2 июня 1962 года в Новочеркасске была жестоко подавлена демонстрация протеста рабочих против повышения цен (см. Новочеркасский расстрел).
В городскую черту Новочеркасска были включены в качестве микрорайонов населённые пункты: хутор Хотунок (в 1962 году), посёлки городского типа Октябрьский (в 1966 году) и Донской (в 2004 году).
Центральная часть города расположена на возвышенности, окружённой поймами степной реки Аксай и впадающей в неё реки Тузлов. В основании возвышенности лежат песчаники, сланцы, плотный известняк — ракушечник, в который на протяжении сотен лет попадала вода, образуя подземные скрытые пустоты[4].
Река Тузлов разделяет город на две части. Восточнее расположен район посёлка Донского. Территория Новочеркасска граничит с Октябрьским и Аксайским сельскими районами.
Преимуществом географического положения города является близость к крупнейшим промышленным и торговым центрам региона: Ростов-на-Дону расположен в 25 км, Шахты — в 25 км, Аксай — в 23 км, Новошахтинск — в 47 км, Батайск — в 53 км.
Новочеркасск расположен в умеренно континентальной зоне климата. Характерно сочетание избытка тепла с недостатком влаги летом и короткой и не суровой зимой (-4 °C, коэффициент увлажнения — 0,75).