Y-хромосомная гаплогруппа E1b1b1a1-M78 объединяет большую группу людей, имеющих схожие гаплотипы и происходящих от одного общего предка по прямой мужской (отцовской) линии (отец-дед-прадед и так далее). Принадлежность людей к определённой гаплогруппе не равнозначна их этнической принадлежности, а указывает лишь на общность происхождения по одной из линий (мужской или женской). Исторически все гаплогруппы «привязаны» к определённому региону, где они возникли и откуда распространялись по Земле. Родоначальники многих гаплогрупп и их ближайшее потомки связаны также и с определённой этнической или языковой средой исторического региона. Однако, связь эту проследить не всегда возможно, особенно у гаплогрупп, которые возникли в палеолите.
Y-гаплогруппа E1b1b1a1 возникла на рубеже палеолита и неолита в Северо-Восточной Африке. Этнически и лингвистически родоначальник гаплогруппы E1b1b1a1 и его ближайшие потомки связаны с афразийской общностью, с её африканской составляющей.
Гаплогруппа E1b1b1a1 наряду с гаплогруппой E1b1b1a* (V68) является частью гаплогруппы E1b1b1a (V68).
В свою очередь, E1b1b1a1 (M78) делится на субклады: E1b1b1a1* (M78), E1b1b1a1a (V12), E1b1b1a1b (V13), E1b1b1a1c (V22), E1b1b1a1d (V65) и E1b1b1a1e (M521).
Гаплогруппа E1b1b1a1 возникла 9975±1500 лет назад[источник не указан 2757 дней] на востоке современной Ливийской пустыни, которая в то время была плодородной местностью.
Гаплогруппа E1b1b1a1-М78 происходит от мутации гаплогруппы E1b1b1a, произошедшей у мужчины, жившего 20,0 тыс. лет назад. Время жизни общего предка всех живущих носителей Y-хромосомной гаплогруппы E1b1b1a1 — 13,5 тыс. лет назад (даты определены по снипам компанией YFull[1]).