археи)
Тип:" Candidatus Thorarchaeota"
Синонимы
  • Торархеота

« Candidatus Thorarchaeota », или просто Thorarchaeota , является фила в superphylum Asgard архей . Супертип Асгарда представляет собой ближайших прокариотических родственников эукариот . Поскольку существует такая тесная связь между двумя разными доменами, это является дополнительным свидетельством теории двухдоменного древа жизни, согласно которой эукариоты ответвляются от архейной области. Археи Асгарда - это одноклеточные морские микробы, которые содержат ответвления, похожие на придатки, и имеют гены, подобные эукарионам. [1] Asgard archaea superphylum состоит из Thorarchaeota,Lokiarchaeota , Odinarchaeota и Heimdallarchaeota . [2] Торархеи были впервые обнаружены в зоне перехода сульфат-метан в отложениях приливных вод. Торархеоты широко распространены в морских и пресноводных отложениях.

Открытие [ править ]

Торархеи были обнаружены путем анализа осадков устья реки Уайт-Оук в Северной Каролине . Эстуарии - это солоноватые водоемы, где встречаются пресная и морская вода, обеспечивая богатую и уникальную область питательных веществ. [3] Аспирант Техасского университета обнаружил новые характеристики торархеот, которые живут под отложениями и обладают аноксичными свойствами. Аспиранты также доказали, что археи способствуют разложению органических веществ, фиксации неорганического углерода и восстановлению серы. [4]Геномы торархеот, полученные от морских обитателей, по-видимому, обладают разнообразием метаболических путей с потенциалом разложения и поглощения белков и углеводов. [5]

Описание [ править ]

Торархеи не культивировались в лаборатории. Все, что известно о Thorarchaeota, получено в результате анализа частичных и почти полных геномов. 3029 белков были секвенированы из частичных геномов. [6] Эти геномы содержат гены, которые предполагают, что Thorarchaeota может обладать способностью разлагать органические вещества, предполагая роль в углеродном цикле и промежуточную роль в цикле серы . Гены были найдены почти полного Wood-Ljungdahl пути , но не хватало гены формиатдегидрогеназы . Это могло произойти из-за неполных геномов. Торахеи могут использовать тетрагидрометаноптериновый путь Вуда-Люнгдаля для уменьшения углекислого газа. [7]У торархей есть гены деградации и ассимиляции белков, которые включают гены клострипаина и гингипаина . У них также есть гены внеклеточных пептидаз . Эти гены могут указывать на то, что основным источником углерода для торархей являются белки и пептиды. [5] Частичные геномы, секвенированные торархеотами, также содержат гены гликолиза . У них отсутствуют гены гексокиназ , но есть гены пируваткиназ и фосфоенолпируватсинтазы . Наличие генов этих ферментов может играть роль в способности адаптироваться к различным условиям окружающей среды. Были найдены гены дляазотфиксация в большинстве образцов, содержащих частичные геномы, однако гены ферментов, катализирующих восстановление нитрита , обнаружены не были. [7] Некоторые из секвенированных частичных геномов имеют почти полные пути Кальвина-Бенсона-Бассема и, как было обнаружено, используют тип IV RuBisCO . В то время как другие типы в пределах Asgard Superphylum используют RuBisCO типов III и IV, ни у одного из них нет пути Кальвина-Бенсона-Бассема. [7]

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Неуловимые археи Асгарда, наконец, выращены в лаборатории" . Журнал Scientist Magazine® . Проверено 16 ноября 2019 .
  2. ↑ Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna; Касерес, Ева Ф .; Пила, Джимми Х .; Бэкстрём, Диса; Джузокайте, Лина; Ванкэстер, Эммельен; Зейтц, Кили У .; Анантараман, Картик; Старнавский, Петр; Kjeldsen, Kasper U .; Стотт, Мэтью Б. (январь 2017 г.). «Археи Асгарда проливают свет на происхождение эукариотической клеточной сложности» . Природа . 541 (7637): 353–358. Bibcode : 2017Natur.541..353Z . DOI : 10,1038 / природа21031 . ISSN 1476-4687 . PMID 28077874 . S2CID 4458094 .   
  3. ^ Адам, Панайотис S; Боррель, Гийом; Брошье-Армане, Селин; Грибальдо, Симонетта (ноябрь 2017 г.). «Растущее дерево архей: новые взгляды на их разнообразие, эволюцию и экологию» . Журнал ISME . 11 (11): 2407–2425. DOI : 10.1038 / ismej.2017.122 . ISSN 1751-7362 . PMC 5649171 . PMID 28777382 .   
  4. ^ "Новый тип микробов идентифицирован" . utmsi.utexas.edu . Проверено 16 ноября 2019 .
  5. ^ а б Зейтц, Кили В; Лазар, Кассандра С; Хинрикс, Кай-Уве; Теске, Андреас П.; Бейкер, Бретт Дж (июль 2016 г.). «Геномная реконструкция нового, глубоко разветвленного осадочного архейного типа с путями для ацетогенеза и восстановления серы» . Журнал ISME . 10 (7): 1696–1705. DOI : 10.1038 / ismej.2015.233 . ISSN 1751-7362 . PMC 4918440 . PMID 26824177 .   
  6. ^ "Candidatus Thorarchaeota archaeon SMTZ1-83" . www.uniprot.org . Проверено 16 ноября 2019 .
  7. ^ a b c Лю, Ян; Чжоу, Чжичао; Пан, Джи; Бейкер, Бретт Дж .; Гу, Цзи-Донг; Ли, Мэн (апрель 2018 г.). «Сравнительный геномный вывод предполагает миксотрофный образ жизни для Thorarchaeota» . Журнал ISME . 12 (4): 1021–1031. DOI : 10.1038 / s41396-018-0060-х . ISSN 1751-7370 . PMC 5864231 . PMID 29445130 .