Zixibacteria - это тип бактерий со статусом кандидата , то есть у него не было культивируемых представителей. [1] Он является членом группы FCB [2]
Зиксибактерии | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Суперфилум: | |
Тип: | Зиксибактерии |
Зиксибактерии были предложены как бактериальный тип после извлечения генома из репрезентативного RBG-1. [1] Этот геном был восстановлен с использованием метагеномики с определенным геномом из образцов донных отложений водоносного горизонта, прилегающего к реке Колорадо (Колорадо, США), и свидетельствует о метаболической гибкости, которая предположительно необходима для жизни в быстро меняющейся среде, такой как отложения водоносного горизонта. [1]
С тех пор, как в 2013 году они были предложены в качестве филума, представители типа Zixibacteria были обнаружены во множестве других сред (иногда задним числом), включая подземные отложения (Вашингтон, США), [3] воды эстуария (Северная Каролина, США), [4 ] залежи в пещере лунного молока (Комблен-о-Пон, Бельгия) [5] и жидкости глубоких подземных трещин из золотого рудника (SD, США) [6]
Рекомендации
- ^ a b c Кастель, Синди Дж .; Hug, Laura A .; Райтон, Келли С.; Томас, Брайан Ч .; Уильямс, Кеннет Х .; У, Дунъин; Триндж, Сюзанна Дж .; Певец, Стивен У .; Eisen, Jonathan A .; Банфилд, Джиллиан Ф. (27 августа 2013 г.). «Чрезвычайное филогенетическое разнообразие и метаболическая универсальность в отложениях водоносного горизонта» . Nature Communications . 4 (1): 2120. Bibcode : 2013NatCo ... 4.2120C . DOI : 10.1038 / ncomms3120 . ISSN 2041-1723 . PMC 3903129 . PMID 23979677 .
- ^ «Таксономия - кандидат в подразделение Zixibacteria» . Сервер таксономии Uniprot . 25 мая 2018 . Дата обращения 17 мая 2020 .
- ^ Линь, Сюэджу; Кеннеди, Дэвид; Фредриксон, Джим; Бьорнстад, Брюс; Конопка, Аллан (2012). «Вертикальная стратификация состава подповерхностного микробного сообщества по геологическим образованиям на участке Хэнфорд». Экологическая микробиология . 14 (2): 414–425. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2011.02659.x . ISSN 1462-2920 . PMID 22122741 .
- ^ Бейкер, Бретт Дж .; Лазар, Кассандра Сара; Теске, Андреас П .; Дик, Грегори Дж. (13 апреля 2015 г.). «Геномное разрешение связей в круговороте углерода, азота и серы среди широко распространенных бактерий эстуарных отложений» . Микробиом . 3 (1): 14. DOI : 10,1186 / s40168-015-0077-6 . ISSN 2049-2618 . PMC 4411801 . PMID 25922666 .
- ^ Мацеевска, Марта; Калусинская, Магдалена; Корнет, Люк; Адам, Дельфина; Песси, Игорь С .; Малчере, Сандрин; Дельфосс, Филипп; Борайн, Денис; Barton, Hazel A .; Карнол, Моник; Ригали, Себастьен (21 марта 2018 г.). «Высокопроизводительный анализ секвенирования пространственного разнообразия актинобактерий в отложениях лунного молока» . Антибиотики . 7 (2): 27. DOI : 10.3390 / antibiotics7020027 . ISSN 2079-6382 . PMC 6023079 . PMID 29561792 .
- ^ Момпер, Лили; Jungbluth, Sean P .; Ли, Майкл Д .; Amend, Ян П. (октябрь 2017 г.). «Энергетический и углеродный метаболизм в микробном сообществе глубинных подземных флюидов» . Журнал ISME . 11 (10): 2319–2333. DOI : 10.1038 / ismej.2017.94 . ISSN 1751-7370 . PMC 5607374 . PMID 28644444 .