Чемпионат СССР 1969 года во второй группе класса «А» проходил в два этапа: на первом этапе 87 клубов в четырёх подгруппах (вторая подгруппа была в свою очередь разбита на две зоны, разыгравшие две стадии) определяли участников финального турнира (лучшие команды в каждой подгруппе); на втором этапе клубы в финальном турнире разыграли путёвку в первую группу.
Победитель — «Спартак» Орджоникидзе — вышел в финал турнира, ещё три клуба — ленинградское «Динамо», краснодарская «Кубань» и ивановский «Текстильщик» — остались в первой группе класса «А» (так со следующего года стала называться вторая группа), грозненский «Терек» перешёл в класс «Б», а остальные клубы перешли во вторую группу класса «А».
Турнир во второй подгруппе проходил в два этапа. На первом этапе в двух зонах по 12 клубов было разыграно право играть в финале подгруппы, на втором этапе команды разыграли места с 1-го по 12-е и с 13-го по 24-е. Победитель второго этапа — хабаровский СКА — вышел в финал первенства, ещё два клуба — казанский «Рубин» и астраханский «Волгарь» — остались в первой группе класса «А» (так со следующего года стала называться вторая группа), магнитогорский «Металлург» перешёл в класс «Б», а остальные клубы перешли во вторую группу класса «А».
Перед началом турнира за 1—12 места у команд сохранялись показатели матчей из зональной стадии только с командами, вышедшими в этот турнир.
Победитель — хабаровский СКА — вышел в финал, ещё два клуба — казанский «Рубин» и астраханский «Волгарь» (вместо команды «Металлург» Куйбышев, который был объединён с командой «Крылья Советов»[3]) — остались в первой группе класса «А» (так со следующего года стала называться вторая группа), а остальные клубы перешли во вторую группу класса «А».
Магнитогорский «Металлург» перешёл в класс «Б», а остальные клубы перешли во вторую группу класса «А».