Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Потивирус
Вирусы-04-02853-g002.png
Геном вируса оспы сливы с электронной микрофотографией и моделью вирионов
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Учебный класс:Stelpaviricetes
Заказ:Пататавиралес
Семья:Potyviridae
Род:Потивирус
Типовой вид
Картофельный вирус Y
Разновидность

См. Текст

Potyvirus - это род вирусов семейства Potyviridae . Растения служат естественными хозяевами. Естьнастоящее время 183 видов в этом родевключая видовое типа Картофельный вирус Y . [1] [2] Род назван в честь типового вируса ( pot ato virus Y ). Потивирусы составляют около 30% известных в настоящее время вирусов растений. Как и бегомовирусы , представители этого рода могут вызывать значительные потери сельскохозяйственных, пастбищных, садовых и декоративных культур. Потивирусы распространяютболее 200 видов тлей, большинство из которых принадлежит к подсемейству Aphidinae (роды Macrosiphum иMyzus ).

Вирусология [ править ]

Геномная карта типичного представителя рода Potyvirus .

Вирион не покрыт гибким нитевидным нуклеокапсидом, длиной от 680 до 900 нанометров (нм) и диаметром 11–20 нм. [1] Нуклеокапсид содержит ~ 2000 копий белка капсида. Симметрия нуклеокапсида спиральная с шагом 3,4 нм.

Геном представляет собой линейную положительную смысловую оцРНК размером от 9000 до 12000 оснований / нуклеотидов. Большинство потивирусов имеют несегментированные геномы [1], хотя некоторые виды являются двудольными. Базовый состав: 21–23,51–26% G; 23–30,15–44% А; 14,9–22,41–28% С; 15,6–24,41–30,9% U. [ цитата ]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
ПотивирусНитчатыйБез оболочкиЛинейныйОдночастный

У видов с одним геномом на 5'-конце ковалентно связан белок (белок Vg). Он кодирует одну открытую рамку считывания (ORF), выраженную как предшественник полипротеина 350 кДа. Он преобразуется в семь более мелких белков: P1, вспомогательный компонент (HC), P3, цилиндрическое включение (CI), ядерное включение A (NIa), ядерное включение B (NIb), капсидный белок (CP) и два небольших предполагаемых белка, известных как 6К1 и 6К2. Цистрон P3 также кодирует второй белок - P3N-PIPO, который генерируется при сдвиге рамки считывания +2. [3]

Молекулярная биология [ править ]

Белок Р1 (~ 33 кило Дальтон (кДа) в молекулярной массе) представляет собой серин - протеазы .

HC (~ 52 кДа) - протеаза, которая также участвует в передаче инфекции от тли. В качестве протеазы он расщепляет дипептид глицин-глицин на своем собственном С-конце. Он также взаимодействует с фактором инициации эукариот 4 (eIF4). Он действует как подавитель сайленсинга вирусной РНК.

Функция P3 (~ 41 кДа) неизвестна. Он взаимодействует с большой субъединицей рибулозо-1,5-бисфосфаткарбоксилазы / оксигеназы .

CI (~ 71 кДа) представляет собой РНК- геликазу с АТФазной активностью. Он также участвует в прикреплении мембраны.

NIa (~ 50 кДа) расщепляется на протеазу (~ 27 кДа) и белок VPg (~ 22 кДа).

NIb (~ 59 кДа) представляет собой РНК-зависимую РНК-полимеразу .

Функции 6K1 (~ 6 кДа) неизвестны. Белок 6K2 (~ 6 кДа), имеющий единственный трансмембранный домен, накапливается в клеточных мембранах хозяина и, как полагают, играет роль в формировании репликационных везикул вируса.

Функция P3N-PIPO (~ 25 кДа) неизвестна, но, по-видимому, имеет важное значение. Он взаимодействует как с большими, так и с малыми субъединицами рибулозо-1,5-бисфосфаткарбоксилазы / оксигеназы.

Капсидный белок имеет вес от 30 до 35 кДа.

Белок VPg взаимодействует с эукариотическим фактором инициации 4E (eIF4E). [4] Это взаимодействие, по-видимому, важно для вирусной инфекционности.

