Считается, что гаплогруппа A возникла в Азии около 50 тыс. лет назад. Её предком была гаплогруппа N.
Подгруппа A1 распространена в северной и центральной Азии, тогда как подгруппа A2 — в Сибири, а также является одной из 5 митохондриальных гаплогрупп коренного населения Америк, наряду с такими, как B, C, D и X.
Гаплогруппа A чаще всего распространена среди таких народов, как чукчи, эскимосы, на-дене, индейцы Центральной Америки. К ней же принадлежат 7,5 % японцев (в основном подгруппы A4 и A5)[25].
В пределах гаплогруппы A8a польские и бурятские гаплотипы сгруппированы вместе в подгруппу A8a1. Наличие A8a1 у поляков подтверждает гипотезу о том, что появление линий A8a в центральной Европе может отражать вероятную средневековую миграцию кочевых племён из Сибири[26].
Гаплогруппа состоит из 5 основных подклассов, которые также делятся на более мелкие подгруппы. Комплекс A5 встречается только в Корее и Японии.