Расположено на западе Скопинского района у границы с Тульской областью в 22 км к северо-востоку от города Епифань и в 45 км к западу от Скопина. Село расположено на водоразделе между верховьев рек Прони и Сухой Таболы.
В черте села проходит линия Московская железная дорога, станция Клекотки. Имеется регулярное железнодорожное сообщение со станциями Узловая и Павелец[2].
Долгое время местность была необжитой, но являлась излюбленным местом отдыха птиц при их весенних и осенних перелётах. Весной и осенью в этих местах, обильных мелкими озёрами и болотами, шумели птичьи базары, стоял клёкот — крик крупных птиц: гусей, лебедей, журавлей. За птичий гам эту местность прозвали «клекотка́ми». По другим данным, название села произошло от названия реки Клекотки, правого притока реки Мокрая Табола[3].
Село Клекотки было основано как «военный лагерь» во времена царствования Ивана Грозного с целью укрепления южных границ Русского государства. Место было выбрано при слиянии двух родниковых ручьев, один из которых протекает вдоль лесистой низины с востока на запад, второй — от северной части села на юг, тем самым образуя угол. Эта часть села теперь называется «Углом». Важную роль при обороне села играла плотина, при помощи которой можно было поднять уровень воды. Об этих военных временах теперь напоминает название моста — Майоровский[4].
На территории села находится селище XIV—XVII веков (центральная часть села, 0,5 км к западу от центра, на левом берегу реки Клекотки). В настоящее время археологический памятник распахан под огороды, на которых нередко находят фрагменты керамики XVI—XVII веков[3].
В начале XVIII века село Клекотки Епифанского уезда Тульской губернии принадлежало князьям Голицыным и позднее было разделено между несколькими помещиками. В 1820-х годах в селе находились три усадьбы мелкопоместных дворян Авиловых, Нечаевых и Максимовых, а также одна — богатого владельца дворянского рода Страховых[3].