Две протеиназы, P1 и протеиназа вспомогательного компонента (HC), катализируют только автопротеолитические реакции на своих соответствующих С-концах. Остальные реакции расщепления катализируются либо транс-протеолитическими, либо автопротеолитическими механизмами с помощью небольшого ядерного белка включения (NIa-Pro). Этот последний белок является эволюционной гомологией протеиназы пикорнавируса 3С. [ необходима цитата ]

Жизненный цикл [ править ]

Репликация и перемещение вируса мозаики сои (ВМВ) внутри клетки

Репликация может происходить в цитоплазме , [1] ядрах , хлоропластах , аппарате Гольджи , клеточных вакуолях или, реже, в необычных местах.

Потивирусы образуют белковые включения в инфицированных растительных клетках. Это могут быть кристаллы либо в цитоплазме, либо в ядре, в виде аморфных X-телец, мембранных телец, вироплазм или вертушек. Включения могут содержать или не содержать (в зависимости от вида) вирионы. Эти включения можно увидеть в световом микроскопе на полосах листьев инфицированной растительной ткани, окрашенной оранжево-зеленым (белковое окрашивание), но не лазурным A (окрашивание нуклеиновой кислотой). [5] [6] [7] Есть четыре различных типа включений потивируса. [8]

Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит за счет сдвига рамки рибосомы на -1. Вирус покидает клетку-хозяина за счет движения вируса по канальцам. Растения служат естественным хозяином. Вирус передается через переносчиков (насекомых). Пути передачи бывают векторные и механические. [1]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
ПотивирусРастенияНиктоВирусное движение; механическая инокуляцияВирусное движениеЦитоплазмаЦитоплазмаМеханическая инокуляция: тля

Эволюция [ править ]

Потивирусы возникли между 6600 и 7250 годами назад. [9] [10] Похоже, они появились на юго-западе Евразии или в Северной Африке . Расчетная скорость мутаций составляет около 1,15 × 10 -4 нуклеотидных замен / сайт / год. [ необходима цитата ]

Географическое распространение [ править ]

Сельское хозяйство было введено в Австралию в 18 веке. Это введение также включало патогены растений. В Австралии выделено тридцать восемь видов потивирусов. Восемнадцать потивирусов были обнаружены только в Австралии и считаются здесь эндемичными. Остальные двадцать, похоже, были связаны с сельским хозяйством. [ необходима цитата ]

Виды [ править ]

Потивирус содержит следующие виды: [11]

