Зигомико́та (лат. Zygomycota) — отдел грибов, объединяющий 10 порядков, 27 семейств, около 170 родов и более 1000 видов[1]. Отличаются развитым ценоцитным мицелием непостоянной толщины, в котором септы образуются только для отделения репродуктивных органов.
Отдел Зигомикота считается парафилетической или полифилетической группой, точное систематическое положение входящих в него видов не установлено. Деление на классы не определено; отдел делят на 10 порядков, которые условно распределяют между 4 подотделами[1][2]:
Ранее отдел разделяли на два класса Zygomycetes (собственно зигомицеты) и Trichomycetes (трихомицеты). Класс трихомицетов состоял из 4 порядков, впоследствии 2 из них (Аселлариевые и Харпелловые) были отнесены к подотделу Kickxellomycotina, а ещё два (Эккриновые (Eccrinales) и Амебидовые (Amoebidiales)) перенесены в царство простейших (Protozoa).
В 2007 году группой из 48 исследователей из США, Великобритании, Германии, Швеции, Китая и других стран предложена система грибов, из которой отдел Zygomycota исключён. Указанные выше подотделы рассматриваются как не имеющие определённого систематического положения в царстве Fungi[3].
Размножаются половым, собственно бесполым и вегетативным путём. Все стадии развития, кроме зиготы, гаплоидны.
Мицелий зигомицетов имеет два знака («+» и «−»). При контакте противоположных мицелиев (слиянии клеток на их концах — зигогамии), формируется зигота, после мейоза, дающая зачаточный мицелий со спорангием, в котором развиваются споры полового спороношения, дающие вегетативный мицелий разных знаков.