Моско́вская духо́вная семина́рия — среднее специальное учебное заведение Русской православной церкви. Учреждено в 1814 году и располагалось в Москве, в отличие от Московской духовной академии, которая с этого времени пребывала в Троице-Сергиевой лавре. Закрыта в 1918 году, но возрождена в 1946 году.
В связи с духовным регламентом 1809 года, предписывавшим открытие духовных учебных заведений в 36 епархиях Русской православной церкви, в Московской епархии в 1814 году были открыты две семинарии (Московская и Вифанская). Первоначально Московская семинария располагалась в зданиях Перервинского монастыря[1].
В 1830-х годах государственные власти обратились к Александру Толстому с просьбой продать дворец для размещения там Московской духовной семинарии — на улице Делегатской, дом 3 (бывшая усадьба Остермана). В 1834 году была подписана купчая крепость на сумму 100 тысяч рублей. Из-за повреждения строений во время пожара 1812 года рассматривалось несколько проектов по переустройству помещений. Так, архитектор Михаил Быковский предлагал снести старые здания и возвести на их месте новые. Е. Еремеев говорил о необходимости снести хозяйственные постройки и сохранить дворец, добавив помещения с восточной и западной сторон.[источник не указан 1880 дней] Однако руководство семинарии поддержало синодального архитектора Аполлона Щедрина, по проекту которого строения оставались нетронутыми, в то время как само здание дворца должно было быть восстановлено и расширено в глубину участка.
В 1875 году по проекту архитектора Петра Баева была возведена пристройка к главному корпусу, где разместили «рекреационную залу», примыкающую к церковным помещениям. В 1885 году к восточной галерее было пристроено двухэтажное здание епархиального общежития.
После революции Московская духовная семинария была закрыта. 26 августа 1946 деятельность Московской духовной семинарии, наряду с Московской духовной академией возродилась в стенах Троице-Сергиевой лавры, но с того времени она фактически представляла собой единое целое с Московской духовной академией (у академии и семинарии была общая администрация)[2]. То есть семинария и академия были, по сути, двумя учебными программами в рамках одного учебного заведения.