28-й розыгрыш Кубка СССР состоялся в марте-августе 1969 года. Обладателем Кубка впервые стали львовские «Карпаты» (это был первый и последний случай в розыгрыше Кубка СССР, когда его обладателем стал клуб первой лиги). Предыдущий обладатель Кубка московское «Торпедо» выбыло в 1/4 финала.
Весной 1968 года команды класса «Б» по ходу первенства начали проводить игры, относящиеся к Кубку СССР 1969 года. В зональных отборах, проводимых командами, игравшими в 1-й, 2-й, 3-й, 4-й, 5-й, 6-й и 9-й зонах, было сыграно более 100 матчей[1]. Но позднее все эти кубковые игры в зонах РСФСР были отменены, а их результаты аннулированы. Розыгрыш Кубка начался заново, и в нём команды класса «Б» участия не принимали.
Весной 1969 года в играх Кубка вначале проводились соревнования в 4 зонах, в которых выступали команды второй группы класса «А». По их итогам выявились 12 команд, которые выиграли финальные матчи в зонах. Из 87 команд второй группы класса «А» три команды — «Балтика» (Калининград), «Динамо» (Брянск) и «Металлург» (Магнитогорск) — не приняли участие в матчах на Кубок СССР. 12 команд-победительниц зональных турниров и 20 команд первой группы класса «А» составили пары 1/16 финала Кубка.
В зональных матчах 1 зоны играли команды, выступавшие в чемпионате СССР 1969 года в 1 подгруппе второй группы класса «А».
В зональных матчах 2 зоны играли команды, выступавшие в чемпионате СССР 1969 года во 2 подгруппе второй группы класса «А».
В зональных матчах 3 зоны играли команды, выступавшие в чемпионате СССР 1969 года в 3 подгруппе второй группы класса «А».