Город расположен на левом берегу реки Пякупур, в 200 километрах к югу от Северного полярного круга в северо-восточной части Западно-Сибирской равнины, в лесотундровой зоне. В 16 км от города находится железнодорожная станция Пурпе на линии Тюмень — Сургут — Новый Уренгой.
Основан 22 апреля 1986 года. В 1996 году Губкинский получил статус города окружного значения. Законом от 23 апреля 2021 года, в состав города Губкинского был включён посёлок Пурпе[2].
Город как административно-территориальная единица ЯНАО имеет статус города окружного значения[3]. В рамках местного самоуправления образует одноимённое муниципальное образование со статусом городского округа как единственный населённый пункт в его составе[4].
Главой города (главой муниципального образования) является Андрей Витальевич Бандурко, председателем Городской Думы — Пескова Ольга Николаевна.
Губкинский возник как базовый центр в связи с промышленным освоением группы самых северных в Западной Сибири нефтегазовых месторождений, перспективных по запасам углеводородного сырья, отличающегося уникальными свойствами. Основной отраслью промышленности является нефтегазодобывающая. В Губкинском находится наиболее перспективное в системе НК «Роснефть» предприятие — ООО «РН-Пурнефтегаз».
Газодобывающая отрасль представлена введённым в 1993 году в промышленную эксплуатацию Комсомольским газовым промыслом ООО «Газпром добыча Ноябрьск». С введением в 1999 году Губкинского газового месторождения ЗАО «Пургаз» в муниципальном образовании «Город Губкинский» газодобывающая отрасль получила дальнейшее развитие. Переработку и осушку попутного нефтяного газа, производство газового бензина осуществляет филиал АО «СибурТюменьГаз» (Губкинский ГПЗ).