Полк сформирован 29 ноября 1796 года из 4-го батальона Эстляндского егерского корпуса под названием 6-го егерского батальона. 17 мая 1797 года батальон переформирован в двухбатальонный 6-й егерский полк, который затем с 31 октября 1798 года по 3 января 1800 года назывался по именам шефов.
По возвращении в Россию полк был наименован 29 марта 1801 года 5-м егерским полком и приведён 30 апреля 1802 года в состав трёх батальонов. 10 июня 1803 года из полка выделена рота на сформирование 20-го егерского полка.
5-й егерский полк с отличием принимал участие во многих войнах против Наполеона: в кампании 1799 года в Швейцарии и Италии, в 1805 году сражался в Австрии, в 1806—1807 годах в Восточной Пруссии, в Отечественной войне 1812 года и Заграничных кампаниях 1813—1814 годов. Завершил свою боевую деятельность полк участием в войне против поляков в 1831 году.
Участвовал в Бородинском сражении, где в составе 24-й пехотной дивизии отбивал одну за другой атаки французской пехоты генералов Морана и Бруссье на батарею Раевского, к концу битвы полк потерял 20 офицеров и 712 нижних чинов[1].
28 января 1833 года, при переформировании пехоты, полк в полном составе был присоединён к Псковскому пехотному полку, составив 3-й, 4-й и 6-й резервный батальоны.
6 апреля 1863 года из 4-го резервного батальона и бессрочно-отпускных был сформирован в Мариенгаузене двухбатальонный Псковский резервный пехотный полк, который 13 августа 1863 года был назван Красноярским пехотным полком и приведён в состав трёх батальонов с тремя стрелковыми ротами.