Исток и устье реки находятся в Эстонии, на возвышенности Сакала в уезде Валгамаа, центральное течение — на территории Латвии. Вытекает из озера Кадастику[эст.] (в 5,5 км к югу от деревни Кооркюла), в верхнем течении около 2,5 км протекает по границе между Эстонией и Латвией, затем 16 км по территории Латвии, протекает через города Валга и Валка с юго-запада на северо-восток и впадает в реку Вяйке-Эмайыги между деревнями Тыллисте и Соору[3][4].
Длина реки — 24 км, с ответвлениями 29,6 км[5][6] (по устаревшим данным 31 км[4][7]), площадь водосбора 229 км²[4][7], из которых 143,2 км² в Эстонии[5][6] (по устаревшим данным 151 км²[3][7]).
Главные притоки: ручьи Рийзупи (эст. Riisupi, латыш. Rīzupi, протяжённость 10 км), Раутина (эст. Rautina, 10 км) и Мяннику (эст. Männiku, 8 км)[4]. Всего в Педели впадает 29 притоков общей длиной 114 км[1]. На водосборе находятся 20 озёр общей площадью 0,88 км²[1].
На участке города Валга река в основном имеет ширину 7—8 м (иногда 10 м), глубину около 1 м и слабое течение. Берега реки мелкие, заболоченные, в основном открытые. В предустьевой части русло извилистое, шириной 10 м и глубиной 1,5 м. Левый берег реки высокий, песчаный, правый — пологий. Русло реки покрыто илистым песком[3].
Эстонские природоохранные территории и объекты в бассейне реки: заповедник Кооркюла; местообитание кабанов Ниху[6].