Библиотека Ягеллонского университета (польск. Biblioteka Jagiellońska) в Кракове — одна из важнейших научных библиотек Польши. Административно к ней относятся также факультетские библиотеки университета и библиотека Collegium Medicum. Библиотека имеет статус государственной.
В библиотеке хранятся, в частности, уникальные фонды по истории Украины, прежде всего времён казачества.
История библиотеки неразрывно связана с историей Ягеллонского университета, основанного в 1364 году. С XV века и вплоть до 1940 года библиотека располагалась в средневековом здании Collegium Maius на улице Святой Анны, 8. Основание библиотеки состоялось или одновременно с университетом, или на несколько лет позднее, поскольку до нас дошли свидетельства, по которым уже в 1367 году библиотеке была подарена рукопись. В 1429 году был утверждён устав библиотеки De Libraria custodienda, по которому библиотекой заведовали два куратора (custodes librariae), назначаемые из числа университетских профессоров. С XVI века была введена должность заведующего «Отец книг» (pater librorum). На конец XVII века библиотека имела более 10 000 книг. В 1774 — 77 гг. началась каталогизация фондов библиотеки, насчитывающие в то время около 32 000 наименований.
В 1900 году профессор Кароль Естрейхер (Karol Estreicher) начал вести польскую национальную библиографию "Bibliografia Polska". В этом же году на территории библиотеки был сооружён памятник одному из самых известных студентов-читателей библиотеки Николаю Копернику.
6 сентября 1939 года оккупационными властями нацистской Германии Ягеллонский университет был закрыт. 180 профессоров были интернированы и впоследствии почти все убиты. 6 ноября 1939 года библиотека также была закрыта.
В 1940 году в помещении библиотеки из фондов университетской библиотеки и многих конфискованных коллекций оккупационная власть организовала, так называемую, «Государственную Краковскую библиотеку» (нем. Staatsbibliothek Krakau).