Джон II Макдональд (гэльск. Iain Mac Domhnaill; 1434—1503) — крупный шотландский феодал, граф Росс (1449—1476) и последний (4-й) лорд Островов (1449—1493), единственный сын Александра Макдональда (ум. 1449), лорда Островов, и Элизабет Сетон, дочери Александра Сетона, лорда Гордона и Хантли.
Джон Макдональд был единственным сыном Александра Макдональда (ум. 1449), 3-го лорда Островов (1423—1449) и 3-го графа Росса (1437—1449), от брака с Элизабет Сетон, дочерью Александра Сетона (ум. 1440/1441), лорда Гордона и Хантли.
В мае 1449 года после смерти своего отца Александра Макдональда Джон Макдональд унаследовал титулы лорда Островов, графа Росса и вождя клана Макдональдов.
Джон Макдональд был женат на Элизабет Ливингстон, дочери сэра Джеймса Ливингстона. В 1450 году шотландский король Яков II Стюарт, стремившийся избавиться от опеки Ливингстонов, отстранил их от всех занимаемых постов и конфисковали их владения. В 1452 году сэр Джеймс Ливингстон укрылся у своего зятя Джона Макдональда. В 1452 году Джон Макдональд, лорд Островов, поднял восстание против королевской власти и захватил замки Инвернесс, Аркарт и Рутвен[англ.].
В это же время восстание против короля поднял другой крупный шотландский магнат, Уильям Дуглас, 8-й граф Дуглас (1425—1452). Королевские войска захватили владения графа Дугласа, который в ответ объединился с Джоном Макдональдом, лордом Островов, и Александром Линдси, 4-м графом Кроуфордом, против короля. 22 февраля 1452 года в замке в Стерлинге король Яков II лично умертвил Уильяма Дугласа, графа Дугласа. Джеймс Дуглас, 9-й граф Дуглас (1426—1491), преемник своего старшего брата, продолжил борьбу против королевской власти. В 1455 году королевские войска захватили все владения графа Дугласа, который был вынужден бежать в Англию.
В 1462 году король Англии Эдуард IV отправил Джеймса Дугласа, графа Дугласа, с дипломатической миссией на Гебриды. После переговоров с графом Дугласом в замке Ардторниш Джон Макдональд отправил своих послов в Лондон. В феврале 1462 года в Лондоне был заключен Вестминстерско-Ардторнишский договор о разделе Шотландского королевства. Лорд Островов Джон Макдональд соглашался признать верховную власть английского короля Эдуарда IV, который взамен обязывался передать ему Шотландию к северу от Ферт-оф-Форта.