  • Вирус мозаики африканских баклажанов
  • Вирус мозаики алжирского арбуза
  • Вирус мозаики альстромерии
  • Вирус легкой мозаики альтернативантеры
  • Вирус крапчатости листьев амаранта
  • Вирус мозаики лилии амазонки
  • Вирус ангелики Y
  • Apium вирус Y
  • Вирус мозаики арауджиа
  • Вирус крапчатости арракача
  • Вирус спаржи 1
  • Вирус мозаики бананового прицветника
  • Вирус Барбасены Y
  • Вирус мозаики Basella rugose
  • Вирус мозаичного некроза фасоли
  • Вирус мозаики фасоли обыкновенной
  • Вирус желтой мозаики фасоли
  • Вирус мозаики свеклы
  • Вирус мозаики Bidens
  • Вирус крапчатости Bidens
  • Вирус синего кальмара А
  • Вирус желтой мозаики ежевики
  • Вирус мозаики бругмансии
  • Вирус крапчатости Brugmansia suaveolens
  • Вирус цветочной мозаики бабочки
  • Вирус мягкой мозаики Calanthe
  • Скрытый вирус каллы
  • Вирус крапчатости каллистефа
  • Вирус желтой полосы канны
  • Вирус крапчатости вен гвоздики
  • Вирус тонких листьев моркови
  • Морковный вирус Y
  • Вирус мозаики Catharanthus
  • Вирус мозаики сельдерея
  • Вирус мозаики Ceratobium
  • Вирус кольцевой пятнистости чили
  • Вирус крапчатости вен перца чили
  • Вирус мозаики китайского артишока
  • Вирус клитории Y
  • Вирус желтой жилки клевера
  • Вирус петушиных лапок
  • Колумбийский вирус дурмана
  • Вирус мозаики коммелины
  • Вирус мозаики коровьей тли
  • Вирус кольцевания жилок тыквы
  • Cypripedium вирус Y
  • Cyrtanthus elatus вирус А
  • Вирус мозаики Дафны
  • Вирус Дафны Y
  • Вирус мозаики Дашин
  • Вирус шкуры дурмана
  • Вирус хлоротичной мозаики Dendrobium
  • Вирус мозаики диоскореи
  • Вирус диуриса Y
  • Вирус ослиной орхидеи А
  • Вирус искажения восточноазиатской пассифлоры
  • Вирус восточноазиатской пассифлоры
  • Эндивный вирус некротической мозаики
  • Вирус кольцевой пятнистости молочай
  • Вирус мозаики фрезии
  • Фритиллярный вирус Y
  • Вирус полосатой мозаики Gloriosa
  • Вирус мозаики Gomphocarpus
  • Вирус мозаики Habenaria
  • Вирус мозаики гарденбергии
  • Вирус мозаики курицы
  • Вирус Hibbertia Y
  • Вирус мозаики гиппеаструма
  • Вирус мозаики гиацинта
  • Вирус разрыва цветка Impatiens
  • Вирус мозаики Iris fulva
  • Вирус легкой мозаики ириса
  • Ирис вирус тяжелой мозаики
  • Вирус мозаики японского ямса
  • Вирус жасмина Т
  • Вирус мозаики Johnsongrass
  • Вирус мозаики каланхоэ
  • Вирус мозаики Кеунджоронг
  • Вирус мозаики Konjac
  • Вирус желтой полосы лука-порея
  • Итальянский некротический вирус салата
  • Вирус мозаики салата
  • Вирус крапчатости лилии
  • Лили вирус Y
  • Вирус мозаики волчанки
  • Ликорис мягкий крапчатый вирус
  • Вирус карликовой мозаики кукурузы
  • Вирус очищения вен мальвы
  • Вирус Машуа Y
  • Вирус ломкости лугового шафрана
  • Средиземноморский вирус руды
  • Марокканский вирус мозаики арбуза
  • Вирус дегенерации нарцисса
  • Вирус пожелтения позднего сезона нарциссов
  • Вирус желтой полосы нарцисса
  • Вирус желтой полосы нерина
  • Вирус мозаики Nothoscordum
  • Вирус желтого карлика лука
  • Вирус мозаики Ornithogalum
  • Вирус Ornithogalum 2
  • Вирус Ornithogalum 3
  • Panax вирус Y
  • Вирус мозаики деформации листьев папайи
  • Вирус кольцевой пятнистости папайи
  • Вирус мозаичного некроза Парижа
  • Вирус мозаики пастернака
  • Вирус хлороза пассифлоры
  • Вирус деревянистости маракуйи
  • Вирус мозаики, переносимый семенами гороха
  • Вирус крапчатости арахиса
  • Вирус, связанный с мозаикой пекана
  • Вирус мозаики Pennisetum
  • Вирус крапчатости перца
  • Вирус мозаики острого перца
  • Вирус крапчатости жилок перца
  • Вирус желтой мозаики перца
  • Вирус мозаики томатов Перу
  • Вирус мозаики пфафии
  • Platycodon мягкий крапчатый вирус
  • Вирус Плейоны Y
  • Вирус оспы сливы
  • Вирус мозаики Pokeweed
  • Картофельный вирус А
  • Картофельный вирус V
  • Картофельный вирус Y
  • Вирус желтой пятнистости картофеля
  • Вирус искажения листьев ранункулюса
  • Вирус легкой мозаики ранункулюса
  • Вирус мозаики ранункулюса
  • Вирус Rhopalanthe Y
  • Скрытый вирус шафрана
  • Вирус Sarcochilus Y
  • Вирус мозаики зеленого лука
  • Вирус желтой полосы шалота
  • Вирус мозаики сорго
  • Вирус мозаики сои
  • Вирус мозаики спирантеса 3
  • Вирус суданской арбузной мозаики
  • Вирус мозаики сахарного тростника
  • Вирус хлоротичной крапчатости подсолнечника
  • Вирус мягкой мозаики подсолнечника
  • Вирус мозаики подсолнечника
  • Вирус кольцевой пятнистости подсолнечника
  • Вирус перистой крапчатости сладкого картофеля
  • Латентный вирус сладкого картофеля
  • Вирус легкой пятнистости сладкого картофеля
  • Вирус сладкого картофеля 2
  • Вирус сладкого картофеля С
  • Вирус сладкого картофеля G
  • Вирус мальформации листьев тамарилло
  • Вирус мозаики Telfairia
  • Вирус мозаики телосмы
  • Вирус рябчатой ​​мозаики Тунберга
  • Вирус травления табака
  • Вирус табачной мечети
  • Вирус мозаики полосатых жилок табака
  • Вирус пятнистости жилок табака
  • Вирус некротического трюка помидоров
  • Вирус легкой мозаики традесканции
  • Вирус легкой мозаики туберозы
  • Легкий крапчатый вирус туберозы
  • Вирус ломкости тюльпанов
  • Вирус мозаики тюльпанов
  • Вирус мозаики репы
  • Вирус хлоротической полоски витого стебля
  • Вирус мозаики Валлота
  • Вирус мозаики искажения ванили
  • Вербена вирус Y
  • Вирус крапчатости листьев арбуза
  • Вирус арбузной мозаики
  • Вирус кольцевания диких дынь
  • Бессимптомный вирус дикого лука
  • Вирус мозаики дикого картофеля
  • Вирус мозаики дикого томата
  • Вирус мозаики вен глицинии
  • Вирус мягкой мозаики ямса
  • Вирус мозаики ямса
  • Вирус мозаики ямского боба
  • Вирус легкой мозаики Зантедескии
  • Вирус мозаики Zea
  • Вирус стягивания кабачков
  • Вирус мозаики кабачка тигре
  • Вирус желтой пятнистости кабачков
  • Вирус желтой мозаики кабачков

