Ку́пишкис (лит. Kupiškis, устар. рус. Купишки) — город на северо-востоке Литвы, в Паневежском уезде, центр одноимённого района.
Расположен в 44 км от уездного центра Паневежиса. По окраине города протекает река Левуо, приток Мусы; центр Купишкиса расположен на её притоке Купе, от которой и происходит название города.
Город впервые упоминается в надёжных источниках под 1529 годом, хотя вполне вероятно, что эта местность уже была заселена ранее. В 1616 году здесь была построена католическая церковь. С 1657 года город управлялся семейством Тизенгаузенов, с 1771 года — Чарторыйскими, с 1812 года — графом Михаилом Тышкевичем. Рост города в XIX веке связан со строительством железной дороги. Права города с 1791 года. В 1863 году было основано волостное училище.
В 1917 году была основана прогимназия (ныне гимназия имени Лауринаса Стуоки-Гуцявичюса). В 1919 году недалеко от города во время Советско-литовской войны произошел бой между армией Литвы и РККА. В 1935 году Купишкис стал местом дислокации 4-го пехотного полка имени короля Миндаугаса литовской армии. 14 июня 1941 года из железнодорожной станции Купишкиса были сосланы в Сибирь некоторые жители города.
В первые месяцы немецкой оккуппции было уничтожено почти всё еврейское население города. В 2004 на бывшем здании синагоги была размещена памятная доска с фамилиями 815 убитых евреев из Купишкиса. В 1944 - 1953 годах в окрестностях города действовали отряды лесных братьев. В советское время город рос. Если в 1950 году в Купишкес работали 8 магазинов и 2 закусочные, то уже в 1972 году - 68 магазинов и 15 учреждений общественного питания. В 1983 году был построен дом культуры.
В городе расположены этнографический музей, католическая церковь Тела Христова (1914) и культурный центр. С 1946 года выходит газета «Kupiškėnų mintys».