Площадь — 30,6 км² (четвёртая по Псковской области), максимальная глубина — 2,4 м, средняя — 1,6 м. В результате проведения торфодобычи и строительства сети мелиоративных каналов озеро за последние 50 лет сильно заилилось, глубина уменьшилась почти в 2 раза[2]. По устаревшим данным соответственно 31,6 км², 5,3 м, 1,5 м[5]. Площадь водосборного бассейна — 660 км²[1].
Дно озера выровненное, песчано-каменистое, местами заиленное. Берега низкие, заболоченные, береговая линия изрезана слабо. По гидрохимическим характеристикам озеро можно считать полигумозным мягководным водоёмом. Вода бедна железом и кальцием[5].
Лещёво-судачье озеро. Единственное озеро в Псковской области, где обитает чехонь[8]. Массовые виды рыб: лещ, плотва, судак, щука, окунь, сом, уклея, краснопёрка, густера, язь, синец, чехонь, ёрш, линь, золотой карась, налим, вьюн, щиповка, голавль, елец, голец, единично также широкопалый рак[2].
Памятник природы регионального значения с 29 января 1976 года по 10 декабря 2007 года, и с 23 июля 2009 года по настоящее время[5]. Граничит с территорией Полистовского заповедника[9].
На берегу озера Полисто находятся деревни Шипово (нежилая, на запад)[10], Веряжа[11] и Полисто (нежилые, на юг от озера)[10], Ручьи (на востоке)[10] и Чилец (нежилая, на востоке)[10].