Образует муниципальное образование город Барабинск со статусом городского поселения как единственный населённый пункт в его составе[3]. По традиционному административно-территориальному устройству: город областного значения[4][5].
Во время строительства Транссибирской магистрали болотистая местность вынудила проложить железную дорогу в стороне от города Каинск. В ближайшем к городу месте была построена железнодорожная станция «Каинск-Томский» (открыта в 1896), при которой возник посёлок служащих железной дороги.
Поселение быстро развивалось, и в 1911 году появился проект создания на основе пристанционного посёлка (население которого к тому моменту уже достигло 4 тысяч человек) города — «Алексеевска». На заседании губернского присутствия по крестьянским делам, состоявшемся 18 марта 1911 года, было постановлено «посёлок при станции „Каинск“ признать подлежащим обращению в безуездный город с упрощённым управлением»,[6] однако по не вполне понятным причинам изменения статуса не произошло. Лишь к концу 1916 года посёлок при станции «Каинск» стал безуездным городом Томской губернии,[7] названный «Барабинск» по расположению на Барабинской низменности.[8]
В 1920 году был издан первый номер газеты «Барабинский вестник», которая тогда называлась «Известия Барабинского революционного комитета»[9].
В 1925 году в связи с образованием Сибирского края был упразднён Каинский уезд и образован Барабинский округ. Перенос административных структур из Каинска в Барабинск привёл к значительному приросту населения: если на 1 января 1927 года население Барабинска составляло 9 757 чел., то в 1930 году в городе проживало уже 15 081 чел.
30 июня 1930 года был образован Западно-Сибирский край, а 10 августа того же года был расформирован Барабинский округ и образован Барабинский район, в состав которого вошёл и город Каинск. В 1937 году была образована Новосибирская область, и Барабинский район перешёл в её состав.