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c d e «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года .
  2. ^ ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.» . Проверено 15 июня 2015 года .
  3. ^ Чанг, BY; Миллер, Вашингтон; Аткинс, JF; Ферт, AE (2008). «Перекрывающийся важный ген у Potyviridae» . Proc Natl Acad Sci USA . 105 (15): 5897–5902. Bibcode : 2008PNAS..105.5897C . DOI : 10.1073 / pnas.0800468105 . PMC 2311343 . PMID 18408156 .  
  4. ^ Леонар, S; Plante, D; Виттманн, S; Daigneault, N; Фортин, MG; Лалиберте, Дж. Ф. (2000). «Образование комплекса между VPg потивируса и эукариотическим фактором инициации трансляции 4E коррелирует с инфекционностью вируса» . J Virol . 74 (17): 7730–7737. DOI : 10.1128 / jvi.74.17.7730-7737.2000 . PMC 112301 . PMID 10933678 .  
  5. ^ «Материалы и методы обнаружения вирусных включений» . Университет Флориды - Институт продовольственных и сельскохозяйственных наук. Архивировано из оригинального 19 -го февраля 2012 года .
  6. ^ Christie, RG и Эдвардсон, JR (1977). Fla Agric. Exp. Stn Monog. № 9, 150 с.
  7. ^ Как вы диагностируете вирусную инфекцию на растении? Архивировано 4 августа 2012 года в Archive.today.
  8. ^ Флорида Департамент сельского хозяйства и бытовое обслуживание: вирусы Флориды растений и их включения-Potyvirus
  9. ^ Гиббс, AJ; Ohshima, K; Филлипс, MJ; Гиббс, MJ (2008). «Предыстория потивирусов: их первоначальная радиация была на заре сельского хозяйства» . PLOS ONE . 3 (6): e2523. Bibcode : 2008PLoSO ... 3.2523G . DOI : 10.1371 / journal.pone.0002523 . PMC 2429970 . PMID 18575612 .  
  10. ^ Гиббс, А; Охима, К. (2010). «Потивирусы и цифровая революция». Анну Рев Фитопатол . 48 : 205–23. DOI : 10.1146 / annurev-phyto-073009-114404 . PMID 20438367 . 
  11. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2019» (HTML) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2020 . Дата обращения 2 мая 2020 .

Библиография [ править ]

  • Уорд, CW; Шукла, ДД (1991). «Таксономия потивирусов: текущие проблемы и некоторые решения». Интервирология . 32 (5): 269–96. DOI : 10.1159 / 000150211 . PMID  1657820 .
  • Кинг, Эндрю MQ; и др., ред. (2012). « Потивирус » . Таксономия вирусов: классификация и номенклатура вирусов: девятый доклад Международного комитета по таксономии вирусов . Лондон: Academic Press. С. 926–1072. ISBN 978-0123846846. Проверено 9 декабря 2014 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Таксономия UniProt: Potyvirus
  • Вирусная зона: Потивирус
  • ICTV