30 марта 1918 года постановлением Новгородского губисполкома был образован самостоятельный Маловишерский уезд, в который вошла часть Крестецкого уезда Новгородской губернии: Заозёрская (центр — станция Окуловка), Заручевская (деревня Заручевье), Каёвская (деревня Каёво), Карпиногорская (станция Бурга), Межниковская (деревня Межник), Папоротно-Островская (село Селищи), Пожарская (станция Веребье) волости (позднее число волостей в уезде менялось). Уездным центром стал посад Малая Вишера, преобразованный в 1921 году в город[1].
3 апреля 1924 года ВЦИК утвердил положение об укрупнении волостей Новгородской губернии. Согласно этому положению, в Маловишерском уезде осталось 6 волостей:
3 декабря 1926 года на территории уезда был создан национальный Дерево-Латышский сельсовет (колония Дерева, деревня Любынь Маловишерской волости[5].
1 августа 1927 года Новгородская губерния со всеми её уездами была упразднена, а территория Маловишерского уезда вошла частью в состав Новгородского, частью — в состав Боровичского округов вновь образованной Ленинградской области[6].