Костромская губернская учёная архивная комиссия — научное историческое и краеведческое общество в Российской империи.
Была пятой по счёту комиссией среди губернских архивных комиссий — после, открытых в 1884 году, Орловской, Тамбовской, Тверской и Рязанской; её официальное открытие состоялось 6 (18) июля 1885 года.
Первым председателем комиссии был избран Д. Н. Трандафилов, правителем дел — В. Г. Пирогов. На этом же собрании в докладе И. В. Миловидова были обозначены задачи созданной организации: разбор архивов местных присутственных учреждений и монастырских архивов; исследование исторических памятников, находящихся в частных руках; археологические раскопки городищ и курганов; создание при комиссии музеев древностей. Н. В. Покровский указав на неразрывную связь художественных памятников Костромы с памятниками Московской Руси XVI—XVII веков, призвал к деятельности по всесторонним исследованиям памятников архитектуры, живописи и этнографии костромского края.
Трандафилов вскоре уехал из Костромы и комиссия долгое время оставалась без руководителя; кроме того, несмотря на «попечительство» губернатора В. В. Калачова, она не имела своего постоянного помещения и денежных средств (в 1890 году министерство юстиции выделило на нужды комиссии всего 200 рублей). После избрания в марте 1891 года почётным членом и председателем комиссии Н. Н. Селифонтова, было получено постоянное помещение в Доме дворянского собрания, а губернское земство назначило ей ежегодную субсидию в 500 рублей. Для редактирования предполагаемых к изданию трудов и заключений по просмотренным архивным делам учреждений был создан особый совещательный орган — Совет комиссии в составе председателя и шести членов. С 1890 года комиссия издавала сборник «Костромская Старина». На заседании Совета 15 мая 1892 года было официально объявлено об учреждении при комиссии архива, музея и библиотеки. К 1892 году число собранных членами комиссии рукописей превысило 4 тысячи; в частности, были получены рукописи XVII—XVIII веков; к 1895 году число дел XVI-XIX веков в архиве достигло уже 7 тысячи, причём большая часть была получена из дворянских усадеб. В библиотеке к этому времени значилось до 800 томов книг, а музей располагал 400 предметами старины; кроме того, имелась нумизматическая коллекция в 2 тысячи монет. К 1901 году число дел достигло 30 тысяч; наиболее ценным поступлением был архив бывшей Большесольской посадской избы и ратуши (более 5 тыс. дел XVII — середины XVIII веков), о котором в заседании комиссии 16 сентября 1897 года было сказано следующее: «Приобретение это чрезвычайно важно в научном отношении: если бы за 12 лет своего существования ГУАК ничего существенного не сделала для истории края, то одно только спасение от гибели этого архива оправдало бы ее основание».