Первоначальное название улицы по одной из версий связано с российским императором Александром II, по другой — с фамилией местного жителя Александрова.
В 1850 году на улице было построено исправительное арестантское отделение, а в 1856 году при нём на средства Захария Цибульского был возведён храм во имя Святого Александра Невского.
В 1886 году в Томске был заложен Городской сад (современный адрес — улица Герцена, д. 6). Инициатором создания выступил томский губернатор Герман Августович Тобизен, план сада разработал «главный томский ботаник» Порфирий Крылов. Площадь сада составила около 2 га. В 1907 году на противоположной стороне был устроен сад «Буфф».
В 1903 году в конце улицы по проекту архитектора Гута началось строительство здания Учительского института.
В 1920 году улица была переименована в Герценовскую, возможно, в связи с 50-й годовщиной смерти А. И. Герцена. Современный вариант названия встречается в различных источниках начиная с 1930 года.
д. 31 — жила семья Кошурниковых, Александр Михайлович Кошурников — инженер, занимался трассированием и проектированием железных дорог в сибирской тайге. Погиб 3 ноября 1942 года на реке Казыр при изыскании трассы от Нижнеудинска до Абакана.