Translatome состоит из всех мРНК фрагментов, которые переведены в один момент или состояние в одной ячейке . Обычно для получения информации о трансатоме используется техника профилирования рибосом . [1] Другими методами являются профилирование полисом, профилирование полноразмерной трансляции мРНК ( RNC-seq ) и аффинная очистка трансляций рибосом (TRAP-seq). [2]
В отличие от транскриптома , трансатом является более точным приближением для оценки уровня экспрессии некоторых генов , поскольку корреляция между протеомом и трансатомом выше, чем корреляция между транскриптомом и протеомом. [3]
Рекомендации
- ↑ King HA, Gerber AP (январь 2016 г.). «Профилирование трансатома: методы анализа трансляции мРНК в масштабе генома» . Брифинги по функциональной геномике . 15 (1): 22–31. DOI : 10.1093 / bfgp / elu045 . PMID 25380596 .
- ^ Чжао Дж., Цинь Б., Николай Р., Спан К.М., Чжан Джи (январь 2019 г.). «Трансатомика: глобальный взгляд на перевод» . Международный журнал молекулярных наук . 20 (1): 212. DOI : 10,3390 / ijms20010212 . PMC 6337585 . PMID 30626072 .
- ^ Smircich P, Eastman G, Bispo S, Duhagon MA, Guerra-Slompo EP, Garat B и др. (Июнь 2015 г.). «Профилирование рибосом показывает, что контроль трансляции является ключевым механизмом, генерирующим дифференциальную экспрессию генов у Trypanosoma cruzi» . BMC Genomics . 16 : 443. DOI : 10,1186 / s12864-015-1563-8 . PMC 4460968 . PMID 26054634 .