Участник союзных (1959—1991) и российских (1992—1994, 1999—2017, с 2023) первенств среди команд мастеров (профессиональных клубов).
4 августа 1923 года свой первый футбольный матч провела команда N-го дивизиона войск ГПУ. С этой игры берёт своё начало история кировского «Динамо». В 1924 году для участия в первенстве СССР по футболу и баскетболу образованы сборные команды Вятки. Первые игры, назначенные на 18 мая, не состоялись, так как в Вятку, по неизвестным причинам, не доехали команды Череповца. Следующим соперником стала команда Вологды, которых вятские футболисты разгромили 4:0.
С 1935 года команда становится сильнейшей городской командой, выиграв с 1935 по 1937 год 6 чемпионских титулов. Чемпионат тогда проводился дважды в год.
В сезоне-2007 команда заняла 5-е место, а с сезона-2008 неизменно оказывалась в нижней части итоговой турнирной таблицы. В сезонах 2015/16 и 2016/17 клуб занимал последнее место.
Сезон-2017/18 начался с поражения 14 июля 2017 года со счётом 0:3 в гостевом кубковом матче от ижевского «Делина», выступающего на региональном уровне. 18 июля, за день до старта Первенства ПФЛ сезона-2017/18, на сайте клуба появилось сообщение, в котором говорилось о снятии с соревнований ввиду отсутствия средств и переходе команды в III дивизион (а также, что на протяжении нескольких последних лет финансирование АНО «Футбольный клуб „Динамо“» осуществлялось исключительно за счёт средств бюджета МО «Город Киров»)[14], однако ни на сезон-2018, ни на сезон-2019 III дивизиона кировское «Динамо» не заявилось и вообще не участвовало в каких бы то ни было соревнованиях, в III дивизионе (зона «Золотое кольцо») город с 2017 года представлял клуб «Факел»[15], выигравший зональное первенство-2018[16], среди участников чемпионата Кировской области присутствовал ряд других кировских команд.
По результатам одной из проведённых Гострудинспекцией Кировской области проверок за III квартал 2017 года была выявлена задолженность по зарплате сотрудникам АНО «Футбольный клуб „Динамо“» на сумму более 2 млн рублей. Зарплату не выдавали 53 сотрудникам с апреля по август. Юрлицо, которое, несмотря на прекращение выступлений команды (по словам рассказавших о ситуации футболистов, летом 2017 года сотрудникам клуба, включая игроков, было предложено написать заявление об увольнении с указанием на отсутствие материальных претензий[17]), остаётся действующим[18][19] (в штате числятся два сотрудника), было привлечено к административной ответственности с необходимостью оплаты штрафа в 30 тыс. рублей[17].