Мезотро́фные озёра (от др.-греч. μέσος — «средний» и τροφή — «питание») — озёра, характеризующиеся умеренным количеством растворённых в воде питательных веществ. Занимают промежуточное положение между эвтрофными и олиготрофными озёрами[1].
Водная толща мезотрофных озёр характеризуется слабой температурной стратификацией. Содержание растворённого кислорода остаётся высоким на протяжении круглого года. Вода отличается средней минерализацией при достаточно высокой прозрачности[1]. Цвет воды, как правило, зеленоватый[2].
В отдельную подгруппу иногда выделяют мезотрофные озёра с признаками олиготрофии. Для них характерны резкая температурная стратификация и повышенная прозрачность воды. Подобные водоёмы обычно отличаются бо́льшей глубиной[1].